genome.fa.s14.2.7.7.80.10.50.1000.675.html

Tandem Repeats Finder Program written by:

Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          769   770   

This is table  675  of  770  ( 92376 repeats found )

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Table Explanation

Indices	Period Size	Copy Number	Consensus Size	Percent Matches	Percent Indels	Score	A	C	G	T	Entropy (0-2)
212547750--212547829	15	5.4	15	80	7	92	58	13	17	10	1.62
212547761--212547838	15	5.2	15	78	9	79	56	15	16	11	1.67
212550791--212550962	93	1.8	93	96	0	317	27	30	22	20	1.98
212550783--212550958	46	3.8	46	81	10	232	28	29	21	20	1.98
212553937--212554131	91	2.1	91	85	2	248	29	23	12	34	1.91
212556345--212556369	10	2.5	10	100	0	50	80	0	0	20	0.72
212556889--212556964	31	2.6	27	71	20	64	52	6	3	36	1.46
212562702--212562775	29	2.6	29	89	4	105	25	16	32	25	1.96
212570450--212570523	29	2.6	29	89	4	105	25	16	32	25	1.96
212570641--212570714	29	2.6	29	89	4	105	25	16	32	25	1.96
212570364--212570739	191	2.0	191	98	0	734	26	12	31	29	1.93
212574604--212574805	40	5.1	39	84	7	214	25	26	21	26	1.99
212581959--212582142	40	4.6	39	75	6	138	26	23	27	22	2.00
212581999--212582187	80	2.4	81	77	4	186	23	24	29	22	1.99
212590162--212590250	34	2.5	34	87	7	115	22	24	16	35	1.95
212590442--212590535	24	4.0	24	84	12	115	26	24	20	28	1.99
212590586--212590645	20	3.0	20	90	0	102	31	20	11	36	1.88
212590688--212590735	25	1.9	25	86	0	69	25	16	25	33	1.96
212598435--212598528	38	2.4	38	92	1	152	21	23	18	37	1.94
212598720--212598814	24	4.0	24	85	10	124	26	24	21	28	1.99
212598720--212598813	47	2.0	49	85	12	133	26	24	21	27	1.99
212598865--212598924	20	3.0	20	90	0	102	31	20	11	36	1.88
Indices	Period Size	Copy Number	Consensus Size	Percent Matches	Percent Indels	Score	A	C	G	T	Entropy (0-2)
212598967--212599014	25	1.9	25	86	0	69	25	16	25	33	1.96
212604470--212604637	43	4.0	42	85	4	221	23	17	27	30	1.97
212604480--212604642	84	1.9	84	88	0	245	23	17	28	30	1.97
212607746--212607867	47	2.6	47	90	0	190	38	13	22	26	1.90
212607846--212608246	54	7.6	54	73	13	320	35	15	24	23	1.94
212607854--212608246	55	7.5	52	75	11	290	35	16	24	23	1.94
212607799--212608210	204	2.0	204	94	0	718	35	14	25	25	1.93
212612608--212612705	28	3.5	28	84	4	108	29	16	24	29	1.96
212619995--212620168	40	4.4	39	76	7	136	29	21	25	22	1.99
212625293--212625531	99	2.4	99	85	2	320	28	28	18	24	1.98
212625301--212625524	49	4.5	49	87	2	306	29	27	17	25	1.98
212627038--212627830	205	3.9	206	89	1	1178	31	17	21	29	1.96
212628214--212628292	19	4.2	19	90	9	126	37	10	15	36	1.81
212628204--212628291	36	2.4	36	82	17	128	38	10	14	36	1.80
212631336--212631375	20	2.0	21	85	5	55	25	5	20	50	1.68
212634140--212634177	18	2.1	18	85	9	51	73	5	2	18	1.14
212634258--212634303	23	2.0	23	83	12	58	45	0	4	50	1.21
212635875--212636189	119	2.6	119	90	0	468	27	20	19	33	1.96
212635998--212636383	202	1.9	202	88	0	583	29	19	17	32	1.95
212636196--212636549	119	3.0	119	93	0	593	30	19	16	33	1.93
212635865--212636493	321	2.0	322	90	0	990	28	19	17	34	1.95
212647480--212647517	19	2.0	19	85	10	51	26	5	2	65	1.27
Indices	Period Size	Copy Number	Consensus Size	Percent Matches	Percent Indels	Score	A	C	G	T	Entropy (0-2)
212647523--212647569	19	2.6	18	83	12	60	38	0	4	57	1.18
212649696--212649765	27	2.6	27	95	2	122	30	27	14	28	1.95
212657672--212657741	27	2.6	27	95	2	122	30	27	14	28	1.95
212665700--212665769	27	2.6	27	95	2	122	30	27	14	28	1.95
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212719598--212719774	41	4.4	41	90	2	277	36	23	22	17	1.95
212719938--212719971	14	2.4	15	85	14	54	32	0	23	44	1.54
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212850206--212850243	19	2.0	20	85	15	53	39	23	0	36	1.55
Indices	Period Size	Copy Number	Consensus Size	Percent Matches	Percent Indels	Score	A	C	G	T	Entropy (0-2)
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212857746--212857914	46	3.7	48	78	15	169	30	27	20	21	1.98
212857746--212857914	91	1.8	93	89	5	272	30	27	20	21	1.98
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Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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