Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  475  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
146720180--146720370
24
8.0
24
88
4
262
27
21
21
28
1.99
146720180--146720370
72
2.7
72
89
4
289
27
21
21
28
1.99
146720564--146720627
31
2.1
31
90
0
101
35
15
23
25
1.94
146721922--146722050
48
2.7
48
81
0
150
24
24
20
30
1.99
146723956--146724026
35
2.0
35
88
0
106
36
11
22
29
1.89
146724909--146724955
16
2.7
17
80
12
51
36
8
21
34
1.84
146725723--146725784
22
2.8
23
78
7
65
35
20
20
22
1.96
146725930--146726047
41
2.9
41
90
0
191
24
27
24
22
2.00
146726291--146726359
27
2.6
26
86
4
84
31
15
17
34
1.92
146726305--146726359
27
2.1
27
89
3
85
29
16
16
38
1.90
146726436--146726492
27
2.1
27
80
3
62
33
12
17
36
1.87
146726442--146726494
27
2.0
27
84
0
70
32
13
18
35
1.90
146726514--146726580
26
2.5
27
85
4
91
29
8
19
41
1.82
146726526--146726580
26
2.1
27
93
3
94
32
10
16
40
1.83
146726569--146726668
27
3.7
27
79
2
121
29
19
16
36
1.93
146726569--146726672
53
1.9
54
88
1
156
29
19
16
34
1.93
146730339--146730488
43
3.5
43
80
8
162
30
26
18
24
1.98
146734488--146734657
45
3.7
46
75
16
192
31
27
18
21
1.97
146734493--146734660
91
1.8
92
96
3
313
30
28
19
21
1.97
146739989--146740156
45
3.7
44
77
12
189
29
27
20
22
1.99
146739994--146740161
90
1.8
92
93
2
295
28
27
21
22
1.99
146745987--146746121
29
4.7
29
92
0
216
31
15
22
29
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
146754007--146754141
29
4.7
29
92
0
216
31
15
22
29
1.95
146759723--146759792
27
2.5
28
88
2
106
28
14
25
31
1.95
146759723--146759804
27
3.0
27
80
8
103
29
13
23
34
1.93
146767641--146767710
27
2.5
28
88
2
106
28
14
25
31
1.95
146767641--146767722
27
3.0
27
80
8
103
29
13
23
34
1.93
146772003--146772050
25
1.9
25
86
0
69
33
25
16
25
1.96
146772094--146772152
20
3.0
20
92
0
100
37
11
20
30
1.89
146772203--146772297
24
4.0
24
85
10
124
28
21
24
26
1.99
146772204--146772297
47
2.0
49
85
12
133
27
21
24
26
1.99
146772445--146772559
31
3.5
31
80
15
140
40
14
20
23
1.90
146772475--146772582
38
2.8
38
94
1
189
39
14
22
23
1.91
146780362--146780420
20
3.0
20
92
0
100
37
11
20
30
1.89
146780471--146780565
24
4.0
24
85
10
124
28
21
24
26
1.99
146780472--146780565
47
2.0
49
85
12
133
27
21
24
26
1.99
146780709--146780827
31
3.6
31
78
14
130
42
15
19
23
1.89
146780743--146780850
38
2.8
38
92
1
180
39
15
22
22
1.91
146782321--146782403
36
2.4
33
76
13
78
54
6
6
33
1.50
146787209--146787242
17
1.9
17
88
5
50
35
14
14
35
1.87
146792460--146792585
43
2.9
43
78
4
148
30
25
15
27
1.96
146792468--146792616
43
3.5
42
75
5
138
30
26
14
28
1.95
146794369--146794457
22
4.0
22
82
0
97
32
22
25
19
1.97
146799866--146799902
14
2.5
15
83
16
51
40
8
10
40
1.70
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
146799875--146799902
14
2.0
14
100
0
56
35
7
14
42
1.73
146802122--146802163
8
5.6
8
86
13
63
64
0
0
35
0.94
146802134--146802161
14
2.0
14
100
0
56
71
0
0
28
0.86
146804767--146804798
5
6.6
5
92
7
57
18
0
0
81
0.70
146804767--146804797
14
2.2
14
100
0
62
19
0
0
80
0.71
146809205--146809241
5
7.6
5
96
3
67
18
0
0
81
0.70
146809276--146809315
12
3.3
12
89
0
62
75
2
2
20
1.04
146809629--146809703
37
2.0
37
97
0
141
33
36
5
25
1.79
146811046--146811095
10
5.0
10
81
13
59
22
8
2
68
1.26
146812170--146812216
21
2.3
20
82
10
51
8
10
8
72
1.29
146814094--146814132
19
2.1
19
85
0
51
71
7
5
15
1.26
146814596--146814685
28
3.2
27
83
10
101
32
25
24
17
1.97
146814791--146814855
28
2.3
28
91
0
103
32
7
26
33
1.85
146817962--146818039
40
2.0
40
100
0
156
14
28
15
42
1.85
146828645--146828786
40
3.5
40
83
1
124
27
23
26
22
1.99
146828684--146828812
40
3.2
39
84
6
152
24
22
27
25
2.00
