Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  749  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
237422603--237422776
78
2.2
77
85
4
224
24
21
31
22
1.98
237426502--237426608
39
2.8
39
97
1
198
21
31
20
26
1.98
237433848--237434030
39
4.6
39
87
0
240
22
30
22
24
1.99
237437404--237437440
17
2.1
18
90
5
58
35
21
13
29
1.92
237445602--237445735
46
2.9
48
80
12
179
20
20
29
28
1.98
237448644--237448712
15
4.6
15
83
0
84
11
17
13
57
1.64
237448635--237448722
30
3.0
30
81
8
99
10
17
15
56
1.66
237451106--237451281
46
3.8
46
81
10
232
20
21
29
28
1.98
237451102--237451273
93
1.8
93
96
0
317
20
22
30
27
1.98
237457941--237458098
40
4.0
40
79
4
151
26
24
26
22
2.00
237457941--237458128
80
2.3
80
79
12
206
26
23
27
22
2.00
237463600--237463680
29
2.7
29
90
3
126
24
4
18
51
1.65
237464137--237464165
3
9.7
3
100
0
58
34
0
0
65
0.93
237464259--237464288
3
10.0
3
100
0
60
33
0
0
66
0.92
237464383--237464425
16
2.8
15
86
6
59
30
6
0
62
1.21
237464529--237464560
16
2.0
16
93
0
55
21
21
6
50
1.71
237464655--237464682
3
9.3
3
100
0
56
35
0
0
64
0.94
237464774--237464834
22
2.8
22
80
2
61
18
6
6
68
1.33
237476693--237477468
205
3.8
206
94
1
1321
28
18
22
29
1.98
237477533--237477618
44
2.0
43
84
6
111
29
16
29
25
1.97
237479255--237479354
40
2.5
40
85
4
105
28
29
22
21
1.99
237483934--237484032
28
3.5
28
81
9
112
29
25
16
29
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
237491619--237491717
28
3.5
28
81
9
112
29
25
16
29
1.96
237498380--237498557
79
2.2
81
82
6
220
25
24
26
23
2.00
237498379--237498557
40
4.5
39
80
10
168
25
24
26
23
2.00
237501416--237501569
39
3.9
39
86
0
191
23
31
22
22
1.98
237501446--237501569
39
3.2
39
90
1
194
25
32
20
22
1.98
237509084--237509246
71
2.3
70
98
1
317
35
17
28
19
1.94
237521592--237521744
40
3.8
40
79
5
148
25
28
23
22
2.00
237529616--237529768
40
3.8
40
79
5
148
25
28
23
22
2.00
237533152--237533259
41
2.6
42
89
5
159
21
18
25
35
1.96
237534273--237534302
2
15.0
2
92
0
51
46
0
0
53
1.00
237536291--237536400
26
4.2
26
90
0
184
33
5
24
36
1.79
237541184--237541241
19
3.1
19
85
9
66
36
0
6
56
1.26
237541557--237541592
17
2.1
17
94
0
63
36
27
25
11
1.90
237542993--237543028
18
2.0
18
94
0
63
36
5
5
52
1.48
237543338--237543372
2
17.5
2
93
0
61
45
2
0
51
1.16
237551629--237551757
40
3.3
38
73
11
116
24
27
24
24
2.00
237551645--237551794
40
3.8
39
78
9
126
22
26
24
26
2.00
237551645--237551793
80
1.9
79
83
6
194
21
26
24
26
1.99
237559541--237559691
40
3.8
40
80
6
155
22
27
23
26
2.00
237565317--237565443
38
3.2
39
83
8
143
22
26
24
25
2.00
237569372--237569546
40
4.5
39
89
6
248
24
28
23
24
2.00
237577322--237577536
40
5.5
39
90
5
287
25
26
23
24
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
237577322--237577536
78
2.7
79
87
7
296
25
26
23
24
2.00
237582493--237582565
29
2.5
29
90
0
92
24
31
16
27
1.96
237587314--237587481
40
4.2
40
80
1
167
23
27
23
25
2.00
237587330--237587479
80
1.9
80
83
5
196
22
27
24
26
2.00
237592647--237592684
20
1.9
20
88
0
58
34
2
10
52
1.50
237600619--237600656
20
1.9
20
88
0
58
34
2
10
52
1.50
237602273--237602340
26
2.6
27
88
9
104
45
25
10
19
1.81
237607153--237607190
18
2.1
18
95
0
67
52
5
5
36
1.47
237610741--237610848
26
4.2
26
92
0
180
35
24
8
32
1.85
237614955--237614984
11
2.9
10
90
9
51
56
10
10
23
1.62
237617784--237617890
26
4.2
26
91
2
180
36
24
7
31
1.83
237617784--237617890
51
2.1
52
96
1
198
36
24
7
31
1.83
237624413--237624469
9
5.9
9
73
15
51
35
8
21
35
1.84
237624411--237624481
20
3.5
20
94
0
124
35
11
21
32
1.89
237624422--237624476
11
5.4
11
70
16
55
36
12
20
30
1.90
237624528--237624694
23
7.1
23
92
2
262
28
20
20
29
1.98
