Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  134  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
39260244--39260352
40
2.8
40
84
1
139
26
22
26
23
2.00
39260284--39260392
39
2.8
38
84
6
130
25
22
28
23
1.99
39268285--39268394
40
2.8
40
85
0
148
26
23
26
23
2.00
39268285--39268434
40
3.8
39
80
7
133
26
22
26
24
2.00
39281114--39281335
47
4.7
47
78
11
233
22
30
19
27
1.98
39281115--39281380
140
1.9
139
81
11
321
22
29
19
28
1.98
39291269--39291359
27
3.3
27
80
4
94
29
27
8
34
1.87
39297890--39297992
29
3.6
28
80
5
116
29
33
16
21
1.95
39306490--39306588
28
3.5
29
82
6
114
28
15
26
30
1.96
39308641--39308748
43
2.6
41
77
10
110
29
15
26
27
1.96
39309859--39309909
20
2.5
20
100
0
102
23
45
27
3
1.70
39316848--39317049
44
4.7
44
86
1
257
25
15
27
31
1.96
39316848--39317054
85
2.4
87
84
2
274
25
15
27
31
1.96
39317794--39317838
22
2.0
24
82
8
58
33
4
26
35
1.77
39319598--39319686
35
2.5
35
87
3
117
37
25
15
21
1.93
39324262--39324307
23
2.0
23
100
0
92
39
13
13
34
1.83
39325021--39325060
21
1.9
21
89
0
62
57
0
12
30
1.36
39328026--39328055
11
2.6
12
89
10
53
60
26
0
13
1.34
39328591--39328666
38
2.0
38
89
0
116
34
22
14
28
1.93
39334010--39334154
40
3.6
40
85
4
193
26
25
25
22
2.00
39335600--39335921
48
6.9
47
71
14
211
23
29
19
27
1.98
39335648--39335820
87
2.0
87
85
2
231
22
30
19
28
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
39347828--39348025
40
4.9
40
89
3
267
27
20
25
26
1.99
39347828--39348053
40
5.7
40
86
4
246
26
21
25
26
1.99
39355228--39355306
27
3.2
27
60
29
66
26
29
20
24
1.99
39355204--39355375
47
3.7
47
87
9
237
28
28
20
22
1.99
39364898--39365074
46
3.9
44
80
11
203
22
20
28
28
1.99
39364895--39365066
93
1.8
93
93
0
299
21
21
29
27
1.99
39369553--39369733
40
4.6
40
87
3
242
24
26
24
24
2.00
39377635--39377857
40
5.6
40
85
7
301
25
26
23
24
2.00
39384558--39384813
40
6.4
40
89
2
349
26
26
21
24
1.99
39386928--39387098
93
1.8
93
91
0
279
29
28
20
22
1.98
39386923--39387095
46
3.7
46
78
13
192
30
27
20
22
1.98
39387518--39387577
30
2.0
30
83
0
75
31
26
5
36
1.78
39390155--39390305
39
3.8
39
93
0
239
21
31
23
23
1.99
39400923--39401071
80
1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
39400964--39401071
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
39407290--39407453
71
2.3
71
100
0
328
18
28
17
35
1.94
39407290--39407487
71
2.8
70
91
3
258
20
28
17
33
1.95
39408937--39409096
29
5.5
29
86
6
207
28
25
13
33
1.93
39408937--39409096
59
2.8
57
88
4
214
28
25
13
33
1.93
39413953--39414040
29
3.0
29
83
3
104
21
22
14
40
1.90
39426648--39426675
2
14.0
2
100
0
56
50
0
0
50
1.00
39443823--39444231
46
8.8
45
75
13
330
28
18
29
23
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
39443829--39444277
140
3.2
139
79
7
421
28
18
29
24
1.98
39443829--39444277
187
2.4
187
93
1
742
28
18
29
24
1.98
39443824--39444277
47
9.7
45
77
7
315
27
18
29
24
1.98
39448617--39448641
11
2.3
11
100
0
50
52
24
0
24
1.48
39449520--39449620
31
2.9
35
81
17
129
22
22
14
39
1.91
39449543--39449636
31
3.1
31
96
1
172
23
21
15
39
1.92
39449828--39449969
24
6.0
24
90
5
200
26
22
21
28
1.99
39449828--39449968
47
3.0
48
89
6
198
26
22
21
28
1.99
39449827--39449969
71
2.0
71
87
5
209
26
22
21
29
1.99
39450020--39450079
20
3.0
20
95
0
111
33
20
10
36
1.86
39450020--39450074
11
5.4
11
70
16
55
30
20
10
38
1.87
39450122--39450168
24
2.0
24
86
0
67
25
17
25
31
1.97
39457326--39457443
31
3.5
35
89
9
135
22
23
16
37
1.94
39457349--39457443
31
3.1
31
98
0
181
23
22
15
38
1.92
39457634--39457751
24
5.0
24
87
7
161
27
22
21
28
1.99
39457634--39457751