146833056--146833173
41
3.1
41
60
28
98
32
17
28
21
1.96
146833024--146833187
71
2.3
71
100
0
328
35
17
28
18
1.94
146836954--146837126
46
3.7
46
80
10
217
21
21
27
28
1.99
146836951--146837121
93
1.8
93
94
0
306
21
21
28
28
1.99
146852273--146852355
37
2.2
37
97
0
157
22
34
18
24
1.96
146852450--146852736
49
6.0
47
95
4
511
30
28
8
32
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
146852450--146852734
96
2.9
96
97
1
534
30
28
8
32
1.87
146855044--146855165
43
2.9
42
81
2
145
27
24
17
30
1.97
146857909--146858011
29
3.6
29
92
2
154
26
15
32
26
1.96
146865978--146866080
29
3.6
29
92
2
154
26
15
32
26
1.96
146869574--146869759
40
4.7
40
83
5
200
26
22
25
25
2.00
146869628--146869782
80
1.9
79
82
11
192
27
21
25
25
1.99
146875444--146875503
27
2.3
27
85
2
77
21
23
20
35
1.96
146875337--146875476
71
2.1
65
85
8
181
18
28
22
30
1.97
146882757--146882782
2
13.0
2
100
0
52
50
0
0
50
1.00
146882779--146882838
27
2.3
26
85
2
75
21
23
20
35
1.96
146887877--146887969
44
2.1
43
86
2
132
25
20
27
25
1.99
146892583--146892660
29
2.7
29
83
0
102
26
17
33
21
1.96
146894849--146895031
39
4.6
39
84
2
222
24
29
21
24
1.99
146898407--146898460
16
3.4
16
89
0
90
44
9
16
29
1.79
146899509--146899563
28
1.9
29
85
3
76
20
43
20
16
1.88
146904484--146904553
33
2.1
33
100
0
140
42
27
5
24
1.77
146905012--146905059
24
2.0
24
100
0
96
37
25
16
20
1.93
146907730--146907853
39
3.2
39
79
6
135
24
28
23
24
2.00
146907756--146907871
39
3.0
39
89
0
178
26
28
21
23
1.99
146912058--146912312
55
4.8
53
80
6
259
36
15
24
23
1.94
146912065--146912265
108
1.8
110
91
2
334
34
15
24
24
1.95
146915890--146916137
39
6.4
39
92
1
392
29
29
21
18
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
146916210--146916276
28
2.4
28
87
0
98
26
22
10
40
1.86
146922242--146922425
40
4.6
39
75
6
138
26
23
27
22
2.00
146931192--146931354
70
2.3
71
98
1
319
19
28
17
34
1.94
146931192--146931388
70
2.8
69
90
4
247
20
28
17
33
1.95
146934252--146934381
39
3.3
39
82
4
120
26
28
21
23
1.99
146934247--146934410
78
2.1
78
79
5
172
26
28
21
23
1.99
146934285--146934410
39
3.2
39
88
2
173
27
28
19
23
1.99
146944694--146944859
43
3.9
42
74
12
149
34
24
16
24
1.95
146944840--146944946
54
2.0
54
94
0
187
39
18
9
32
1.83
146967200--146967301
28
3.5
29
81
6
109
28
27
14
29
1.95
146975035--146975136
28
3.5
29
81
6
109
28
27
14
29
1.95
146979352--146979518
40
4.2
40
79
6
169
25
21
27
25
1.99
146986493--146986541
17
2.8
18
74
22
50
24
18
22
34
1.96
146987364--146987530
40
4.2
40
79
6
169
25
21
27
25
1.99
146998734--146999037
49
6.3
49
92
1
447
32
8
30
29
1.86
146998734--146999037
97
3.2
96
90
2
452
32
8
30
29
1.86
146998732--146999037
146
2.1
145
90
3
474
32
8
30
29
1.86
147019863--147020136
49
5.7
49
93
2
443
29
30
7
32
1.84
147023787--147024018
40
5.8
40
96
0
401
26
28
20
24
1.99
147026141--147026503
47
7.7
47
92
4
565
29
29
7
32
1.86
147026141--147026503
96
3.9
96
92
4
582
29
29
7
32
1.86
147034066--147034315
40
6.2
40
91
1
385
22
28
24
25
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
147038055--147038107
25
2.1
25
96
0
97
32
13
28
26
1.93
147038690--147038732
16
2.9
15
87
12
63
46
0
16
37
1.47
147038801--147038965
63
2.7
60
85
9
201
41
1
3
53
1.27
147040554--147040625
28
2.6
28
81
0
81
37
22
16
23
1.94
147041392--147041486
28
3.4
28
79
7
104
38
13
14
32
1.86
147045892--147045922
9
3.3
9
95
4
53
87
0
12
0
0.55
147047203--147047305
29
3.6
29
87
0
143
26
15
33
25
1.95
147053630--147053789
29
5.5
29
82
4
180
26
16
31
25
1.97
147068545--147068578
13
2.8
12
87
12
52
8
11
8
70
1.34
147070381--147070427
23
2.0
23
100
0
94
25
8
19
46
1.77

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770