237624527--237624716
24
8.0
23
89
4
256
28
21
21
28
1.98
237624526--237624694
47
3.6
47
90
3
268
28
21
20
28
1.98
237631998--237632054
9
5.9
9
73
15
51
35
8
21
35
1.84
237631996--237632066
20
3.5
20
94
0
124
35
11
21
32
1.89
237632007--237632061
11
5.4
11
70
16
55
36
12
20
30
1.90
237632113--237632279
23
7.1
23
95
2
280
28
22
20
28
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
237632112--237632301
24
8.0
23
91
4
274
28
22
21
27
1.99
237632111--237632279
47
3.6
47
92
3
286
28
22
20
28
1.99
237636860--237636981
46
2.6
47
82
5
138
27
22
14
36
1.93
237639502--237639539
20
1.9
20
88
0
58
34
2
10
52
1.50
237647480--237647517
20
1.9
20
88
0
58
34
2
10
52
1.50
237650333--237656211
539
10.9
541
94
1
10226
37
18
11
33
1.86
237657524--237657730
74
2.9
71
84
7
256
23
6
15
54
1.64
237659767--237659826
13
4.7
13
72
4
59
43
28
1
26
1.65
237663245--237663283
17
2.5
15
83
8
51
61
0
0
38
0.96
237663237--237663282
7
5.6
8
80
19
51
63
0
0
36
0.95
237665540--237665711
93
1.8
93
96
0
317
27
30
22
20
1.98
237665532--237665707
46
3.8
46
81
10
232
28
29
21
20
1.98
237670940--237670965
2
13.0
2
100
0
52
50
0
0
50
1.00
237671557--237671736
40
4.6
40
89
3
260
26
23
27
21
1.99
237676321--237676421
28
3.5
28
86
6
114
29
26
13
29
1.94
237684271--237684371
28
3.5
28
86
6
114
29
26
13
29
1.94
237686032--237686410
40
9.6
40
89
3
475
27
19
25
27
1.99
237689814--237690122
49
6.4
48
94
3
516
33
8
27
30
1.86
237689814--237690122
97
3.2
97
94
5
520
33
8
27
30
1.86
237689814--237690122
146
2.1
145
92
5
527
33
8
27
30
1.86
237690204--237690274
37
1.9
37
100
0
142
21
22
33
22
1.97
237694681--237694860
40
4.5
39
77
10
161
27
22
26
23
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
237702713--237702891
40
4.5
39
77
10
161
27
21
26
24
1.99
237711347--237711438
30
3.1
30
95
3
159
23
22
14
39
1.91
237711625--237711741
23
5.0
24
85
9
152
27
23
21
28
1.99
237711797--237711849
20
2.7
20
87
0
88
35
20
9
33
1.85
237713158--237713494
27
12.9
27
82
9
315
41
8
21
29
1.81
237713159--237713494
53
6.4
53
82
8
323
41
8
21
29
1.81
237713201--237713494
79
3.7
78
83
8
321
41
8
22
28
1.82
237713484--237713714
26
8.9
25
78
11
146
31
8
21
38
1.84
237713486--237713615
27
5.0
27
77
10
101
30
10
20
38
1.86
237713541--237713694
52
3.0
51
87
4
193
33
7
19
38
1.81
237713542--237713714
78
2.2
79
85
8
230
31
7
21
39
1.81
237713569--237713733
52
3.2
53
86
7
198
32
7
20
39
1.80
237714919--237715090
27
6.4
27
79
7
181
29
14
18
37
1.91
237714919--237715090
54
3.2
54
82
2
222
29
14
18
37
1.91
237717604--237717770
40
4.2
40
79
6
169
26
22
26
24
2.00
237725532--237725697
40
4.2
40
78
7
160
26
21
27
24
1.99
237729653--237729812
39
4.1
39
97
0
293
20
25
31
22
1.98
237735300--237735455
39
4.0
39
94
0
276
21
23
30
25
1.99
237740957--237741075
38
3.1
39
95
2
206
20
24
32
22
1.98
237748288--237748454
40
4.2
40
81
2
176
24
27
22
25
2.00
237748304--237748454
80
1.9
79
83
6
198
23
27
22
25
2.00
237749649--237749758
56
2.0
54
82
10
134
28
16
18
37
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
237756299--237756465
40
4.2
40
81
2
176
24
27
22
25
2.00
237756315--237756465
80
1.9
79
83
6
198
23
27
22
25
2.00
237757661--237757769
56
2.0
53
82
12
132
28
16
18
36
1.92
237758964--237759317
49
7.3
49
89
1
545
28
29
8
33
1.86
237766011--237766048
19
2.0
19
89
0
58
31
5
2
60
1.33
237778329--237778797
119
4.0
119
93
3
747
32
19
20
27
1.97
237778724--237778896
83
2.1
80
90
3
265
35
17
17
29
1.93
237787979--237788053
28
2.6
28
78
2
87
21
36
20
22
1.96
237788037--237788110
29
2.6
29
95
0
139
27
31
14
27
1.95
237795850--237795924
28
2.6
28
78
2
87
21
36
20
22
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770