Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  497  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
153700338--153700453
39
2.9
39
96
1
205
21
20
32
25
1.97
153700340--153700522
79
2.3
79
81
4
192
23
21
31
23
1.99
153706020--153706105
44
2.0
44
92
0
145
37
10
24
27
1.88
153713939--153714240
160
1.9
161
85
2
419
28
22
8
40
1.82
153713900--153714239
187
1.8
187
84
3
470
28
22
9
40
1.84
153713902--153714240
27
12.6
27
83
5
357
28
21
9
40
1.84
153715559--153715615
9
5.9
9
73
15
51
35
8
21
35
1.84
153715557--153715619
20
3.2
20
95
0
117
36
12
19
31
1.89
153715673--153715838
24
7.0
24
91
3
248
29
22
21
26
1.99
153716029--153716092
31
2.1
31
90
0
101
35
15
23
25
1.94
153716255--153716384
66
1.9
68
92
7
221
20
13
33
31
1.92
153718984--153719316
27
12.6
27
83
7
391
28
22
8
39
1.84
153718984--153719315
132
2.5
132
87
2
481
28
22
8
39
1.84
153719108--153719359
81
3.2
79
80
5
195
29
23
8
38
1.84
153727819--153727967
80
1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
153727860--153727967
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
153735912--153736060
80
1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
153735953--153736060
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
153738346--153738405
28
2.1
28
87
6
86
35
28
6
30
1.83
153738527--153738604
27
2.8
28
80
5
95
21
25
20
32
1.98
153738525--153738615
27
3.2
28
78
4
85
21
26
19
31
1.98
153738515--153738629
55
2.1
56
80
8
128
19
24
21
34
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
153739070--153739109
19
2.1
19
85
0
53
15
0
7
77
0.98
153745284--153745420
56
2.4
56
86
2
177
26
14
25
33
1.94
153746898--153746956
29
2.0
30
86
3
84
42
6
22
28
1.79
153747435--153747553
46
2.6
46
94
0
211
20
20
29
30
1.97
153749063--153749114
18
2.9
18
82
0
68
44
11
21
23
1.84
153749392--153749577
27
6.9
27
79
4
178
39
18
15
26
1.90
153754717--153754771
27
2.0
27
89
6
85
49
0
25
25
1.51
153757230--153757299
27
2.5
28
88
2
106
28
14
25
31
1.95
153757230--153757311
27
3.0
27
80
8
103
29
13
23
34
1.93
153765152--153765221
27
2.5
28
88
2
106
28
14
25
31
1.95
153765152--153765233
27
3.0
27
80
8
103
29
13
23
34
1.93
153771382--153771588
40
5.2
39
84
6
238
24
22
28
25
2.00
153773767--153773871
40
2.7
40
86
1
131
26
24
28
20
1.99
153773767--153773972
39
5.2
39
74
8
139
23
23
29
23
1.99
153773768--153773949
79
2.3
80
78
6
183
23
24
29
22
1.99
153781866--153782048
40
4.6
39
77
7
145
22
24
29
23
1.99
153781871--153782053
79
2.3
80
80
5
185
20
24
30
24
1.99
153788657--153788823
40
4.2
40
81
2
167
23
26
22
26
2.00
153788673--153788823
80
1.9
79
83
6
198
23
27
23
26
2.00
153792232--153792447
46
4.7
46
91
0
315
39
15
23
21
1.91
153792182--153792447
138
2.0
130
87
5
379
39
15
23
21
1.92
153797526--153797741
46
4.7
46
91
0
315
39
15
23
21
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
153797476--153797741
138
2.0
130
87
5
379
39
15
23
21
1.92
153811938--153812122
40
4.7
40
82
5
146
25
21
27
25
2.00
153811972--153812119
40
3.7
40
85
5
151
27
21
25
25
1.99
153811938--153812122
79
2.3
81
80
11
213
25
21
27
25
2.00
153821807--153821895
43
2.0
45
93
4
155
37
7
20
34
1.82
153823659--153823840
39
4.6
39
86
1
231
24
21
30
23
1.99
153831076--153831258
39
4.6
39
87
0
240
24
22
30
22
1.99
153832834--153832973
43
3.3
43
79
6
133
26
18
26
28
1.98
153832833--153832991
85
1.9
85
80
5
187
25
19
27
28
1.99
153836315--153836520
14
14.7
14
86
0
88
48
10
1
40
1.46
153836315--153836520
16
12.9
16
78
0
106
48
10
1
40
1.46
153836315--153836376
10
6.6
10
82
14
60
43
3
4
48
1.40
153836344--153836514
24
7.4
24
88
7
255
49
12
0
37
1.45
153836328--153836520
10
19.5
10
82
10
200
49
10
1
38
1.45
153839470--153839499
11
2.7
11
94
0
51
70
3
10
16
1.29