47
2.5
47
87
6
159
27
22
21
28
1.99
39457802--39457861
20
3.0
20
95
0
111
33
20
10
36
1.86
39457802--39457856
11
5.4
11
70
16
55
30
20
10
38
1.87
39457904--39457950
24
2.0
24
86
0
67
25
17
25
31
1.97
39462530--39462891
48
7.6
47
74
13
237
25
29
17
27
1.97
39462530--39462942
46
8.7
47
75
13
232
24
29
18
28
1.98
39462530--39462940
94
4.3
94
75
13
328
24
29
18
28
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
39464344--39464397
22
2.5
22
87
3
74
18
37
31
12
1.89
39467351--39467538
96
2.0
96
86
0
268
31
19
14
34
1.92
39471437--39471612
46
3.8
46
78
4
210
29
29
19
21
1.98
39475775--39475808
16
2.1
16
88
5
50
64
5
23
5
1.38
39477437--39477533
49
2.0
49
81
0
113
27
14
30
26
1.95
39478388--39478486
46
2.2
46
83
7
121
32
9
12
46
1.72
39479373--39479411
20
2.0
20
84
0
51
17
28
17
35
1.94
39481512--39481725
42
5.1
42
77
7
166
29
12
23
34
1.91
39481494--39481660
84
2.0
84
85
2
228
28
11
23
35
1.91
39481491--39481725
126
1.9
126
92
1
400
29
12
23
34
1.92
39482565--39482593
8
3.8
8
90
9
51
51
13
0
34
1.42
39482565--39482595
15
2.1
15
100
0
62
54
12
0
32
1.38
39490834--39490891
10
5.5
11
75
17
52
29
0
1
68
0.99
39490832--39490898
22
3.1
22
68
21
61
29
0
1
68
0.98
39492705--39492729
11
2.3
11
100
0
50
0
8
0
92
0.40
39492804--39492845
21
2.0
21
90
9
68
42
9
19
28
1.82
39493584--39493693
42
2.6
42
79
2
105
28
13
20
37
1.91
39495513--39495610
24
4.0
24
89
1
142
37
5
36
20
1.75
39506089--39506345
40
6.5
40
89
2
342
24
28
23
22
2.00
39510636--39510733
24
4.0
24
87
1
142
34
5
38
21
1.76
39516916--39516979
30
2.2
30
88
2
94
35
20
15
28
1.93
39518176--39518223
25
1.9
25
86
0
69
33
25
16
25
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
39518260--39518306
20
2.3
20
100
0
94
36
10
19
34
1.86
39518357--39518474
47
2.5
46
85
10
150
29
22
22
26
1.99
39518355--39518474
23
5.0
24
82
12
142
30
21
21
25
1.98
39518666--39518729
31
2.1
31
87
0
92
35
14
23
26
1.93
39526242--39526289
25
1.9
25
86
0
69
33
25
16
25
1.96
39526326--39526372
20
2.3
20
100
0
94
36
10
19
34
1.86
39526422--39526539
23
5.0
24
81
14
138
30
22
21
25
1.99
39526422--39526539
47
2.5
48
83
9
145
30
22
21
25
1.99
39526732--39526795
31
2.1
31
90
0
101
35
15
23
25
1.94
39531167--39531209
22
1.9
23
90
4
70
79
11
2
6
1.02
39532974--39533084
42
2.6
42
80
2
125
30
13
27
28
1.94
39535625--39535777
3
50.7
3
78
8
132
66
3
4
26
1.27
39536057--39536087
16
2.0
16
93
6
55
0
0
67
32
0.91
39538551--39538779
29
7.9
29
85
1
291
19
28
12
39
1.88
39540851--39540896
21
2.1
22
92
4
76
82
6
8
2
0.91
39544216--39544262
20
2.4
20
79
13
62
82
6
8
2
0.90
39548725--39548822
44
2.2
44
90
0
151
29
22
19
28
1.98
39550934--39551009
29
2.7
28
80
8
91
23
19
28
27
1.98
39552333--39552450
41
3.1
41
60
28
98
32
17
28
21
1.96
39552301--39552464
71
2.3
71
100
0
328
35
17
28
18
1.94
39557610--39557699
29
3.1
28
87
7
128
27
13
27
31
1.94
39561580--39561655
28
2.7
27
92
8
125
23
15
31
28
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
39563563--39563808
49
4.9
50
83
4
309
26
18
26
28
1.98
39563668--39563751
28
3.2
28
65
25
83
23
16
29
29
1.96
39574812--39574855
21
2.1
21
100
0
88
54
13
18
13
1.71
39577963--39578234
29
9.3
29
76
7
201
23
25
12
38
1.90
39577963--39578234
58
4.7
58
76
6
228
23
25
12
38
1.90
39585732--39585861
40
3.2
40
81
2
163
24
28
23
23
2.00
39593746--39593875
40
3.2
40
81
2
163
24
28
23
23
2.00
39598811--39599033
40
5.6
39
78
10
197
24
28
21
25
1.99
39598813--39599033
79
2.8
79
85
8
295
24
28
22
25
1.99
39616597--39616767
93
1.8
93
92
2
290
28
26
22
22
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770