Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  507  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
156870677--156870794
23
5.0
24
91
5
179
27
21
22
28
1.99
156870988--156871051
31
2.1
31
90
0
101
35
15
23
25
1.94
156873115--156873147
10
3.3
10
95
0
57
33
33
9
24
1.87
156876272--156876304
2
16.5
2
100
0
66
51
0
48
0
1.00
156877373--156877425
26
2.0
26
100
0
106
28
18
7
45
1.77
156878077--156878126
17
2.9
17
77
11
57
14
42
24
20
1.88
156881029--156881057
11
2.6
11
100
0
58
58
24
0
17
1.38
156882753--156882902
43
3.5
43
78
12
146
31
26
20
21
1.98
156882792--156882924
43
3.1
43
75
8
103
36
25
18
20
1.95
156886568--156886830
39
6.7
39
90
0
373
20
22
27
29
1.98
156886530--156886830
117
2.6
117
86
2
392
21
22
27
28
1.99
156890025--156890326
68
4.6
66
68
18
180
29
15
28
25
1.96
156889943--156890335
198
2.0
198
98
0
768
28
16
28
26
1.97
156889946--156890428
198
2.4
195
88
5
580
30
16
28
25
1.97
156898653--156898808
40
3.9
40
91
0
251
26
22
28
23
1.99
156909431--156909638
40
5.3
40
84
6
196
27
22
27
22
1.99
156909473--156909647
80
2.2
80
85
4
230
27
24
27
20
1.99
156914140--156914517
189
2.0
189
98
0
738
30
26
19
23
1.98
156915793--156915894
29
3.5
29
90
0
150
23
33
15
27
1.95
156922185--156922563
189
2.0
189
98
0
731
30
26
19
23
1.98
156923991--156924120
47
2.8
49
78
13
157
30
28
18
22
1.97
156924000--156924143
46
3.1
44
72
15
114
29
27
19
22
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
156934436--156934508
35
2.1
35
97
0
137
38
20
5
35
1.76
156941614--156941643
10
2.8
11
90
10
53
30
16
16
36
1.91
156942990--156943163
46
3.8
46
77
7
208
28
29
20
21
1.98
156950342--156950483
40
3.5
40
83
1
124
27
23
26
21
1.99
156950380--156950509
40
3.3
39
78
11
147
23
23
26
25
2.00
156966683--156966786
29
3.6
28
77
10
102
27
18
25
27
1.98
156968199--156968223
2
12.5
2
100
0
50
52
0
0
48
1.00
156971532--156971577
6
7.7
6
92
0
56
8
2
6
82
0.91
156977932--156978114
39
4.6
39
84
3
224
24
22
30
22
1.99
156981226--156981397
67
2.6
66
81
7
170
31
16
29
22
1.96
156981250--156981429
67
2.8
64
77
9
195
28
16
30
23
1.96
156984671--156984707
16
2.3
16
100
0
74
24
13
10
51
1.73
156986266--156986436
93
1.8
93
88
2
263
28
28
21
22
1.99
156986261--156986433
46
3.7
46
77
11
174
28
27
21
22
1.99
156986309--156986452
46
3.1
45
72
18
127
28
27
20
22
1.99
156986859--156986918
30
2.0
30
86
0
84
30
23
8
38
1.84
156989113--156989145
2
16.5
2
100
0
66
48
0
0
51
1.00
156991121--156991245
29
4.3
29
81
5
146
28
29
16
25
1.96
156996167--156996319
39
3.9
39
88
0
216
23
30
21
24
1.99
156996136--156996318
78
2.3
79
89
1
269
22
29
22
24
1.99
157004057--157004199
39
3.7
39
90
2
234
23
30
20
26
1.98
157004017--157004198
77
2.3
79
89
2
269
23
29
21
24
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
157018990--157019169
40
4.5
40
88
2
256
26
21
25
26
2.00
157018990--157019209
80
2.8
81
84
4
270
27
21
25
25
1.99
157018990--157019209
120
1.8
119
82
6
284
27
21
25
25
1.99
157023561--157023732
46
3.7
46
78
11
192
30
27
20
21
1.98
157023565--157023735
93
1.8
93
92
2
290
29
28
20
21
1.98
157029055--157029181
46
2.8
46
90
0
182
33
28
17
21
1.96
157032074--157032099
9
2.9
9
100
0
52
7
23
23
46
1.78
157033473--157033633
55
2.9
54
85
11
202
47
17
20
14
1.83
157033473--157033631
54
2.9
53
84
9
205
46
17
20
15
1.84
157035184--157035279
44
2.2
46
83
9
119
31
13
25
30
1.94
157034782--157035507
177
4.1
175
85
4
892
30
16
24
27
1.97
157034782--157035525
353
2.1
348
83
6
930
30
16
24
27
1.97
157040003--157040144
40
3.6
40
91
2
225
26
27
22
23
2.00
157046307--157046470
71
2.3
71
100
0
328
18
28
17
35
1.94
157046307--157046504
71
2.8
70
91
3
258
20
28
17
33
1.95
157055998--157056181
40
4.6
39
75
6
138
26
23
