Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          769   770   

This is table  606  of  770  ( 92376 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
189684298--189684476
80
2.2
81
84
3
227
25
26
22
25
2.00
189684298--189684478
40
4.5
41
79
8
176
25
26
22
25
2.00
189687335--189687501
40
4.2
40
82
2
185
25
27
21
25
1.99
189687335--189687501
80
2.1
79
83
7
205
25
27
21
25
1.99
189688326--189688371
17
2.5
19
74
22
53
34
23
17
23
1.96
189695335--189695501
40
4.2
40
82
2
185
25
27
21
25
1.99
189695335--189695501
80
2.1
79
83
7
205
25
27
21
25
1.99
189696326--189696371
17
2.5
19
74
22
53
34
23
17
23
1.96
189700430--189700530
39
2.5
39
79
6
105
30
21
24
22
1.99
189700428--189700606
40
4.5
39
76
11
152
27
21
26
24
1.99
189708363--189708533
40
4.3
39
77
10
159
28
21
26
23
1.99
189714223--189714389
40
4.2
40
82
2
185
24
26
22
26
2.00
189721557--189721723
40
4.2
40
82
2
185
24
26
22
26
2.00
189724103--189724130
2
14.0
2
100
0
56
50
0
0
50
1.00
189724581--189724809
24
9.6
24
94
1
363
21
19
25
34
1.96
189724581--189724809
47
4.8
47
93
1
368
21
19
25
34
1.96
189731874--189731901
2
14.0
2
100
0
56
50
0
0
50
1.00
189732351--189732577
24
9.6
24
90
5
329
21
19
24
34
1.96
189741651--189741802
40
3.8
40
80
6
155
23
23
27
25
2.00
189741651--189741802
39
3.8
38
78
11
137
23
23
27
25
2.00
189749966--189750035
27
2.5
28
88
2
106
28
14
25
31
1.95
189749966--189750047
27
3.0
27
80
8
103
29
13
23
34
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
189757881--189757950
27
2.5
28
88
2
106
28
14
25
31
1.95
189757881--189757962
27
3.0
27
80
8
103
29
13
23
34
1.93
189760369--189760462
44
2.1
44
90
0
143
39
8
26
25
1.84
189765010--189765072
24
2.6
24
100
0
126
20
17
26
34
1.95
189783662--189783779
41
3.1
41
60
28
98
32
17
28
21
1.96
189783630--189783793
71
2.3
71
100
0
328
35
17
28
18
1.94
189791238--189791355
41
3.1
41
60
28
98
32
17
28
21
1.96
189791206--189791369
71
2.3
71
100
0
328
35
17
28
18
1.94
189795801--189796010
40
5.2
40
87
2
305
25
24
28
21
1.99
189803338--189803467
40
3.2
40
82
4
165
23
28
24
23
2.00
189815150--189815218
19
3.6
19
77
14
63
65
2
1
30
1.16
189820568--189820600
16
2.1
16
88
11
50
54
3
0
42
1.15
189822263--189822433
75
2.4
75
83
7
212
32
11
22
33
1.89
189822266--189822431
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23
33
1.90
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28
17
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0
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0
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2.8
27
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15
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1
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1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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38
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22
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44
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2.4
23
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19
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296
1.9
296
89
0
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19
17
27
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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19
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19
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189896211--189898236
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2924
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19
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1.8
123
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0
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1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
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(0-2)
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1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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25
26
22
25
2.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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