Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          769   770   

This is table  593  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
185525212--185525472
94
2.8
91
77
9
244
28
19
28
23
1.98
185525225--185525472
91
2.6
94
77
10
242
28
19
28
23
1.98
185528037--185528170
55
2.4
55
93
0
223
26
15
26
32
1.96
185532413--185532622
40
5.2
40
87
2
305
25
24
28
21
1.99
185540526--185540732
40
5.2
40
85
4
285
25
24
27
22
2.00
185540530--185540732
79
2.6
80
87
3
277
25
25
28
21
1.99
185549789--185549937
80
1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
185549830--185549937
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
185553601--185553664
28
2.3
28
88
0
92
18
14
37
29
1.90
185553612--185553680
28
2.4
28
80
2
75
27
13
36
23
1.92
185553981--185554372
27
14.6
26
76
7
250
38
21
10
29
1.87
185554001--185554346
54
6.5
53
78
6
306
38
20
10
30
1.86
185553981--185554346
81
4.5
81
81
3
391
38
21
10
30
1.86
185553981--185554346
107
3.4
107
81
5
425
38
21
10
30
1.86
185554003--185554346
80
4.3
81
81
4
257
38
20
10
30
1.86
185554309--185554389
27
3.0
27
88
0
117
35
19
18
25
1.95
185556222--185556350
40
3.2
40
80
2
152
24
24
28
23
1.99
185556910--185556974
34
1.9
34
93
0
112
15
47
18
18
1.82
185558377--185558432
20
2.7
21
81
10
62
21
3
1
73
1.08
185569580--185569606
1
27.0
1
100
0
54
100
0
0
0
0.00
185570779--185571064
86
3.3
85
85
2
322
36
21
22
19
1.96
185570826--185570969
44
3.3
43
67
14
116
34
22
24
19
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
185571593--185571657
34
1.9
34
93
0
112
15
47
18
18
1.82
185573059--185573114
20
2.7
21
81
10
62
21
3
1
73
1.08
185581706--185581804
28
3.5
29
94
5
168
32
27
12
28
1.92
185582255--185582293
2
20.0
2
94
5
71
48
0
0
51
1.00
185599260--185599389
40
3.2
40
82
2
172
24
27
23
24
2.00
185599276--185599426
40
3.8
39
81
6
153
22
27
23
27
1.99
185599260--185599426
80
2.1
79
83
7
205
23
26
22
26
2.00
185607267--185607433
40
4.2
40
82
2
185
24
26
22
26
2.00
185615211--185615377
40
4.2
40
82
2
185
24
26
22
26
2.00
185620901--185621486
44
13.4
43
72
13
403
26
24
18
31
1.97
185620900--185621202
133
2.3
128
88
3
446
25
24
18
31
1.98
185621143--185621505
132
2.8
132
87
2
534
26
24
18
30
1.98
185621564--185622318
205
3.7
204
91
2
1162
29
22
17
29
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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28
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
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2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
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20
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
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Score
A
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Entropy
(0-2)
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1.91
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6.9
40
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8
154
27
28
20
24
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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