Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  645  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
202793319--202793348
11
2.7
11
89
0
51
60
0
0
40
0.97
202794158--202794193
16
2.3
16
90
4
56
8
0
30
61
1.26
202794189--202794224
16
2.3
15
90
4
54
0
8
2
88
0.59
202794870--202795445
88
6.9
84
70
15
269
36
18
16
28
1.93
202795038--202795099
30
2.1
30
90
6
99
41
29
9
19
1.83
202795223--202795772
77
7.1
73
75
12
424
33
19
17
29
1.95
202795442--202796083
165
3.9
166
91
2
956
32
20
18
28
1.96
202795611--202795772
74
2.1
75
85
7
222
32
20
18
28
1.97
202795766--202795939
76
2.3
77
85
6
237
32
20
19
28
1.97
202795919--202795953
14
2.5
14
90
0
52
57
5
20
17
1.60
202795929--202796384
72
6.3
72
71
12
328
37
21
16
24
1.94
202796384--202796646
70
3.8
70
84
5
345
38
22
14
25
1.91
202796222--202796813
262
2.3
257
95
2
1042
36
22
14
25
1.93
202796384--202796646
141
1.9
140
89
2
411
38
22
14
25
1.91
202805752--202805781
11
2.7
11
89
0
51
60
0
0
40
0.97
202806622--202806656
15
2.3
15
90
9
54
0
8
2
88
0.61
202807558--202807607
19
2.4
21
80
9
59
50
2
0
48
1.12
202808973--202809002
11
2.7
11
89
0
51
60
0
0
40
0.97
202809810--202809854
18
2.5
18
82
7
56
6
2
26
64
1.30
202810603--202810981
87
4.5
86
74
11
336
36
19
15
28
1.92
202810573--202811053
252
1.9
248
87
4
700
37
19
15
27
1.92
202811196--202811513
73
4.4
73
85
2
383
33
23
15
27
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
202811206--202811745
145
3.8
144
81
8
622
33
21
15
29
1.95
202811458--202811574
61
1.9
61
91
6
193
29
28
17
24
1.98
202811206--202811719
206
2.4
208
90
5
784
32
22
16
28
1.95
202811519--202811745
72
3.1
72
85
4
321
33
20
16
29
1.95
202811726--202811760
14
2.5
14
90
0
52
62
5
14
17
1.49
202811654--202811836
90
2.0
88
83
9
210
35
20
18
26
1.95
202811750--202811893
74
1.9
76
85
7
204
27
24
19
29
1.98
202811859--202811972
57
2.0
59
84
3
151
42
16
11
29
1.83
202820931--202820960
11
2.7
11
89
0
51
60
0
0
40
0.97
202824942--202825114
46
3.7
46
78
13
210
21
21
27
28
1.99
202824939--202825109
93
1.8
93
96
0
315
21
21
28
28
1.99
202830447--202830619
46
3.8
45
77
13
199
21
19
27
30
1.98
202830444--202830614
93
1.8
93
94
0
306
21
19
28
29
1.98
202838330--202838517
50
3.7
50
82
2
205
31
27
17
23
1.97
202842740--202843038
46
6.4
47
86
3
435
28
30
9
31
1.88
202842740--202843038
92
3.2
93
93
3
514
28
30
9
31
1.88
202849179--202849308
40
3.3
39
83
4
163
23
25
28
23
1.99
202861197--202861358
71
2.3
72
85
3
229
36
19
26
17
1.94
202868708--202868869
71
2.3
72
85
3
229
37
18
26
17
1.93
202870983--202871114
54
2.4
54
91
0
210
28
27
21
22
1.99
202877275--202877348
29
2.6
29
95
0
139
27
31
14
27
1.95
202877216--202877348
58
2.3
58
80
2
133
24
33
17
24
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
202885085--202885159
28
2.6
28
78
2
87
21
36
20
22
1.96
202885143--202885216
29
2.6
29
95
0
139
27
31
14
27
1.95
202889365--202889548
40
4.6
39
75
6
138
26
23
27
22
2.00
202889405--202889593
80
2.4
81
77
4
186
23
24
29
22
1.99
202897485--202897668
40
4.6
39
75
6
138
26
23
27
22
2.00
202897525--202897713
80
2.4
81
77
4
186
23
24
29
22
1.99
202900762--202900821
10
6.0
10
81
11
70
21
10
1
66
1.30
202901540--202901573
17
1.9
18
88
5
52
26
2
5
64
1.30
202903388--202903437
15
3.5
14
82
17
59
18
2
2
78
0.95
202903400--202903449
15
3.5
14
83
10
66
20
2
0
78
0.86
202903386--202903458
28
2.7
26
69
22
62
23
2
2
71
1.12
202904402--202904442
11
3.8
11
84
12
50
80
0
17
2
0.82
202904410--202904442
14
2.5
13
90
9
50
81
0
18
0
0.68
202905061--202905120
10
6.0
10
88
3
86
21
8
0
70
1.14
202906383--202906417
13
2.7
13
100
0
70
28
11
25
34
1.91
202908623--202908687
29
2.2
29
97
0
121
29
16
27
26
1.97
