genome.fa.s14.2.7.7.80.10.50.1000.668.html

Tandem Repeats Finder Program written by:

Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          769   770   

This is table  668  of  770  ( 92376 repeats found )

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Table Explanation

Indices	Period Size	Copy Number	Consensus Size	Percent Matches	Percent Indels	Score	A	C	G	T	Entropy (0-2)
209999139--209999175	12	3.1	12	92	0	56	62	0	27	10	1.28
210002585--210002681	30	3.2	30	75	8	99	27	27	16	27	1.97
210004865--210005067	43	4.8	43	91	6	344	24	18	34	22	1.96
210011094--210011205	57	2.0	57	89	0	170	29	0	23	46	1.58
210011106--210011218	9	12.2	9	79	5	118	30	0	21	46	1.57
210011094--210011218	57	2.2	57	86	0	169	30	0	21	47	1.57
210011262--210012172	240	3.8	241	98	0	1727	32	13	18	35	1.90
210011262--210012172	481	1.9	481	97	0	1725	32	13	18	35	1.90
210012217--210012267	10	5.4	10	75	13	54	35	17	0	47	1.48
210012210--210012263	27	2.0	27	100	0	108	40	14	0	44	1.46
210012311--210012359	23	2.1	23	92	7	82	36	16	14	32	1.89
210015821--210015874	19	2.8	19	91	0	90	22	24	29	24	1.99
210015892--210015943	19	2.7	20	81	6	61	30	3	38	26	1.74
210016902--210016945	15	3.0	14	90	6	61	31	2	20	45	1.64
210017115--210017170	29	1.9	29	92	0	94	19	8	35	35	1.83
210017694--210017910	81	2.7	81	82	5	260	23	21	19	35	1.96
210017694--210017910	41	5.4	39	81	7	197	23	21	19	35	1.96
210024930--210025075	40	3.7	40	76	12	138	26	25	26	21	1.99
210024967--210025096	40	3.2	40	79	2	145	24	23	27	23	2.00
210024929--210025096	80	2.1	80	80	4	187	26	24	26	22	2.00
210032917--210033067	40	3.8	40	77	13	141	25	24	27	22	2.00
210032954--210033083	40	3.2	40	80	2	154	23	23	27	24	2.00
Indices	Period Size	Copy Number	Consensus Size	Percent Matches	Percent Indels	Score	A	C	G	T	Entropy (0-2)
210035726--210035898	40	4.3	40	80	5	174	23	26	21	28	1.99
210043822--210043990	40	4.2	40	80	4	173	23	26	21	28	1.99
210047062--210047094	16	2.1	16	100	0	66	57	6	6	30	1.47
210051396--210051616	40	5.6	40	76	6	191	26	23	25	24	2.00
210057895--210058038	40	3.6	40	79	5	150	27	24	27	20	1.99
210057932--210058061	40	3.2	40	82	4	165	23	24	28	23	2.00
210060042--210060152	40	2.8	40	83	9	129	22	27	25	24	2.00
210064722--210064892	93	1.8	93	93	0	297	28	28	21	21	1.98
210064717--210064889	46	3.7	46	79	10	208	29	27	20	21	1.98
210072165--210072335	46	3.7	46	77	4	191	29	26	20	23	1.99
210072166--210072336	93	1.8	93	91	0	279	29	26	20	23	1.99
210074728--210074887	29	5.5	30	88	8	222	33	13	25	27	1.94
210074728--210074887	59	2.8	57	89	4	223	33	13	25	27	1.94
210085958--210086116	28	5.5	30	86	6	202	32	13	25	27	1.94
210085958--210086116	58	2.8	57	87	6	214	32	13	25	27	1.94
210102040--210102206	40	4.2	40	82	2	185	24	26	22	26	2.00
210118109--210118330	40	5.6	39	77	9	155	22	25	23	27	2.00
210118151--210118381	80	2.9	80	92	1	356	23	26	23	25	2.00
210118151--210118382	40	5.8	40	83	0	275	24	26	23	25	2.00
210119092--210119117	2	13.0	2	100	0	52	50	0	0	50	1.00
210135051--210135220	41	4.2	40	73	18	152	27	28	21	22	1.99
210143391--210143560	41	4.2	40	74	18	161	27	27	22	22	1.99
Indices	Period Size	Copy Number	Consensus Size	Percent Matches	Percent Indels	Score	A	C	G	T	Entropy (0-2)
210155422--210155539	41	3.1	41	60	28	98	32	17	28	21	1.96
210155390--210155553	71	2.3	71	100	0	328	35	17	28	18	1.94
210163003--210163120	41	3.1	41	60	28	98	32	17	28	21	1.96
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210368320--210368408	30	3.0	30	80	8	101	57	15	16	10	1.65
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210368320--210368399	15	5.4	15	80	7	92	58	13	17	10	1.62
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