Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  689  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
217196305--217196403
27
3.5
28
87
4
119
29
14
27
29
1.95
217204783--217204855
29
2.5
29
93
0
128
28
15
30
26
1.96
217204839--217204915
29
2.7
29
77
0
82
22
18
35
24
1.96
217204783--217204915
58
2.3
59
81
5
146
25
16
33
24
1.96
217212555--217212627
29
2.5
29
93
0
128
28
15
30
26
1.96
217212611--217212687
29
2.7
29
77
0
82
22
18
35
24
1.96
217212555--217212687
58
2.3
59
81
5
146
25
16
33
24
1.96
217215292--217215588
40
7.5
40
92
3
410
24
28
23
23
1.99
217223484--217223739
40
6.5
40
89
5
355
25
28
22
22
1.99
217223484--217223739
118
2.2
119
86
7
353
25
28
22
22
1.99
217226966--217226995
12
2.6
12
94
5
53
40
0
26
33
1.57
217228946--217229076
29
4.6
29
83
2
131
25
17
32
24
1.97
217228946--217229017
28
2.5
28
95
2
126
27
15
30
26
1.96
217231336--217231479
39
3.7
40
84
0
175
23
22
29
23
1.99
217235958--217236088
29
4.6
29
83
2
131
25
17
32
24
1.97
217235958--217236029
28
2.5
28
95
2
126
27
15
30
26
1.96
217243682--217243812
29
4.6
29
83
2
131
25
17
32
24
1.97
217243682--217243753
28
2.5
28
95
2
126
27
15
30
26
1.96
217251399--217251528
29
4.6
29
82
3
122
25
17
33
23
1.97
217251399--217251469
27
2.6
27
93
4
115
28
15
30
25
1.96
217255072--217255255
40
4.6
39
75
6
138
26
23
27
22
2.00
217255112--217255300
80
2.4
81
77
4
186
23
24
29
22
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
217266269--217266494
68
3.4
65
79
11
230
23
28
16
30
1.96
217274300--217274369
30
2.4
29
85
4
88
31
27
14
27
1.95
217281534--217281586
2
27.0
2
85
11
74
50
1
1
45
1.23
217282103--217282259
39
4.0
39
92
4
244
29
20
3
46
1.66
217282272--217282315
23
1.9
23
85
0
61
40
9
2
47
1.48
217283373--217283735
44
8.3
43
75
10
306
25
24
19
31
1.98
217283365--217283671
132
2.3
132
93
1
528
25
25
18
30
1.98
217283558--217283735
88
2.0
88
98
0
347
24
23
20
31
1.98
217283373--217283803
220
2.0
219
84
5
566
25
24
18
31
1.97
217284838--217285120
135
2.1
136
95
0
514
31
25
18
25
1.97
217285128--217285175
21
2.3
21
85
7
62
33
52
2
12
1.51
217286902--217287010
26
4.2
26
92
1
175
36
23
5
33
1.78
217291881--217291923
12
3.6
12
100
0
86
13
51
25
9
1.71
217293175--217293442
132
2.0
133
97
2
511
32
23
18
25
1.97
217295225--217295334
26
4.2
26
92
0
175
37
23
5
33
1.78
217308823--217308875
26
2.1
26
89
6
83
35
3
18
41
1.69
217308831--217308890
26
2.3
26
91
5
95
23
5
18
53
1.64
217309366--217309411
3
15.7
3
95
4
85
34
0
0
65
0.93
217309626--217309668
16
2.8
15
86
6
59
30
6
0
62
1.21
217309772--217309803
16
2.0
16
93
0
55
21
21
6
50
1.71
217309815--217309846
13
2.6
13
90
9
50
25
6
3
65
1.31
217309998--217310057
22
2.8
21
80
5
59
18
6
6
68
1.35
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
217310007--217310061
19
2.8
20
77
17
62
18
5
7
69
1.32
217316201--217316300
49
2.0
49
100
0
200
35
22
17
26
1.95
217321904--217323094
205
5.9
205
94
2
2055
29
18
22
29
1.97
217321904--217323094
409
2.9
409
95
1
2112
29
18
22
29
1.97
217323428--217323456
11
2.6
11
100
0
58
82
10
0
6
0.83
217323502--217323593
46
2.0
47
97
2
177
48
15
10
25
1.77
217323693--217323741
23
2.1
23
92
0
80
28
4
24
42
1.73
217324198--217324261
12
5.1
13
71
19
55
31
7
1
59
1.35
217324304--217324364
22
2.8
22
80
2
61
18
6
6
68
1.33
217337864--217337893
14
2.1
15
93
6
53
16
6
13
63
1.50
217342850--217342876
2
13.5
2
100
0
54
48
0
0
51
1.00
217343117--217343242
39
3.2
39
88
4
191
26
27
20
25
1.99
217343083--217343242
78
2.1
78
84
4
207
26
26
21
25
1.99
217350790--217351214
27
15.7
27
84
1
501
39
19
9
31
1.84
217350790--217351229
54
8.1
54
87
0
567
39
19
9
31
1.84
217351256--217351495
27
8.9
27
88
1
313
37
18
20
23