202913821--202913870
2
25.0
2
87
0
73
48
4
2
46
1.32
202913809--202913870
12
5.2
12
88
0
79
48
4
3
43
1.40
202913938--202913993
25
2.2
25
78
6
60
50
3
5
41
1.43
202913983--202914067
24
3.5
24
69
12
64
55
5
5
32
1.48
202914003--202914076
24
3.0
25
71
15
64
59
6
4
29
1.42
202914575--202914643
30
2.3
30
84
0
84
2
8
10
78
1.07
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
202915381--202915752
74
4.9
74
83
7
437
30
21
17
30
1.96
202915382--202915753
152
2.4
151
85
6
495
30
21
16
30
1.96
202915830--202915970
72
2.0
72
97
0
264
32
17
16
34
1.92
202915895--202916044
83
1.8
81
85
7
214
32
18
16
32
1.94
202916105--202916138
13
2.5
13
90
4
50
58
5
11
23
1.55
202915977--202916462
139
3.5
140
95
2
861
37
20
17
25
1.93
202916395--202916553
72
2.2
71
88
3
237
40
22
15
22
1.91
202926967--202927149
55
3.3
55
89
0
260
14
26
30
28
1.95
202927001--202927170
55
3.1
55
77
15
174
15
29
31
24
1.95
202936743--202936790
25
1.9
25
86
0
69
33
25
16
25
1.96
202936833--202936893
20
3.0
20
92
0
104
34
11
21
32
1.89
202936943--202937061
24
5.0
24
88
5
170
28
21
22
26
1.99
202936943--202937061
47
2.5
48
89
5
170
28
21
22
26
1.99
202937251--202937314
31
2.1
31
96
0
119
39
15
21
23
1.92
202943467--202943514
25
1.9
25
86
0
69
33
25
16
25
1.96
202943557--202943617
20
3.0
20
92
0
104
34
11
21
32
1.89
202943666--202943830
24
7.0
24
91
6
239
28
22
22
26
1.99
202943666--202943830
47
3.5
47
90
6
237
28
22
22
26
1.99
202944021--202944084
31
2.1
31
96
0
119
39
15
21
23
1.92
202945012--202945047
18
2.0
18
100
0
72
16
27
22
33
1.95
202945942--202946224
48
5.9
48
79
6
243
25
29
18
27
1.98
202945940--202946214
96
2.9
95
79
5
295
24
29
18
28
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
202952986--202953167
40
4.6
39
82
9
219
25
28
22
24
2.00
202952988--202953168
78
2.3
79
84
7
235
25
27
22
24
2.00
202961083--202961305
77
2.8
79
85
8
310
25
27
21
25
2.00
202961064--202961305
40
6.1
40
87
6
300
25
27
21
25
2.00
202970820--202970889
27
2.5
28
95
2
124
28
14
27
30
1.95
202970820--202970901
27
3.0
27
85
8
78
29
15
24
30
1.96
202978823--202978892
27
2.5
28
95
2
124
28
14
27
30
1.95
202978823--202978904
27
3.0
27
85
8
78
29
15
24
30
1.96
202980455--202980678
40
5.6
39
83
4
227
26
26
20
25
1.99
202980455--202980672
79
2.7
79
81
8
253
27
26
20
26
1.99
202980455--202980679
119
1.9
120
83
6
296
26
26
20
25
1.99
202985656--202985724
15
4.6
15
83
0
84
11
17
13
57
1.64
202985647--202985734
30
3.0
30
81
8
99
10
17
15
56
1.66
202988084--202988259
46
3.8
46
81
10
232
20
21
29
28
1.98
202988080--202988251
93
1.8
93
96
0
317
20
22
30
27
1.98
202993407--202993485
29
2.7
29
86
5
106
27
32
15
24
1.95
203005171--203005305
29
4.6
29
81
7
148
28
14
30
26
1.95
203005171--203005303
60
2.3
58
82
5
151
27
15
30
27
1.96
203013227--203013361
29
4.6
29
81
7
148
28
14
30
26
1.95
203013227--203013359
60
2.3
58
82
5
151
27
15
30
27
1.96
203019950--203020078
46
2.8
46
95
0
222
29
29
21
19
1.98
203019958--203020097
46
3.0
45
88
4
140
28
29
21
20
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
203025399--203025452
27
2.0
27
85
0
72
38
12
7
40
1.72
203027725--203028095
27
13.7
27
88
0
472
29
22
8
39
1.83
203027777--203028294
27
19.2
27
84
3
211
33
21
8
36
1.84
203027739--203028095
81
4.4
81
89
0
525
29
21
8
39
1.83
203028140--203028323
81
2.3
80
82
6
212
38
20
11
29
1.87
203028286--203028408
27
4.2
27
80
17
138
34
22
20
22
1.97
203028313--203028384
36
2.0
36
100
0
144
36
27
16
19
1.93
203028286--203028408
63
2.0
63
95
0
219
34
22
20
22
1.97
203028632--203028698
25
2.7
25
92
0
107
28
26
22
22
1.99
203028632--203028708
25
3.1
25
88
1
93
32
23
19
24
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770