Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  14  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3669644--3669792
31
4.8
31
89
3
219
25
26
20
27
1.99
3669768--3669896
50
2.5
51
90
5
199
25
22
16
35
1.94
3670012--3670040
14
2.0
15
93
6
51
55
17
6
20
1.65
3677453--3677522
27
2.5
28
95
2
124
30
27
14
28
1.95
3685437--3685506
27
2.5
28
95
2
124
30
27
14
28
1.95
3691499--3691692
41
4.7
41
92
0
325
30
23
24
21
1.99
3691666--3691822
78
2.0
78
98
0
305
39
26
10
23
1.87
3691934--3691961
14
2.0
14
100
0
56
21
0
28
50
1.49
3691944--3692033
25
3.8
25
70
18
75
31
2
23
43
1.66
3692199--3692241
2
21.5
2
100
0
86
51
0
0
48
1.00
3692324--3692369
7
6.6
7
87
0
65
15
2
39
43
1.59
3697905--3697960
9
5.9
9
76
12
58
46
21
1
30
1.62
3703497--3703544
21
2.3
21
92
0
78
25
14
58
2
1.48
3703837--3703935
43
2.3
42
82
3
126
31
17
19
32
1.94
3703921--3704061
43
3.3
43
83
4
178
22
18
21
36
1.95
3705269--3705319
21
2.4
21
96
0
93
13
7
39
39
1.74
3706084--3706142
28
2.1
27
81
3
64
54
5
1
38
1.33
3710890--3710954
32
2.0
32
100
0
130
47
6
21
24
1.73
3719541--3719609
21
3.4
21
71
15
72
36
1
7
55
1.37
3719596--3719626
15
2.1
14
94
5
53
35
3
6
54
1.42
3730362--3730416
3
17.7
3
85
14
60
70
0
0
29
0.87
3730362--3730413
17
2.9
18
81
18
72
71
0
0
28
0.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3730357--3730423
32
2.2
32
86
10
95
73
0
0
26
0.84
3730362--3730416
18
3.1
17
85
15
76
70
0
0
29
0.87
3731015--3731065
23
2.2
23
86
13
70
21
0
3
74
0.98
3733818--3733897
31
2.5
31
79
2
79
23
25
32
18
1.97
3737215--3737248
15
2.2
16
90
10
54
26
0
0
73
0.83
3741347--3741585
132
1.8
132
86
0
352
37
20
17
25
1.94
3741886--3741942
3
18.7
3
89
3
87
66
1
0
31
1.02
3742564--3742621
3
19.3
3
100
0
116
67
0
0
32
0.91
3743533--3743604
26
2.7
26
93
4
117
18
26
0
55
1.42
3754612--3754652
21
2.0
21
90
0
64
34
31
4
29
1.79
3755566--3755938
126
3.0
126
82
2
401
25
25
20
27
1.99
3755554--3755907
63
5.6
62
79
5
343
24
25
21
28
1.99
3771083--3771206
66
1.9
66
98
0
239
31
20
12
35
1.90
3771270--3771829
44
12.8
44
69
11
274
35
20
21
21
1.96
3771400--3771647
87
2.8
88
82
3
338
35
20
20
22
1.96
3771269--3771559
131
2.2
131
90
0
465
34
21
20
23
1.97
3771269--3771603
131
2.6
131
85
2
361
35
21
21
22
1.96
3771271--3771822
87
6.3
87
67
16
260
35
20
21
21
1.96
3773386--3773410
2
12.5
2
100
0
50
48
0
0
52
1.00
3775308--3775357
12
4.1
12
79
5
55
30
10
0
60
1.30
3775412--3775514
3
34.7
3
73
3
57
33
5
1
58
1.33
3779067--3779167
38
2.6
38
85
6
123
24
22
24
27
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3779103--3779223
38
3.1
38
86
2
161
21
19
24
33
1.97
3780773--3780942
43
4.0
43
91
0
270
11
23
32
32
1.91
3781096--3781263
58
2.9
58
95
1
295
22
19
30
28
1.97
3781099--3781256
29
5.5
28
70
12
115
22
19
29
29
1.98
3781128--3781281
28
5.4
28
69
11
107
21
18
32
27
1.96
3784832--3784996
78
2.1
78
81
5
183
21
20
26
32
1.98
3784832--3784950
38
3.1
38
85
3
150
23
22
24
29
1.99
3784867--3784987
38
3.1
38
86
2
143
20
20
24
33
1.97
3787203--3787252
19
2.5
19
81
15
57
34
2
0
64
1.05
3790559--3790588
15
2.1
14
93
6
51
13
0
43
43
1.43
3790745--3790787
21
2.0
21
100
0
86
18
13
9
58
1.62
3797638--3797677
3
13.7
3
89
5
64
2
30
0
67
1.04
3800820--3800882
28
2.2
28
77
11
65
42
0
1
55
1.09
3801151--3801195
15
2.9
16
80
6
56
31
4
2
62
1.27
3811814--3811942
50
2.5
51
88
5
190
35
15
22
26
1.94
3811918--3812035
31
3.8
31
93
0
191