1.94
217351258--217351500
81
3.0
81
89
2
355
37
18
19
23
1.94
217351834--217351893
27
2.3
27
85
2
77
21
23
20
35
1.96
217351725--217351866
71
2.1
67
85
5
185
19
27
22
30
1.98
217352012--217352130
6
19.3
6
69
17
66
17
17
15
48
1.81
217352015--217352073
25
2.4
25
94
0
100
18
20
15
45
1.85
217352041--217352121
37
2.2
37
84
0
108
16
17
16
50
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
217354512--217354734
40
5.6
40
90
1
331
22
23
27
26
2.00
217364485--217364509
2
12.5
2
100
0
50
52
0
0
48
1.00
217365444--217365482
20
2.0
20
100
0
78
41
28
5
25
1.77
217366527--217366587
30
2.0
30
83
0
77
31
22
8
37
1.84
217369908--217369943
16
2.2
16
100
0
72
47
30
0
22
1.52
217370986--217371046
30
2.0
30
83
0
77
31
22
8
37
1.84
217372583--217372608
12
2.2
12
100
0
52
50
0
23
26
1.50
217373128--217373175
25
1.9
25
86
0
69
33
25
16
25
1.96
217373219--217373277
20
3.0
20
92
0
100
37
11
20
30
1.89
217373328--217373399
24
3.0
24
83
6
92
27
20
25
26
1.99
217373591--217373692
31
3.1
31
78
17
123
39
15
21
23
1.92
217373608--217373715
38
2.8
38
94
1
189
39
14
22
23
1.91
217381786--217381957
93
1.8
93
96
0
317
27
30
22
20
1.98
217381778--217381953
46
3.8
46
81
10
232
28
29
21
20
1.98
217384336--217384424
30
3.0
30
80
8
101
57
15
16
10
1.65
217384336--217384415
15
5.4
15
80
7
92
58
13
17
10
1.62
217384347--217384424
15
5.2
15
78
9
79
56
15
16
11
1.67
217387372--217387543
93
1.8
93
96
0
317
27
30
22
20
1.98
217387364--217387539
46
3.8
46
81
10
232
28
29
21
20
1.98
217392191--217392260
27
2.5
28
83
2
88
32
24
15
27
1.95
217392268--217392374
42
2.5
42
96
0
196
22
33
14
28
1.94
217397702--217397836
29
4.7
29
86
3
155
23
31
15
29
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
217397648--217397837
58
3.3
58
77
4
179
24
33
16
26
1.96
217405803--217405937
29
4.7
29
86
3
155
23
31
15
29
1.95
217405749--217405938
58
3.3
58
77
4
179
24
33
16
26
1.96
217413896--217414030
29
4.7
29
86
3
155
23
31
15
29
1.95
217413842--217414031
58
3.3
58
77
4
179
24
33
16
26
1.96
217415552--217415577
11
2.4
11
100
0
52
23
19
7
50
1.73
217419337--217419459
37
3.3
37
98
0
237
23
31
19
25
1.98
217419504--217419996
48
10.6
47
84
8
588
31
27
8
33
1.86
217419504--217419996
96
5.3
96
90
8
831
31
27
8
33
1.86
217419659--217419727
33
2.1
34
94
5
124
33
26
8
31
1.87
217419612--217419775
80
2.0
81
96
3
305
32
26
8
32
1.87
217421504--217421528
13
1.9
13
100
0
50
36
16
16
32
1.90
217423671--217423890
39
5.6
40
92
4
369
26
28
20
24
1.99
217423675--217424007
40
8.5
39
84
9
320
27
28
20
24
1.99
217425926--217426048
37
3.3
37
98
0
237
23
31
19
25
1.98
217426093--217426554
48
9.6
48
98
0
879
31
27
8
33
1.86
217428061--217428085
13
1.9
13
100
0
50
36
16
16
32
1.90
217430002--217430051
24
2.0
25
88
3
75
30
32
8
30
1.86
217430228--217430455
79
2.8
80
89
5
343
25
28
20
25
1.99
217430228--217430455
40
5.6
40
89
6
343
25
28
20
25
1.99
217430228--217430572
79
4.3
81
80
10
323
26
28
20
24
1.99
217430424--217430572
40
3.7
40
79
5
149
27
28
20
23
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
217432491--217432613
37
3.3
37
98
0
237
23
31
19
25
1.98
217432658--217433119
48
9.6
48
98
0
879
31
27
8
33
1.86
217434627--217434651
13
1.9
13
100
0
50
36
16
16
32
1.90
217436570--217436619
24
2.0
25
88
3
75
30
32
8
30
1.86
217436796--217437023
40
5.6
40
88
7
327
26
28
20
25
1.99
217436796--217437023
79
2.8
80
88
6
327
26
28
20
25
1.99
217436796--217437140
79
4.3
81
79
12
307
26
28
20
24
1.99
217436992--217437140
40
3.7
40
79
5
149
28
27
20
23
1.99
217436997--217437144
80
1.9
80
84
2
199
27
27
20
25
1.99
217439059--217439181
37
3.3
37
98
0
237
23
31
19
25
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770