Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  70  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20646593--20646753
27
6.0
27
85
1
207
33
19
21
24
1.97
20646584--20646752
54
3.2
53
89
0
248
34
18
20
26
1.95
20646958--20647027
25
2.8
25
93
0
113
25
27
22
24
2.00
20646957--20647040
25
3.4
24
83
8
98
28
23
22
25
1.99
20646958--20647052
50
1.9
50
80
8
113
27
25
23
24
2.00
20647248--20647450
31
6.5
31
92
0
334
30
16
24
28
1.97
20649717--20650130
27
15.3
27
79
5
347
39
20
8
30
1.82
20649717--20650129
54
7.6
54
81
6
417
39
20
8
30
1.82
20649738--20650130
81
4.8
81
83
4
454
39
20
8
31
1.83
20650151--20650317
27
6.2
27
86
3
212
34
17
20
27
1.95
20650149--20650316
81
2.1
80
87
1
246
35
16
20
27
1.94
20650523--20650603
25
3.2
25
85
3
83
30
20
23
24
1.99
20650523--20650584
25
2.5
25
91
0
97
27
24
24
24
2.00
20650813--20650891
31
2.5
31
95
0
149
30
18
24
26
1.98
20654811--20654987
40
4.4
40
83
4
225
23
22
27
26
1.99
20655216--20655260
22
2.0
22
87
8
65
33
8
13
44
1.75
20657040--20657086
21
2.2
21
77
7
51
19
17
14
48
1.81
20657058--20657150
21
4.5
21
81
2
91
16
23
18
41
1.89
20657712--20657756
21
2.1
21
91
0
72
22
6
28
42
1.79
20660247--20660299
16
3.3
15
78
5
52
56
0
3
39
1.17
20667461--20667487
12
2.2
12
100
0
54
29
14
18
37
1.91
20668358--20668441
28
3.2
28
65
25
83
23
16
29
29
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20668310--20668498
50
3.8
49
82
2
207
25
17
27
29
1.98
20670809--20671021
46
4.6
48
79
5
215
24
27
16
30
1.97
20670809--20671021
94
2.3
91
84
9
270
24
27
16
30
1.97
20676145--20676318
40
4.3
40
91
3
280
22
21
29
25
1.99
20676145--20676318
81
2.2
79
91
4
278
22
21
29
25
1.99
20681242--20681501
40
6.6
40
88
1
373
23
19
29
28
1.98
20683914--20683952
21
1.9
20
84
5
51
23
28
35
12
1.91
20689510--20689569
29
2.1
29
87
0
84
33
6
11
48
1.66
20691201--20691239
15
2.6
14
84
8
51
20
5
5
69
1.28
20706414--20706601
83
2.2
84
88
0
279
26
22
23
27
2.00
20707330--20707369
21
1.9
21
89
0
62
27
0
20
52
1.46
20707930--20708160
48
4.8
48
84
2
284
22
19
25
32
1.97
20707930--20708171
96
2.5
96
84
1
315
23
18
26
32
1.97
20712650--20712684
18
2.0
18
88
5
54
20
31
37
11
1.88
20717389--20717625
118
2.0
118
98
0
456
22
23
26
27
1.99
20717642--20717675
16
2.1
16
100
0
68
11
50
20
17
1.77
20723805--20724057
125
2.0
127
83
6
325
24
38
1
35
1.63
20724324--20724361
18
2.1
18
85
9
51
36
5
0
57
1.21
20725591--20725622
16
2.1
16
94
5
57
46
6
6
40
1.54
20725891--20725938
14
3.4
14
77
5
51
68
4
0
27
1.07
20731245--20731277
17
1.9
17
88
11
50
36
0
6
57
1.23
20734472--20734559
33
2.7
33
74
10
92
30
9
26
34
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20736910--20737036
45
2.7
47
86
4
177
26
18
31
23
1.97
20742852--20743073
46
4.7
46
80
9
225
28
19
28
23
1.98
20742852--20743115
94
2.8
94
82
8
302
28
19
28
23
1.98
20742852--20743115
46
5.6
49
78
9
199
28
19
28
23
1.98
20749791--20749975
79
2.3
82
83
7
229
24
24
27
23
2.00
20749792--20749983
40
4.8
40
79
7
151
24
24
28
22
2.00
20749791--20750008
79
2.7
79
79
6
183
24
23
27
24
2.00
20757779--20757963
40
4.6
39
81
4
149
24
24
27
23
2.00
20757779--20757963
79
2.3
82
82
7
220
24
24
27
23
2.00
20757779--20757996
79
2.7
79
78
6
174
25
23
27
24
2.00
20760240--20760307
28
2.4
28
90
2
100
44
8
14
32
1.76
20764245--20764289
23
2.0
21
91
8
72
73
0
0
26
0.84
20764245--20764302
23
2.7
23
84
7
68
68
3
1
25
1.14
20764833--20765363
280
1.9
278
87
2
769
35
16
14
33
1.89
20766729--20766758
2
15.0
2
100
0
60
50
0
0
50
1.00
20774753--20774800
23
2.1
23
84
