Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  73  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21474410--21474927
222
2.3
222
89
2
808
20
20
22
37
1.95
21474853--21475009
43
3.6
44
71
12
128
19
22
21
35
1.96
21476448--21476517
15
4.2
16
71
16
54
44
11
2
41
1.55
21482981--21483086
44
2.4
45
83
3
124
35
13
21
29
1.91
21495007--21495060
22
2.5
22
87
6
83
59
5
1
33
1.31
21495117--21495159
22
2.0
21
81
4
50
48
9
13
27
1.73
21495321--21495345
13
1.9
13
100
0
50
88
12
0
0
0.53
21496750--21496775
2
13.0
2
100
0
52
50
0
0
50
1.00
21498536--21498578
22
2.1
22
87
12
65
53
2
0
44
1.13
21499257--21499312
25
2.2
26
78
9
62
57
8
1
32
1.40
21499539--21499567
5
6.0
5
92
8
51
0
17
0
82
0.66
21501001--21501147
75
2.0
75
94
0
258
25
20
12
42
1.87
21504695--21504738
22
2.0
22
86
0
61
38
22
6
31
1.81
21506633--21506754
49
2.5
49
76
6
115
63
3
4
28
1.31
21506720--21506813
27
3.5
26
72
15
75
58
4
8
28
1.47
21507040--21507073
2
17.0
2
100
0
68
50
0
0
50
1.00
21507577--21507908
131
2.6
130
85
6
410
36
19
17
26
1.94
21508880--21508905
2
13.0
2
100
0
52
50
0
0
50
1.00
21510332--21510394
27
2.3
27
78
15
74
60
3
3
33
1.28
21511656--21512335
44
14.7
44
68
12
249
30
18
21
29
1.97
21511840--21511981
51
2.8
51
89
2
214
30
21
20
26
1.98
21511650--21512342
140
5.0
140
77
10
643
31
18
20
29
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21512167--21512800
227
2.8
230
77
6
633
31
17
21
29
1.96
21512675--21512780
44
2.4
45
83
1
124
29
16
21
32
1.96
21512197--21512800
233
2.6
228
77
5
603
31
18
21
29
1.97
21513199--21513277
38
2.1
38
97
0
149
15
22
17
44
1.86
21514001--21514041
19
2.1
20
86
4
57
14
2
21
60
1.45
21514313--21514436
45
2.8
44
86
1
158
29
20
17
32
1.96
21514326--21514436
44
2.5
45
85
1
143
31
19
18
29
1.96
21517433--21517917
46
10.7
46
89
4
709
37
15
24
22
1.93
21520847--21520891
11
3.9
11
80
11
54
35
0
2
62
1.08
21523016--21523137
38
3.0
39
84
15
174
34
17
24
23
1.96
21523055--21523145
46
2.0
45
95
2
164
37
15
23
24
1.93
21523116--21523161
24
1.9
24
100
0
92
39
21
17
21
1.93
21523163--21523425
46
5.7
46
92
0
420
37
14
24
23
1.92
21523032--21523245
108
2.0
108
99
0
419
35
17
23
23
1.96
21523043--21523425
92
3.9
105
90
6
415
36
15
24
23
1.94
21523017--21523289
154
1.8
146
92
6
456
34
16
24
23
1.95
21523017--21523425
138
2.8
143
85
10
423
36
15
24
23
1.94
21524119--21524255
35
3.9
35
96
0
247
16
48
12
21
1.79
21524697--21524732
14
2.5
15
95
4
65
63
11
5
19
1.46
21524660--21524732
32
2.3
30
80
11
83
61
16
6
15
1.53
21524992--21525041
11
4.5
11
82
9
57
0
56
0
44
0.99
21525557--21525608
20
2.5
21
82
17
72
38
0
7
53
1.30
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21525773--21525809
2
18.5
2
88
0
56
45
2
2
48
1.30
21541536--21541581
20
2.3
20
84
0
65
34
4
30
30
1.77
21552649--21552757
43
2.6
42
79
5
121
33
18
21
27
1.96
21552841--21552886
20
2.3
20
84
0
65
30
4
34
30
1.77
21556761--21556864
45
2.3
45
91
3
165
25
13
22
38
1.91
21560280--21560392
27
4.2
28
84
3
135
37
22
23
17
1.94
21563422--21563558
27
5.1
27
90
4
206
16
24
21
37
1.94
21570979--21571088
27
4.0
27
79
10
116
36
20
24
19
1.95
21570979--21571088
55
2.0
55
86
8
154
36
20
24
19
1.95
21574520--21574617
28
3.5
29
86
8
132
28
13
27
30
1.94
21579202--21579337
40
3.4
40
85
0
173
25
27
20
27
1.99
21579224--21579375
40
3.8
40
84
5
164
23
25
22
28
1.99
21587314--21587459
40
3.7
40
84
0
175
24
27
21
26
2.00
21587346--21587497
40
3.8
40
84
5
164
23
25
22
28
1.99
21598108--21598378
40
6.8
40
89
1
366
23
26
23
25
2.00
21601643--21601771
29
4.5
29
89
4
181
26
27
17
29
