Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  243  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
72810895--72810956
26
2.3
27
78
10
74
41
25
8
24
1.82
72811060--72811171
27
4.2
26
79
8
109
23
22
16
37
1.94
72818777--72818840
26
2.4
27
82
10
78
37
26
12
23
1.90
72818943--72819055
27
4.2
28
81
7
112
20
21
21
37
1.95
72825310--72825455
43
3.4
43
75
9
129
27
23
19
29
1.98
72828744--72828781
20
1.9
20
89
10
60
42
7
10
39
1.69
72833836--72833882
16
2.9
16
87
6
60
46
23
21
8
1.78
72834093--72834207
29
4.0
28
81
2
122
27
14
28
28
1.95
72834106--72834216
58
1.9
57
83
1
141
27
15
29
27
1.96
72838389--72838427
16
2.4
16
83
8
53
48
20
23
7
1.75
72838377--72838427
24
2.1
24
85
0
66
50
19
21
7
1.72
72838638--72838749
29
3.9
28
82
2
125
27
14
29
28
1.95
72844702--72844834
66
2.0
66
95
0
239
31
22
9
36
1.85
72849171--72849377
40
5.2
39
82
3
200
25
25
23
25
2.00
72849171--72849376
80
2.6
80
82
3
236
25
25
23
25
2.00
72855556--72855628
29
2.5
29
90
0
92
24
31
16
27
1.96
72869598--72869781
73
2.7
67
82
9
242
20
26
20
32
1.97
72869634--72869794
73
2.2
71
91
2
250
21
23
19
35
1.96
72871188--72871284
44
2.2
44
82
7
110
31
20
19
27
1.97
72875361--72875440
39
2.1
39
97
0
151
26
22
12
38
1.90
72877889--72878046
44
3.7
43
82
8
189
30
24
19
25
1.98
72882518--72882659
40
3.5
40
82
1
115
28
23
26
22
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
72882557--72882685
40
3.2
39
84
6
152
24
22
27
25
2.00
72891110--72891292
40
4.7
41
74
16
158
25
26
22
26
2.00
72891168--72891234
32
2.1
32
97
0
125
25
28
16
29
1.97
72891999--72892028
2
15.0
2
100
0
60
50
0
0
50
1.00
72897930--72898098
45
3.7
44
78
14
182
28
28
20
21
1.98
72897935--72898102
92
1.8
91
91
3
275
28
29
20
21
1.98
72898517--72898576
30
2.0
30
86
0
84
30
25
6
38
1.81
72905669--72905838
45
3.7
47
77
17
169
27
29
21
21
1.99
72905669--72905838
93
1.8
93
94
1
306
27
29
21
21
1.99
72906256--72906315
30
2.0
30
90
0
93
30
25
8
36
1.85
72921969--72922082
33
3.5
32
72
9
77
29
10
23
35
1.89
72921993--72922084
33
2.8
32
77
11
89
29
9
23
36
1.87
72924989--72925041
23
2.3
23
93
0
88
24
3
33
37
1.74
72926838--72927045
101
2.1
101
96
0
380
37
9
24
29
1.86
72930394--72930546
39
3.9
39
88
0
216
23
30
21
24
1.99
72930363--72930545
78
2.3
79
89
1
269
22
29
22
24
1.99
72938417--72938569
39
3.9
39
88
0
216
23
30
21
24
1.99
72938386--72938568
78
2.3
79
89
1
269
22
29
22
24
1.99
72944256--72944297
21
2.0
20
86
4
57
50
0
16
33
1.46
72944989--72945062
32
2.3
33
83
6
98
32
8
22
36
1.84
72945006--72945085
33
2.5
33
81
2
90
28
10
21
40
1.85
72946074--72946111
13
2.9
13
92
0
67
15
36
36
10
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
72952396--72952431
19
1.9
19
88
5
56
44
11
0
44
1.39
72959237--72959434
71
2.8
70
92
3
294
33
17
28
20
1.95
72959303--72959420
41
3.1
41
60
28
98
32
17
28
21
1.96
72959271--72959434
71
2.3
71
100
0
328
35
17
28
18
1.94
72966804--72967001
71
2.8
70
92
3
294
33
17
28
20
1.95
72966870--72966987
41
3.1
41
60
28
98
32
17
28
21
1.96
72966838--72967001
71
2.3
71
100
0
328
35
17
28
18
1.94
72978189--72978253
28
2.3
28
91
0
103
33
26
7
32
1.85
72978359--72978448
27
3.2
27
81
7
101
18
23
24
33
1.97
72978369--72978459
27
3.2
28
79
4
85
20
25
20
32
1.97
72978359--72978473
55
2.1
56
80
8
128
18
23
22
35
1.95
72978911--72978949
19
2.1
19
85
0
51
15
5
7
71
1.26
72979537--72979570
10
3.3
10
84
8
50
29
8
8
52
1.62
72983747--72983816
27
2.6
27
97
2
131
31
27
12
28
1.93
72983747--72983844
27
3.4
28
88
8
119
33
26
12
27
1.92
72990280--72990501
40
5.6
40
94
1
376
26
26
22
23
2.00