3
62
33
6
0
60
1.22
20774767--20774818
23
2.2
24
83
10
63
38
0
0
61
0.96
20776969--20777026
30
1.9
30
100
0
116
43
13
12
31
1.81
20783099--20783124
13
2.0
13
100
0
52
38
0
15
46
1.46
20783217--20783251
17
2.1
17
88
0
52
54
0
2
42
1.15
20783745--20783783
21
1.9
21
94
5
71
30
5
0
64
1.15
20784199--20784228
7
4.3
7
100
0
60
46
13
13
26
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20784228--20784273
2
23.0
2
100
0
92
50
0
0
50
1.00
20786140--20786173
3
11.3
3
100
0
68
67
0
0
32
0.91
20791349--20791430
20
4.0
20
76
14
85
37
15
23
23
1.93
20791308--20791436
43
2.9
44
81
6
145
37
17
20
24
1.94
20791499--20791582
24
3.5
24
83
1
116
39
16
14
29
1.88
20794676--20794721
19
2.3
19
85
7
65
67
4
0
28
1.10
20794774--20794811
20
2.0
20
90
10
62
52
7
5
34
1.53
20796758--20796838
27
3.0
26
75
10
67
58
2
6
33
1.36
20797240--20797290
26
2.0
26
96
0
93
25
13
3
56
1.54
20797904--20797954
19
2.7
19
78
6
59
27
0
3
68
1.07
20802045--20802133
42
2.1
42
91
0
142
50
13
5
30
1.64
20802150--20802197
19
2.6
19
96
3
89
45
8
4
41
1.53
20814354--20814402
18
2.6
19
78
12
57
24
24
30
20
1.98
20816169--20816314
40
3.7
40
83
0
166
25
26
21
26
2.00
20818128--20818190
26
2.4
27
86
5
92
25
22
20
31
1.98
20818134--20818184
26
2.0
26
96
0
93
21
25
23
29
1.99
20822807--20822875
24
2.8
24
74
14
68
39
2
13
44
1.58
20822807--20822909
51
2.0
51
88
0
152
38
4
10
45
1.60
20842333--20842363
16
1.9
16
93
0
53
54
12
6
25
1.62
20847761--20847968
53
3.9
54
81
6
235
23
23
17
35
1.95
20847762--20847960
108
1.8
109
86
3
294
23
23
17
35
1.95
20847947--20848068
47
2.6
47
92
0
199
27
23
13
36
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20848831--20848888
30
1.9
31
85
3
82
32
24
8
34
1.86
20855646--20855720
19
3.8
19
73
16
55
73
2
2
21
1.08
20855641--20855720
40
2.0
41
85
7
110
72
2
3
21
1.12
20855967--20856023
30
1.9
30
92
0
96
19
29
29
21
1.97
20861049--20861166
57
2.1
58
85
1
157
31
26
18
23
1.98
20862465--20862531
35
1.9
35
87
0
98
26
2
28
41
1.70
20862589--20862718
35
3.9
34
77
15
144
38
0
19
41
1.57
20862588--20862824
34
7.7
29
69
23
139
38
1
18
42
1.58
20862703--20862753
21
2.4
22
90
3
77
43
1
15
39
1.58
20862640--20862817
85
2.1
88
90
3
281
38
1
17
41
1.60
20862915--20863421
126
4.0
126
88
2
707
39
16
16
27
1.90
20862915--20863421
251
2.0
253
88
1
750
39
16
16
27
1.90
20866428--20866509
25
3.0
28
68
26
75
52
4
0
42
1.23
20866945--20867003
30
2.0
30
93
0
100
6
13
45
33
1.70
20868575--20868618
21
2.1
21
82
0
52
38
0
25
36
1.56
20873739--20873773
6
5.8
6
100
0
70
0
14
0
85
0.59
20886625--20886761
40
3.4
40
83
0
166
29
11
21
36
1.89
20886726--20886956
79
2.9
78
85
5
304
32
13
21
32
1.92
20886726--20886956
78
2.9
78
87
3
313
32
13
21
32
1.92
20889171--20889200
15
2.0
15
93
0
51
70
6
3
20
1.25
20895540--20895574
18
1.9
18
94
0
61
22
5
5
65
1.36
20898920--20898967
12
3.8
12
79
15
60
62
14
0
22
1.32
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20898915--20898971
27
2.1
27
100
0
114
57
14
0
28
1.37
20902038--20902098
28
2.2
28
93
0
104
44
6
6
42
1.56
20914240--20914297
17
3.2
17
75
7
53
32
15
1
50
1.55
20916869--20916938
36
1.9
36
82
5
88
37
2
8
51
1.47
20919290--20919336
14
3.6
14
80
16
64
4
31
0
63
1.13
20919290--20919338
25
2.0
25
95
0
89
4
30
0
65
1.11
20922700--20922805
11
9.5
11
73
10
74
26
5
1
66
1.25
20923760--20923841
31
2.8
28
77
15
76
36
8
10
43
1.71
20924796--20924840
18
2.4
18
81
3
54
33
11
0
55
1.35
20927889--20927931
22
2.0
22
95
0
77
39
11
0
48
1.40

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770