Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  157  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
46090169--46090211
19
2.3
19
100
0
86
18
30
27
23
1.98
46096446--46096754
47
6.7
45
74
10
214
28
20
28
23
1.99
46096448--46096808
94
3.9
93
77
11
335
29
19
28
22
1.98
46097661--46097685
13
1.9
13
100
0
50
8
32
32
28
1.86
46101586--46101619
11
3.0
11
86
4
50
26
0
2
70
1.01
46113129--46113174
23
2.1
22
84
8
58
52
8
0
39
1.33
46115170--46115203
15
2.2
16
89
5
52
29
17
0
52
1.45
46118711--46118811
40
2.5
41
79
9
109
72
2
3
20
1.14
46119045--46119078
16
2.2
16
89
5
52
50
14
8
26
1.72
46131579--46131609
9
3.3
9
95
4
53
80
0
0
19
0.71
46132333--46132379
21
2.2
21
92
0
76
25
19
23
31
1.98
46134319--46134498
48
3.8
48
87
0
261
25
19
28
27
1.99
46134317--46134578
48
5.7
42
76
10
123
25
18
29
27
1.98
46140930--46141302
48
7.9
46
81
7
390
25
19
29
26
1.99
46145876--46145948
27
2.6
28
89
2
112
27
16
27
28
1.97
46145907--46145960
27
2.0
27
82
7
65
29
16
24
29
1.97
46167131--46167305
46
3.8
46
79
11
214
28
29
21
21
1.98
46167139--46167309
92
1.8
93
94
1
308
27
29
21
21
1.98
46167182--46167324
46
3.1
45
73
12
139
29
28
20
21
1.98
46169516--46169622
53
2.0
53
100
0
214
35
20
13
30
1.91
46170213--46170247
11
3.1
11
95
4
61
28
0
0
71
0.86
46170369--46170429
31
2.0
30
87
9
88
57
9
4
27
1.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
46200027--46200264
51
4.7
51
81
3
228
25
16
26
31
1.96
46200027--46200309
51
5.5
51
81
3
205
25
16
27
30
1.96
46203941--46204032
42
2.2
42
86
0
121
27
25
26
21
2.00
46206601--46206633
14
2.5
13
90
9
50
39
0
27
33
1.57
46218038--46218129
27
3.4
27
81
11
116
26
19
10
43
1.84
46218213--46218321
45
2.4
45
79
0
119
22
19
11
45
1.83
46224030--46224103
15
5.1
15
75
9
73
10
16
14
58
1.64
46226501--46226674
45
3.8
45
80
9
208
21
20
29
28
1.98
46234828--46234994
40
4.2
40
82
2
185
24
26
22
26
2.00
46240774--46240851
29
2.7
29
83
0
102
21
33
17
26
1.96
46250958--46251033
27
2.8
26
84
4
80
34
19
22
23
1.97
46251260--46251533
81
3.4
81
86
4
367
27
18
17
36
1.94
46251261--46251533
27
10.1
27
83
6
313
27
19
17
36
1.93
46251519--46252092
27
21.7
27
79
8
585
31
9
20
38
1.85
46256121--46256259
65
2.1
65
95
0
251
28
31
20
18
1.97
46256133--46256274
65
2.2
65
93
2
241
28
28
21
20
1.98
46257783--46257889
42
2.5
42
96
0
196
28
14
33
22
1.94
46257897--46257966
27
2.5
28
86
2
97
27
14
25
32
1.94
46265015--46265121
42
2.5
42
96
0
196
28
14
33
22
1.94
46265129--46265198
27
2.5
28
86
2
97
27
14
25
32
1.94
46267628--46267736
23
4.7
23
75
10
89
33
16
22
27
1.95
46267622--46267715
45
2.1
45
82
7
111
35
17
22
25
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
46268348--46268399
25
2.1
25
100
0
104
51
15
3
28
1.60
46270131--46270164
15
2.3
15
94
0
59
38
14
17
29
1.90
46272122--46272152
16
1.9
16
93
0
53
35
22
0
41
1.54
46272119--46272158
20
2.0
20
85
0
53
37
22
0
40
1.54
46272390--46272586
107
1.8
110
86
5
294
23
25
15
34
1.95
46272343--46272595
55
4.8
52
80
9
209
22
25
16
35
1.94
46279652--46279682
16
1.9
16
93
0
53
35
22
0
41
1.54
46279871--46280124
55
4.8
53
81
9
254
21
25
16
36
1.94
46279918--46280117
108
1.8
109
89
5
316
22
25
17
34
1.96
46288535--46288623
44
2.0
44
89
4
135
38
22
13
25
1.91
46298077--46298181
43
2.4
43
81
4
122
27
10
24
37
1.88
46298088--46298192
43
2.4
43
84
6
124
25
12
25
36
1.91
46301123--46301292
46
3.7
46
79
9
211
21
20
28
29
1.98
46304270--46304327
15
3.9
15
70
17
57
13
17
12
56
1.66
46304268--46304334
30
2.3
30
79
10
75
11
16
13
58
1.64
46307051--46307183
46
2.9
44
78
14
160