72993081--72993232
29
5.2
29
94
0
250
26
28
15
29
1.96
72993015--72993232
87
2.5
87
82
3
233
26
31
15
26
1.95
72999802--72999961
29
5.6
29
93
1
259
25
32
15
26
1.95
72999744--72999963
115
1.9
114
80
5
255
26
33
15
25
1.95
73016265--73016326
33
1.9
32
90
3
97
25
19
12
41
1.87
73016263--73016322
16
3.7
16
77
4
66
26
18
15
40
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
73020217--73020314
28
3.5
28
84
4
108
29
16
24
29
1.96
73026854--73027074
40
5.5
40
80
3
221
26
21
27
24
1.99
73026850--73027074
80
2.8
80
89
0
324
26
21
27
24
1.99
73026854--73027101
120
2.1
120
80
3
268
25
20
27
26
1.99
73026854--73027101
80
3.1
80
86
4
252
25
20
27
26
1.99
73029352--73029461
47
2.4
46
78
1
121
30
28
16
25
1.97
73032195--73032402
40
5.2
40
80
2
193
26
22
26
24
2.00
73032199--73032406
80
2.6
80
79
2
222
26
22
26
24
2.00
73037371--73037550
46
3.9
46
84
5
238
20
23
13
41
1.88
73037381--73037645
46
5.8
46
85
2
230
21
23
15
39
1.92
73037476--73037645
45
3.8
45
89
0
205
22
23
17
37
1.94
73048698--73048800
29
3.6
28
80
5
116
29
33
16
21
1.95
73055919--73056021
29
3.6
28
80
5
116
29
33
16
21
1.95
73058433--73058468
18
2.0
18
100
0
72
38
27
5
27
1.79
73066937--73066996
27
2.3
26
85
2
75
36
20
21
21
1.95
73066964--73067105
67
2.1
67
86
5
194
30
22
28
18
1.97
73067035--73067086
27
2.0
26
84
3
68
34
21
26
17
1.95
73069797--73070041
49
4.9
49
78
3
247
25
18
26
30
1.98
73072040--73072088
22
2.0
26
85
14
70
30
4
4
61
1.33
73072244--73072301
29
2.0
29
100
0
116
34
17
3
44
1.65
73076003--73076073
34
2.1
34
100
0
142
14
14
29
42
1.84
73078410--73078506
43
2.3
43
85
0
131
32
16
24
25
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
73079287--73079394
31
3.5
31
93
0
180
22
25
17
34
1.96
73079614--73079707
25
3.8
25
94
1
163
23
24
26
25
2.00
73079754--73079791
11
3.6
11
79
13
53
31
18
13
36
1.89
73079838--73079885
25
1.9
25
86
0
69
29
16
22
31
1.96
73084318--73084489
46
3.8
45
79
11
197
22
20
27
29
1.99
73084315--73084484
92
1.8
92
93
0
295
21
21
28
28
1.99
73091815--73091986
46
3.8
45
79
11
197
22
20
27
29
1.98
73091812--73091981
92
1.8
92
93
0
295
21
21
28
28
1.99
73097679--73097744
31
2.2
30
88
2
96
25
22
15
36
1.93
73099053--73099234
40
4.6
38
76
16
167
25
28
21
24
1.99
73099055--73099234
78
2.3
80
86
6
251
25
27
22
25
2.00
73103034--73103215
78
2.3
81
86
6
257
25
27
22
24
2.00
73103032--73103215
40
4.7
40
86
8
252
25
27
22
24
2.00
73105113--73105205
25
3.8
25
91
1
143
23
22
25
27
2.00
73105252--73105289
11
3.6
11
79
13
53
31
18
13
36
1.89
73105336--73105383
25
1.9
25
82
0
60
31
16
20
31
1.95
73111465--73111586
50
2.5
49
82
5
142
27
21
14
36
1.92
73122423--73122700
48
5.8
47
74
15
191
28
17
28
24
1.98
73122477--73122700
96
2.3
96
82
9
269
29
18
28
24
1.98
73123853--73123913
21
3.0
21
85
2
88
11
39
27
21
1.88
73126100--73126171
36
2.0
36
97
0
135
41
9
8
40
1.68
73130485--73130526
22
2.0
21
86
13
61
61
4
11
21
1.48
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
73134532--73134601
27
2.5
28
88
2
106
28
14
25
31
1.95
73134532--73134613
27
3.0
27
80
8
103
29
13
23
34
1.93
73142460--73142529
27
2.5
28
88
2
106
28
14
25
31
1.95
73142460--73142541
27
3.0
27
80
8
103
29
13
23
34
1.93
73144928--73144981
27
2.0
27
96
0
99
29
12
29
27
1.94
73150331--73150415
30
2.8
30
92
0
134
32
7
24
35
1.83
73150847--73151018
48
3.6
48
81
9
160
28
16
29
25
1.97
73150891--73151065
50
3.6
48
80
6
174
29
17
28
24
1.97
73150891--73151065
47
3.6
48
80
9
169
29
17
28
24
1.97
73150847--73151020
98
1.8
91
84
10
233
28
16
29
25
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770