Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  72  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21196133--21196160
14
2.0
14
100
0
56
0
14
0
85
0.59
21204759--21204813
16
3.7
15
68
18
51
63
0
0
36
0.95
21204769--21204830
30
2.1
30
87
6
90
61
0
1
37
1.06
21216600--21216634
3
11.7
3
100
0
70
65
34
0
0
0.93
21218796--21218838
14
3.0
14
79
3
50
27
0
6
65
1.18
21221839--21221972
72
1.9
70
81
6
162
26
16
17
39
1.90
21222773--21222904
68
2.0
68
83
7
173
24
15
9
50
1.73
21232356--21232392
19
1.9
19
88
0
56
64
0
2
32
1.07
21236321--21236370
25
2.0
25
100
0
100
40
12
16
32
1.84
21239434--21239484
20
2.6
20
84
9
61
27
1
3
66
1.20
21244441--21244474
12
2.9
12
86
4
52
32
0
0
67
0.91
21244599--21244657
31
1.9
31
89
3
93
57
8
5
28
1.50
21244698--21244737
11
3.6
11
82
0
53
60
10
10
20
1.57
21247817--21247860
19
2.3
19
88
0
61
40
0
2
56
1.11
21248959--21249022
33
1.9
34
87
9
96
42
3
1
53
1.26
21267954--21267978
10
2.5
10
100
0
50
8
0
36
56
1.29
21270600--21270669
29
2.4
29
83
4
88
42
20
17
20
1.89
21272342--21272395
27
2.0
27
92
0
90
37
12
16
33
1.87
21273381--21273444
31
2.1
31
84
0
83
43
9
9
37
1.69
21281204--21281263
21
2.9
21
97
2
113
55
3
13
28
1.54
21281212--21281251
12
3.6
12
74
19
50
52
5
12
30
1.60
21287807--21287959
44
3.3
43
82
13
180
30
22
15
31
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21287807--21287973
51
3.4
50
84
7
195
30
22
15
31
1.95
21296193--21296306
60
1.9
60
98
0
219
28
19
9
42
1.83
21300587--21300625
15
2.6
15
84
8
53
61
0
0
38
0.96
21300649--21300689
20
2.0
20
90
0
64
46
4
4
43
1.46
21302325--21302520
98
2.0
102
91
5
328
31
6
11
51
1.63
21315342--21315515
80
2.2
80
83
5
210
25
21
25
26
2.00
21315341--21315515
40
4.4
40
77
6
176
26
21
25
26
2.00
21323508--21323655
40
3.7
41
84
3
158
27
22
25
23
2.00
21323509--21323682
80
2.2
80
82
5
201
25
21
25
26
2.00
21323509--21323682
40
4.4
40
76
9
151
25
21
25
26
2.00
21328944--21328970
14
1.9
14
100
0
54
44
0
25
29
1.54
21332859--21332932
36
2.1
36
100
0
148
36
25
18
18
1.94
21334287--21334348
31
2.0
30
87
9
90
56
11
4
27
1.54
21334950--21334982
13
2.4
14
90
10
50
36
3
6
54
1.41
21335405--21335433
13
2.3
13
94
5
51
62
3
0
34
1.12
21337022--21337155
13
10.5
12
67
17
74
57
2
4
35
1.31
21337066--21337174
26
4.2
26
79
10
107
58
4
1
34
1.29
21337213--21337258
23
2.0
23
83
8
58
56
4
2
36
1.31
21337322--21337382
3
20.7
3
81
9
72
60
0
3
36
1.13
21338108--21338150
13
3.2
13
86
3
50
32
2
0
65
1.06
21338096--21338139
14
3.2
14
83
3
54
20
2
0
77
0.88
21339087--21339387
85
3.5
83
84
9
354
35
20
17
26
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21339315--21339546
75
3.2
73
85
10
314
33
20
17
28
1.95
21347631--21347655
4
6.2
4
100
0
50
52
0
24
24
1.48
21351422--21351449
2
14.0
2
100
0
56
50
0
0
50
1.00
21351614--21351721
59
1.9
55
83
12
139
53
5
7
33
1.52
21351668--21351821
26
6.1
26
66
17
74
55
1
7
35
1.40
21351765--21351851
14
6.6
14
70
16
60
58
3
1
36
1.22
21351765--21351844
41
2.0
40
87
4
117
58
2
1
37
1.19
21351784--21351884
25
3.7
27
80
10
107
57
4
0
36
1.27
21351765--21351903
26
5.5
25
77
16
110
57
3
2
36
1.28
21351934--21351979
23
2.0
23
83
8
58
56
4
2
36
1.31
21352046--21352109
3
21.7
3
82
9
78
60
0
3
35
1.12
21360669--21360731
22
2.8
22
78
4
63
55
4
3
36
1.37
21364322--21364407
41
2.1
40
82
2
100
65
10
3
20
1.38
21371257--21371326
36
1.9
36
88
0
104
38
25
12
22
1.90
21372685--21372756
27
2.7
27
89
4
94
69
5
11
13
1.34
21372696--21372757
27
2.3
27
94
2
108
69
3
14
12
1.31