24
18
27
30
1.98
46310075--46310137
22
2.9
22
80
7
83
19
0
38
42
1.51
46310075--46310183
22
5.0
22
77
7
82
19
0
40
40
1.51
46311164--46311267
52
2.0
52
96
0
190
26
15
41
16
1.88
46318068--46318235
40
4.2
40
82
3
178
25
26
22
26
2.00
46330122--46330180
20
3.0
20
97
0
109
37
10
20
32
1.86
46330126--46330180
11
5.4
11
70
16
55
38
10
20
30
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
46330231--46330373
24
6.0
24
86
7
184
29
21
22
26
1.99
46330231--46330373
47
3.0
47
85
7
182
29
21
22
26
1.99
46330565--46330628
31
2.1
31
96
0
119
39
15
21
23
1.92
46332398--46332510
40
2.8
40
85
5
147
25
22
27
24
2.00
46332355--46332542
40
4.8
38
75
9
146
28
21
26
23
1.99
46336910--46337072
44
3.9
42
72
11
136
33
26
15
24
1.95
46341742--46341790
22
2.2
20
77
19
53
18
4
26
51
1.64
46343613--46343844
49
4.7
48
78
6
239
29
27
18
25
1.98
46343601--46343844
100
2.5
99
83
4
312
29
27
18
25
1.98
46350019--46350185
43
3.9
43
77
12
182
33
25
13
26
1.94
46356112--46356231
43
2.8
42
77
7
143
28
22
16
32
1.96
46359326--46359383
22
2.6
22
73
23
59
31
0
3
65
1.09
46363004--46363299
48
6.2
49
68
13
174
29
19
27
23
1.99
46364127--46364160
17
2.0
17
94
0
59
29
32
17
20
1.96
46365769--46365839
28
2.6
27
80
10
72
21
29
12
36
1.90
46365824--46365881
27
2.1
27
80
0
62
22
22
15
39
1.91
46369852--46370013
40
4.1
39
88
6
218
24
22
27
25
2.00
46369852--46370013
80
2.0
80
88
7
240
24
22
27
25
2.00
46377855--46378071
40
5.4
40
92
2
332
23
23
27
25
2.00
46386267--46386398
29
4.6
29
84
0
156
25
15
33
25
1.95
46394792--46394819
5
5.6
5
100
0
56
0
17
0
82
0.68
46395752--46395814
18
3.3
19
76
14
58
30
6
1
61
1.30
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
46395777--46395823
20
2.3
21
78
14
53
31
4
2
61
1.27
46396142--46396175
17
2.0
17
88
0
50
35
5
0
58
1.22
46398556--46398613
25
2.3
24
80
13
64
58
6
3
31
1.41
46399799--46399890
45
2.2
41
80
16
116
38
7
5
48
1.55
46400034--46400058
13
1.9
13
100
0
50
64
0
4
32
1.12
46405301--46405339
20
1.9
19
85
10
51
46
10
0
43
1.37
46407305--46407341
19
1.9
19
88
0
56
43
2
0
54
1.14
46407602--46407633
15
2.1
15
100
0
64
37
18
6
37
1.76
46408008--46408049
20
2.2
20
91
4
68
54
0
0
45
0.99
46410590--46410774
79
2.3
81
82
9
220
23
27
24
24
2.00
46410583--46410774
40
4.8
40
78
7
151
22
28
23
25
2.00
46418621--46418805
79
2.3
81
82
9
220
23
27
24
24
2.00
46418614--46418805
40
4.8
40
78
7
151
22
28
23
25
2.00
46421041--46421101
27
2.4
25
75
5
59
55
13
4
26
1.57
46422695--46422795
28
3.5
29
86
6
125
29
27
13
28
1.95
46429234--46429265
2
16.0
2
100
0
64
50
0
0
50
1.00
46430361--46430459
39
2.5
39
88
0
144
36
26
25
12
1.91
46430911--46430991
40
2.0
40
97
0
153
40
12
7
39
1.71
46432871--46432895
2
12.5
2
100
0
50
52
0
0
48
1.00
46435208--46435369
81
2.0
81
91
0
261
33
13
17
34
1.89
46435351--46435392
3
14.3
3
85
5
59
35
2
0
61
1.09
46435356--46435394
20
2.0
20
94
0
69
38
2
0
58
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
46438608--46438775
40
4.2
40
82
1
185
24
26
23
26
2.00
46454626--46454677
27
2.0
26
84
3
68
34
21
26
17
1.95
46468722--46468836
39
3.0
39
83
3
117
26
26
22
23
2.00
46468764--46468840
39
2.0
39
92
0
127
22
27
23
27
1.99
46468828--46468918
39
2.3
39
82
0
119
25
27
19
27
1.99
46473501--46473631
30
4.5
30
86
8
171
28
25
13
32
1.94
46473500--46473631
58
2.3
58
85
4
176
28
26
13
31
1.94
46481454--46481584
30
4.5
30
86
8
171
28
25
13
32
1.94
46481453--46481584
58
2.3
58
85
4
176
28
26
13
31
1.94
46485095--46485249
42
3.7
42
81
3
177
28
23
15
32
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770