26
18
27
27
1.98
3812064--3812221
42
3.7
42
82
5
156
30
13
26
29
1.94
3813952--3814045
47
2.0
47
100
0
188
46
2
27
23
1.63
3820633--3820687
28
1.9
28
89
10
85
16
25
0
58
1.38
3821914--3821987
31
2.4
31
82
8
96
37
9
10
41
1.73
3831113--3831157
23
2.0
23
95
0
81
37
0
2
60
1.09
3831366--3831432
31
2.2
31
83
0
80
47
14
14
22
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3833013--3833095
19
4.2
19
68
18
53
59
6
4
30
1.43
3833155--3833189
17
2.1
17
89
10
54
54
5
8
31
1.54
3833289--3833313
2
12.5
2
100
0
50
52
0
0
48
1.00
3833291--3833436
24
6.4
22
71
19
95
53
4
6
34
1.49
3833393--3833438
11
4.2
11
80
0
56
58
4
0
36
1.18
3834157--3834207
17
3.0
16
86
11
66
74
0
5
19
1.02
3836304--3836366
22
2.9
22
85
0
90
25
49
11
14
1.76
3847868--3848032
86
1.9
86
86
4
235
27
18
21
32
1.96
3847954--3848266
73
4.3
73
89
5
479
26
17
23
31
1.97
3848174--3848349
86
2.0
86
82
7
214
26
15
19
38
1.91
3848260--3848496
73
3.2
73
88
4
334
29
15
19
35
1.93
3848120--3848422
159
1.9
157
84
8
398
27
15
22
34
1.95
3847886--3848487
306
2.0
306
82
9
737
28
17
22
32
1.96
3848496--3848658
79
2.1
77
86
2
218
28
19
19
33
1.96
3848678--3848848
89
1.9
89
84
5
229
29
18
18
33
1.95
3849450--3849512
22
2.9
22
87
0
99
25
50
11
12
1.73
3851785--3851849
29
2.4
27
76
18
71
47
0
3
49
1.17
3851943--3852019
39
2.0
39
87
5
111
37
2
5
54
1.37
3851935--3852022
39
2.4
35
74
18
90
37
2
4
55
1.33
3853727--3853922
88
2.2
88
85
6
256
39
17
6
36
1.76
3854262--3854342
9
8.6
9
74
9
54
37
0
1
61
1.04
3854271--3854392
9
13.2
9
72
14
70
30
0
0
68
1.01
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3854262--3854377
56
2.1
55
83
6
144
32
0
0
65
1.05
3854335--3854392
19
3.4
16
78
19
55
25
1
0
72
0.94
3854280--3854392
17
6.2
17
70
20
77
30
0
0
68
1.02
3854266--3854402
18
7.4
18
69
11
64
33
0
0
64
1.04
3854348--3854424
27
2.8
26
82
9
66
29
3
1
64
1.19
3860330--3860366
2
19.0
2
94
5
67
51
0
0
48
1.00
3860778--3860804
2
13.5
2
100
0
54
51
0
0
48
1.00
3866716--3866890
46
3.8
46
77
13
196
28
28
21
21
1.99
3866723--3866894
93
1.8
93
93
0
299
27
28
21
22
1.99
3867977--3868292
127
2.4
127
82
5
393
39
18
15
26
1.90
3868616--3868782
3
55.3
3
66
12
74
60
2
8
28
1.40
3868616--3868727
52
2.2
53
82
9
142
62
1
7
28
1.32
3868737--3868773
16
2.4
15
90
4
56
59
5
8
27
1.48
3868717--3868770
28
1.9
28
88
7
83
57
5
9
27
1.52
3868715--3868775
28
2.3
25
77
20
70
57
4
8
29
1.49
3870322--3871117
84
9.4
85
84
4
943
19
22
21
37
1.95
3871187--3871311
64
2.0
64
93
0
214
38
15
15
31
1.88
3883188--3883293
35
3.0
35
94
0
185
16
48
12
23
1.79
3883703--3883770
15
4.6
14
67
25
50
61
19
5
13
1.51
3883696--3883772
32
2.4
32
82
6
102
63
18
6
11
1.48
3884029--3884078
11
4.5
11
82
9
57
0
56
0
44
0.99
3884602--3884657
24
2.3
25
87
6
96
41
0
5
53
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3884595--3884657
2
33.0
2
81
9
69
41
0
6
52
1.27
3886462--3886775
128
2.4
128
86
0
412
40
19
14
26
1.89
3887134--3887309
3
57.3
3
71
10
106
60
1
8
30
1.34
3887149--3887309
24
6.2
25
77
19
125
59
1
8
31
1.36
3887241--3887297
16
3.9
16
76
17
61
57
3
8
29
1.45
3888062--3888094
16
1.9
17
88
11
50
75
0
18
6
1.00
3890624--3890682
16
3.3
18
74
19
52
66
0
5
28
1.13
3890642--3890687
20
2.2
22
81
14
62
63
0
4
32
1.14
3891189--3891256
26
2.5
28
83
11
79
42
8
22
26
1.82
3891297--3891485
10
19.8
9
66
16
69
34
6
0
58
1.25

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770