153845446--153845500
26
2.2
25
84
12
76
34
0
0
65
0.93
153845466--153845559
16
5.6
16
70
16
57
36
3
2
58
1.26
153845448--153845499
27
2.0
26
92
3
86
36
0
0
63
0.95
153845507--153845542
18
1.9
19
88
5
56
44
2
5
47
1.41
153845532--153845570
20
2.0
19
90
5
60
30
5
0
64
1.15
153852390--153852639
40
6.3
40
91
1
321
23
22
27
26
2.00
153852390--153852639
80
3.2
80
89
3
355
23
22
27
26
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
153864530--153864812
40
7.2
40
88
7
395
23
22
27
27
1.99
153864560--153864784
113
2.0
113
98
1
434
22
22
28
27
1.99
153864530--153864812
153
1.8
153
89
3
444
23
22
27
27
1.99
153866638--153866746
40
2.8
40
85
1
148
23
26
23
25
2.00
153873392--153873558
40
4.2
40
79
6
169
26
22
26
24
2.00
153876669--153876924
40
6.5
40
89
3
351
25
28
23
22
1.99
153891691--153891732
22
2.0
22
86
13
61
16
16
47
19
1.83
153893112--153893436
49
6.8
47
73
14
238
24
30
18
26
1.98
153893068--153893339
98
2.8
98
83
2
311
26
30
17
26
1.97
153893164--153893432
142
1.9
142
81
6
330
25
30
18
25
1.98
153894931--153894960
12
2.4
13
88
11
53
50
20
6
23
1.71
153895897--153895929
5
6.6
5
100
0
66
78
0
0
21
0.75
153900217--153900346
40
3.2
40
83
4
165
23
29
25
22
1.99
153902359--153902398
19
2.1
19
100
0
80
30
5
20
45
1.72
153914308--153914365
30
1.9
30
86
6
82
18
29
31
20
1.97
153918712--153918821
27
4.1
27
82
5
125
37
20
23
18
1.94
153918712--153918821
54
2.1
53
84
5
141
37
20
23
18
1.94
153923817--153923900
34
2.5
34
82
3
89
27
25
21
26
1.99
153927919--153927972
27
2.0
27
85
0
72
38
14
7
38
1.75
153930739--153930909
93
1.8
93
96
0
315
27
29
22
20
1.98
153930731--153930911
46
3.9
46
81
9
233
27
29
21
20
1.98
153931045--153931111
30
2.2
31
79
10
75
52
14
2
29
1.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
153933271--153933358
29
3.0
29
80
8
97
56
15
17
10
1.66
153933271--153933349
15
5.4
15
77
10
83
58
13
17
10
1.63
153933282--153933358
15
5.2
15
75
9
77
55
15
16
11
1.68
153936256--153936426
93
1.8
93
96
0
315
27
29
22
20
1.98
153936248--153936428
46
3.9
46
81
9
233
27
29
21
20
1.98
153938286--153938399
27
4.2
27
81
2
131
36
20
21
21
1.95
153938286--153938399
54
2.1
54
88
0
165
36
20
21
21
1.95
153938541--153938620
27
3.0
27
83
7
83
22
23
18
35
1.96
153940599--153940710
27
4.2
27
70
15
88
25
13
19
41
1.88
153940640--153940750
53
2.1
53
83
8
136
24
11
22
41
1.87
153940677--153940750
27
2.7
27
77
8
96
25
10
21
41
1.85
153943473--153943585
46
2.5
44
84
7
138
23
27
20
29
1.99
153947700--153947924
40
5.6
39
82
7
263
26
27
23
23
2.00
153947700--153947924
83
2.8
80
85
4
299
26
27
23
23
2.00
153959738--153959947
40
5.2
40
87
2
305
25
24
28
21
1.99
153967949--153968012
31
2.1
31
96
0
119
23
21
15
39
1.92
153968204--153968322
24
5.0
24
85
9
154
26
24
21
27
1.99
153968204--153968322
47
2.5
48
89
8
172
26
24
21
27
1.99
153968373--153968432
20
3.0
20
90
0
102
31
20
11
36
1.88
153968475--153968522
25
1.9
25
86
0
69
25
16
25
33
1.96
153976238--153976301
31
2.1
31
96
0
119
23
21
15
39
1.92
153976493--153976610
23
5.0
24
84
10
145
26
24
21
27
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
153976493--153976610
47
2.5
48
87
9
163
26
24
21
27
1.99
153976661--153976726
20
3.3
20
80
0
78
31
21
10
36
1.87
153976763--153976810
25
1.9
25
86
0
69
25
16
25
33
1.96
153981431--153981478
25
1.9
25
82
0
60
35
25
14
25
1.94
153981517--153981593
9
7.9
9
70
16
55
33
9
22
35
1.85
153981515--153981597
20
4.2
20
95
0
148
34
12
20
32
1.89
153981651--153981792
23
6.0
24
88
7
202
27
21
23
28
1.99
153981651--153981792
48
3.0
48
85
9
202
27
21
23
28
1.99
153981987--153982051
31
2.1
31
94
0
112
41
15
20
23
1.89
153982945--153983103
48
3.3
48
82
0
174
35
24
17
22
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770