1.97
21601643--21601786
58
2.5
57
85
4
182
27
26
15
30
1.96
21601998--21602048
8
6.4
8
77
8
50
7
19
19
52
1.70
21601998--21602048
24
2.1
24
85
0
66
7
19
19
52
1.70
21606814--21607012
27
7.3
27
83
2
238
30
23
7
39
1.81
21606814--21607012
81
2.4
81
86
2
274
30
23
7
39
1.81
21607044--21607181
27
5.1
27
78
2
116
43
20
5
30
1.75
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21607011--21607166
81
1.9
81
81
10
185
42
19
8
29
1.80
21607150--21607230
27
2.9
27
83
7
83
41
13
8
35
1.75
21607044--21607250
110
1.9
108
83
4
263
41
19
7
31
1.79
21608902--21609100
27
7.3
27
87
2
229
29
23
8
39
1.83
21608924--21609100
27
6.5
27
86
4
232
29
22
7
40
1.81
21608924--21609120
81
2.4
80
83
8
204
30
22
8
38
1.83
21609092--21609254
27
6.0
26
70
11
89
40
22
9
28
1.84
21609099--21609254
81
1.9
81
84
7
210
41
20
8
28
1.82
21609132--21609254
54
2.3
55
77
4
133
42
21
7
28
1.80
21609132--21609318
27
6.9
27
74
7
117
40
18
8
32
1.81
21609372--21609436
27
2.4
27
82
5
78
33
20
26
20
1.96
21610678--21610748
20
3.5
20
86
0
97
35
12
18
33
1.89
21610795--21610987
25
8.0
24
90
5
252
27
20
21
29
1.98
21610794--21610986
73
2.7
72
86
8
259
28
20
21
29
1.98
21617120--21617146
2
13.5
2
100
0
54
51
0
0
48
1.00
21618042--21618090
24
2.0
24
88
0
71
22
28
18
30
1.97
21620905--21621064
29
5.5
29
82
4
171
26
31
16
25
1.97
21622831--21622894
28
2.3
28
91
0
101
18
17
37
26
1.93
21623211--21623570
27
13.6
27
82
7
357
38
20
11
29
1.87
21623211--21623544
53
6.3
52
81
9
315
38
20
10
30
1.86
21629141--21629348
40
5.2
39
84
1
218
25
26
22
25
2.00
21629141--21629347
80
2.6
80
83
1
245
25
26
22
25
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21637109--21637316
40
5.2
39
84
1
218
25
26
22
25
2.00
21637109--21637315
80
2.6
80
83
1
245
25
26
22
25
2.00
21640529--21640736
40
5.2
40
82
2
202
25
23
25
25
2.00
21640531--21640736
80
2.6
80
83
3
236
25
23
26
24
2.00
21648209--21648380
93
1.8
93
96
0
317
27
30
22
20
1.98
21648201--21648376
46
3.8
46
81
10
232
28
29
21
20
1.98
21650757--21650845
30
3.0
30
80
8
101
57
15
16
10
1.65
21650757--21650836
15
5.4
15
80
7
92
58
13
17
10
1.62
21650768--21650845
15
5.2
15
78
9
79
56
15
16
11
1.67
21653796--21653967
93
1.8
93
96
0
317
27
30
22
20
1.98
21653788--21653963
46
3.8
46
81
10
232
28
29
21
20
1.98
21655829--21656036
40
5.2
40
82
2
193
25
23
25
25
2.00
21655831--21656036
80
2.6
80
82
4
220
25
23
25
25
2.00
21657851--21657881
14
2.3
13
94
5
53
32
29
6
32
1.83
21659251--21659799
273
2.0
274
91
1
886
37
20
13
28
1.90
21660310--21660350
18
2.3
18
91
4
57
41
14
0
43
1.45
21661732--21661855
56
2.2
56
89
0
185
34
24
16
25
1.95
21673322--21673406
34
2.5
34
83
5
93
28
21
23
27
1.99
21675309--21675437
49
2.6
49
79
7
136
25
26
19
28
1.99
21675499--21675625
46
2.8
46
83
6
150
21
29
21
27
1.98
21678452--21678627
46
3.8
46
73
14
155
21
21
27
28
1.99
21678448--21678620
93
1.9
93
87
4
260
21
21
28
27
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21683981--21684016
18
1.9
19
88
5
56
63
0
25
11
1.27
21685304--21685435
59
2.3
58
97
1
246
37
14
24
24
1.92
21685274--21685435
88
1.8
89
90
1
263
35
14
24
25
1.93
21685304--21685435
29
4.5
29
97
1
246
37
14
24
24
1.92
21693156--21693461
154
2.0
154
100
0
612
35
23
15
25
1.93
21693975--21694031
30
1.9
29
89
3
87
12
15
14
57
1.65
21703683--21703726
21
2.1
21
95
0
79
29
4
27
38
1.76
21703690--21703736
21
2.2
21
84
0
58
34
4
23
38
1.74
21704638--21704779
55
2.6
55
79
4
160
28
26
27
18
1.98
21706168--21706197
12
2.6
12
94
5
53
16
6
0
76
0.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770