Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          769   770   

This is table  619  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
193879244--193879322
15
5.4
15
77
10
83
10
17
13
58
1.63
193879235--193879321
29
3.0
29
81
8
95
10
17
16
56
1.67
193881698--193881878
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3.9
46
81
9
233
20
21
29
27
1.98
193881700--193881870
93
1.8
93
96
0
315
20
22
29
27
1.98
193885329--193885512
40
4.7
40
80
8
216
24
20
28
26
1.99
193885330--193885509
78
2.3
80
81
6
215
25
21
28
25
1.99
193890742--193890859
40
3.0
40
92
0
200
22
18
28
29
1.98
193894728--193894787
23
2.6
23
91
0
93
40
20
18
21
1.92
193899854--193899905
27
2.0
26
84
3
68
17
26
21
34
1.95
193903982--193904055
29
2.6
29
95
0
139
27
14
31
27
1.95
193904039--193904114
29
2.6
29
78
0
89
22
19
35
22
1.96
193903982--193904114
58
2.3
58
80
2
133
24
17
33
24
1.96
193914428--193914578
40
3.8
40
79
6
155
26
23
27
22
2.00
193914465--193914594
40
3.2
40
81
2
163
23
23
28
24
2.00
193922448--193922598
40
3.8
40
77
13
141
25
24
27
22
2.00
193925089--193925119
16
1.9
16
93
0
53
70
9
9
9
1.33
193926796--193926975
49
3.7
48
74
12
170
33
21
24
20
1.97
193935968--193936008
19
2.2
19
100
0
82
56
4
12
26
1.56
193940456--193940553
28
3.5
28
87
2
117
28
14
27
29
1.95
193940456--193940553
27
3.5
28
88
2
126
28
14
27
29
1.95
193947514--193947681
46
3.6
46
79
10
207
26
30
22
20
1.98
193950056--193950143
29
3.0
29
80
8
97
56
15
17
10
1.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
193950056--193950134
15
5.4
15
77
10
83
58
13
17
10
1.63
193950067--193950143
15
5.2
15
75
9
77
55
15
16
11
1.68
193953092--193953262
93
1.8
93
96
0
315
27
29
22
20
1.98
193953084--193953264
46
3.9
46
81
9
233
27
29
21
20
1.98
193960383--193960564
78
2.3
81
83
6
239
25
28
21
24
1.99
193960381--193960564
40
4.7
40
83
8
234
25
28
21
24
1.99
193962779--193962840
28
2.2
28
86
11
83
35
25
8
30
1.85
193969813--193969882
28
2.5
28
90
9
108
31
27
12
28
1.93
193976324--193976578
55
4.8
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260
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18
25
21
1.95
193976334--193976531
108
1.8
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25
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1.9
16
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53
41
0
22
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24
25
24
25
2.00
193983570--193983776
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2.6
80
81
3
229
24
26
24
25
2.00
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Percent
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Period
Size
Copy
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26
2.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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