Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          769   770   

This is table  643  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
202064288--202064507
83
2.7
80
86
5
284
23
24
27
25
2.00
202071219--202071348
29
4.5
29
86
6
165
31
13
26
28
1.94
202074559--202074694
29
4.7
29
86
3
157
24
30
15
29
1.95
202074534--202074693
58
2.8
58
81
0
176
23
33
15
27
1.95
202075338--202075630
142
2.1
140
96
2
543
39
29
9
21
1.85
202082440--202082574
29
4.7
29
84
5
148
23
31
15
29
1.95
202082415--202082573
57
2.8
58
79
1
167
23
33
15
27
1.95
202088349--202088449
28
3.5
28
86
6
114
29
26
13
29
1.94
202097755--202097857
29
3.6
28
81
5
116
21
16
33
29
1.95
202104923--202105113
40
4.8
39
77
7
154
24
23
27
24
2.00
202104922--202105106
79
2.3
82
81
7
211
24
23
27
24
2.00
202106513--202106557
21
2.1
21
95
0
81
31
24
17
26
1.97
202108774--202108918
40
3.6
40
77
6
134
28
24
26
20
1.99
202108812--202108941
40
3.2
40
81
4
156
23
24
27
23
2.00
202117466--202117572
38
2.8
39
85
7
130
20
29
25
24
1.99
202124642--202124772
40
3.3
40
79
6
158
24
27
22
25
2.00
202124658--202124809
40
3.8
40
77
10
141
23
26
22
27
1.99
202127262--202127356
32
3.0
32
88
0
127
28
24
10
36
1.88
202127434--202127529
28
3.4
28
79
0
111
22
25
20
31
1.98
202127399--202127560
56
2.9
56
81
3
184
24
27
17
30
1.97
202127459--202127560
28
3.6
28
81
5
125
24
31
16
27
1.96
202129328--202129354
2
13.5
2
100
0
54
51
0
0
48
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
202133721--202133768
23
2.1
23
100
0
96
27
14
16
41
1.87
202134405--202134440
18
2.0
18
100
0
72
44
16
5
33
1.71
202137758--202137797
21
2.0
20
90
5
62
35
0
22
42
1.54
202137763--202137805
21
2.1
21
83
12
54
32
2
20
44
1.65
202138286--202138475
41
4.5
42
72
15
144
24
14
26
34
1.94
202138283--202138375
46
2.0
46
89
2
143
27
13
21
36
1.92
202142919--202142972
19
2.8
19
83
5
65
72
0
9
18
1.11
202149000--202149088
30
3.0
30
80
8
101
57
15
16
10
1.65
202149000--202149079
15
5.4
15
80
7
92
58
13
17
10
1.62
202149011--202149088
15
5.2
15
78
9
79
56
15
16
11
1.67
202152024--202152196
46
3.8
46
79
14
214
28
29
21
20
1.98
202152032--202152201
91
1.8
92
94
2
306
27
30
22
20
1.98
202154573--202154661
30
3.0
30
80
8
101
57
15
16
10
1.65
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Size
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Percent
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Size
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Percent
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Copy
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20
25
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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