21373587--21373639
24
2.4
22
80
17
65
18
16
1
62
1.42
21373654--21373701
23
2.1
23
88
0
69
27
8
0
64
1.22
21373633--21373702
4
17.8
4
75
7
54
24
7
1
67
1.24
21377216--21377265
16
3.1
16
76
0
55
24
12
18
46
1.82
21378340--21378368
12
2.4
12
100
0
58
62
0
24
13
1.32
21379991--21380017
13
2.1
13
100
0
54
18
14
0
66
1.25
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21380140--21380172
8
4.1
8
88
11
50
18
0
0
81
0.68
21391846--21392644
91
8.9
91
82
5
902
32
20
24
23
1.98
21391846--21392644
179
4.5
177
84
5
1000
32
20
24
23
1.98
21392567--21392782
44
4.9
44
73
6
152
34
21
19
24
1.97
21392611--21392778
88
1.9
88
85
2
230
32
20
21
25
1.98
21394495--21394768
46
6.0
46
93
0
397
20
23
15
40
1.91
21396904--21396956
11
4.7
11
81
4
61
64
1
0
33
1.05
21396904--21396969
34
2.0
33
82
8
82
59
3
0
37
1.13
21397959--21397998
21
1.9
21
90
10
64
30
7
2
60
1.38
21397954--21398039
3
28.7
3
70
13
52
29
6
2
61
1.34
21399462--21399537
38
2.0
38
100
0
152
52
2
2
42
1.29
21404979--21405003
10
2.5
10
100
0
50
92
0
8
0
0.40
21407016--21407244
118
1.9
119
92
0
388
36
10
13
38
1.80
21407751--21407793
21
2.0
21
81
4
50
27
20
2
48
1.62
21409230--21409272
23
1.9
22
85
4
59
65
4
2
27
1.25
21409263--21409305
22
2.0
22
90
4
70
51
9
0
39
1.34
21413061--21413110
10
4.7
11
90
5
68
24
46
2
28
1.64
21413646--21413699
18
3.0
18
80
0
63
25
14
18
40
1.89
21417704--21417746
11
4.0
11
87
6
61
23
46
2
27
1.64
21417704--21417745
21
2.0
22
90
4
68
21
47
2
28
1.63
21423896--21423943
24
2.0
24
100
0
96
25
8
8
58
1.55
21424272--21424333
31
2.0
32
83
3
81
30
12
14
41
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21426167--21426215
15
3.2
15
75
16
55
24
0
2
73
0.94
21426259--21426346
41
2.1
41
78
17
94
25
5
3
65
1.30
21426447--21426614
3
58.3
3
79
10
129
28
5
3
62
1.34
21426694--21426720
2
13.5
2
100
0
54
48
0
0
51
1.00
21427202--21427463
128
2.0
126
84
8
332
35
15
11
36
1.84
21427812--21427946
69
2.0
68
94
1
234
38
16
14
30
1.89
21428732--21428759
2
14.0
2
100
0
56
50
0
0
50
1.00
21429361--21429521
3
53.7
3
66
18
68
31
6
2
59
1.37
21429363--21429408
23
2.0
23
83
8
58
28
6
0
65
1.17
21429525--21429563
12
3.2
12
85
3
51
35
0
10
53
1.35
21429720--21429767
15
3.1
15
77
16
53
35
2
4
58
1.29
21429749--21429866
23
5.5
22
78
15
104
34
2
3
59
1.28
21429707--21429807
9
10.8
9
68
22
57
33
2
3
59
1.31
21429720--21429800
16
5.0
16
72
20
53
35
1
3
59
1.23
21429751--21429876
44
2.9
44
80
13
136
34
2
3
58
1.29
21429866--21429902
16
2.2
17
90
4
58
24
0
24
51
1.49
21430046--21430094
26
1.9
25
87
4
71
40
2
6
51
1.38
21431833--21431875
18
2.4
19
84
7
54
44
0
6
48
1.29
21449079--21449188
26
4.2
26
95
0
175
34
5
24
35
1.79
21450806--21450945
27
5.2
27
86
2
174
17
25
22
34
1.96
21450806--21450945
54
2.6
55
87
2
194
17
25
22
34
1.96
21451007--21451046
19
2.0
22
85
14
59
17
2
47
32
1.61
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21453589--21453617
4
7.2
4
100
0
58
75
0
24
0
0.80
21454849--21455311
45
10.5
44
65
8
154
30
19
24
25
1.98
21454836--21455893
260
4.0
261
87
4
1207
28
18
25
27
1.98
21454834--21455893
131
8.1
129
85
3
1145
28
18
25
27
1.98
21456073--21456521
44
10.2
44
91
0
691
27
16
30
25
1.96
21468066--21468113
25
2.0
24
84
8
62
39
6
2
52
1.39
21472501--21472552
21
2.5
21
87
6
79
57
5
1
34
1.33
21474360--21474482
43
2.8
45
78
8
153
18
20
25
35
1.95
21474541--21474702
88
1.8
88
85
5
229
22
20
20
36
1.95
21474538--21474726
88
2.1
88
80
5
222
20
19
21
38
1.93

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770