27
22
2.00
157056038--157056226
80
2.4
81
77
4
186
23
24
29
22
1.99
157064113--157064296
40
4.6
39
75
6
138
26
23
27
22
2.00
157064153--157064341
80
2.4
81
77
4
186
23
24
29
22
1.99
157076678--157076860
40
4.6
40
86
3
253
24
26
23
25
2.00
157084774--157084957
40
4.6
40
80
2
217
26
26
21
25
2.00
157093816--157093885
27
2.5
28
88
2
106
31
25
14
28
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
157103083--157103280
71
2.8
70
92
3
294
33
17
28
20
1.95
157103149--157103266
41
3.1
41
60
28
98
32
17
28
21
1.96
157103117--157103280
71
2.3
71
100
0
328
35
17
28
18
1.94
157110642--157110839
71
2.8
70
92
3
294
33
17
28
20
1.95
157110708--157110825
41
3.1
41
60
28
98
32
17
28
21
1.96
157110676--157110839
71
2.3
71
100
0
328
35
17
28
18
1.94
157121338--157121492
43
3.6
43
94
1
267
31
31
24
12
1.92
157121485--157121568
38
2.2
38
86
0
123
30
26
21
21
1.98
157125365--157125468
31
3.5
31
81
7
115
29
14
25
29
1.95
157125365--157125480
31
3.8
31
79
13
98
31
14
24
30
1.95
157132823--157132852
2
15.0
2
92
0
51
50
3
0
46
1.18
157133301--157133373
31
2.5
29
86
10
96
30
13
26
30
1.94
157133323--157133385
31
2.0
31
90
6
101
34
14
20
30
1.92
157137469--157137595
45
2.9
45
81
8
129
24
26
23
25
2.00
157139282--157139468
71
2.7
68
93
5
281
18
28
18
34
1.95
157139305--157139468
71
2.3
71
100
0
328
18
28
17
35
1.94
157139305--157139502
71
2.8
70
92
3
276
20
28
17
33
1.95
157146847--157147033
71
2.7
68
93
5
281
18
28
18
34
1.95
157146870--157147033
71
2.3
71
100
0
328
18
28
17
35
1.94
157146870--157147067
71
2.8
70
92
3
276
20
28
17
33
1.95
157150620--157150783
71
2.3
71
100
0
328
18
28
17
35
1.94
157150620--157150817
71
2.8
70
91
3
258
20
28
17
33
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
157157701--157157864
71
2.3
71
100
0
328
18
28
17
35
1.94
157157701--157157898
71
2.8
70
91
3
258
20
28
17
33
1.95
157159990--157160065
11
7.5
11
71
16
74
34
11
21
32
1.89
157159989--157160065
20
3.8
20
94
0
136
33
11
20
33
1.89
157160115--157160185
26
2.7
26
91
0
115
28
23
22
25
2.00
157160409--157160473
32
2.0
32
87
0
94
38
16
21
23
1.93
157163984--157164069
40
2.2
40
89
0
127
23
30
25
20
1.99
157165394--157165426
16
1.9
18
88
11
52
0
12
6
81
0.85
157172569--157172755
71
2.7
68
93
5
281
18
28
18
34
1.95
157172592--157172755
71
2.3
71
100
0
328
18
28
17
35
1.94
157172592--157172789
71
2.8
70
92
3
276
20
28
17
33
1.95
157174716--157174882
40
4.2
40
81
3
147
23
26
23
25
2.00
157176113--157176156
23
2.0
22
86
4
61
0
15
2
81
0.78
157176126--157176158
17
1.9
17
93
0
57
0
12
3
84
0.72
157178426--157178526
28
3.5
29
86
6
125
29
27
13
28
1.95
157187212--157187395
40
4.6
40
77
4
138
22
24
29
22
1.99
157187213--157187395
79
2.3
81
78
5
185
22
24
30
22
1.99
157195180--157195328
40
3.8
38
83
6
167
26
22
26
23
2.00
157195219--157195329
37
2.9
38
85
10
145
25
22
27
24
2.00
157198135--157198318
40
4.6
39
75
6
138
26
23
27
22
2.00
157198175--157198363
80
2.4
81
77
4
186
23
24
29
22
1.99
157206252--157206435
40
4.6
39
75
6
138
26
23
27
22
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
157206292--157206480
80
2.4
81
77
4
186
23
24
29
22
1.99
157210593--157210734
40
3.5
40
83
1
124
27
23
26
22
1.99
157210632--157210760
40
3.2
39
84
6
152
24
22
27
25
2.00
157219381--157219464
37
2.3
37
97
0
159
22
34
19
23
1.96
157219511--157219662
48
3.2
48
98
0
286
32
28
5
33
1.81
157219654--157219987
49
6.9
49
93
2
550
29
28
9
33
1.88
157219654--157219987
145
2.3
144
92
2
553
29
28
9
33
1.88
157219654--157219988
96
3.5
96
95
0
580
28
28
9
33
1.88
157230020--157230102
43
1.9
43
83
9
107
32
27
15
24
1.95
157230286--157230324
14
2.7
15
76
8
53
43
10
5
41
1.61

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770