Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  673  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
211771891--211772061
40
4.3
39
77
10
159
28
21
26
23
1.99
211772174--211772233
28
2.2
28
94
5
106
30
18
21
30
1.97
211782318--211782534
40
5.5
40
85
6
257
26
28
22
23
1.99
211791281--211791592
49
6.6
48
76
12
256
25
20
30
24
1.99
211794406--211794535
40
3.2
40
82
4
165
23
29
23
23
1.99
211802488--211802617
40
3.2
40
82
4
165
23
28
24
23
2.00
211807072--211807208
29
4.7
29
79
8
127
27
29
14
28
1.95
211807073--211807207
60
2.3
58
82
5
155
27
30
14
27
1.95
211815129--211815265
29
4.7
29
79
8
127
27
29
14
28
1.95
211815130--211815264
60
2.3
58
82
5
155
27
30
14
27
1.95
211816593--211816623
15
2.1
15
93
0
53
0
16
0
83
0.64
211818426--211818598
46
3.7
46
78
7
206
23
21
26
28
1.99
211818423--211818593
93
1.8
93
93
0
297
23
21
26
28
1.99
211821734--211821915
39
4.6
39
87
2
240
24
22
30
23
1.99
211829162--211829344
39
4.6
39
87
0
240
24
22
30
22
1.99
211837692--211837858
44
3.7
44
79
10
194
20
20
29
28
1.98
211839454--211839503
24
2.0
25
92
3
84
20
40
6
34
1.77
211847010--211847111
24
4.3
23
85
7
123
20
36
5
37
1.77
211849479--211849702
40
5.7
40
86
6
278
26
27
21
24
1.99
211849460--211849702
79
3.1
79
85
5
278
25
27
21
25
1.99
211852321--211852465
40
3.6
40
92
3
222
23
22
28
25
1.99
211852321--211852497
80
2.2
80
84
6
218
25
22
27
25
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
211852723--211852766
22
2.0
21
83
16
54
31
18
13
36
1.90
211860257--211860396
40
3.5
40
90
5
214
24
22
27
26
2.00
211860255--211860428
78
2.2
79
81
10
212
25
22
25
25
2.00
211860655--211860698
22
2.0
21
83
16
54
31
18
13
36
1.90
211864032--211864163
29
4.6
29
91
0
201
25
32
15
26
1.95
211872094--211872196
29
3.6
29
87
0
143
25
33
15
26
1.95
211880139--211880241
29
3.6
29
87
0
143
25
33
15
26
1.95
211881852--211881926
36
2.1
36
100
0
150
21
26
21
30
1.98
211888890--211889021
29
4.6
29
84
0
156
25
15
33
25
1.95
211893616--211893664
17
2.8
18
74
22
50
24
18
22
34
1.96
211894487--211894652
40
4.2
39
77
9
158
25
21
27
24
1.99
211901612--211901660
17
2.8
18
74
22
50
24
18
22
34
1.96
211902482--211902647
40
4.2
39
77
9
158
25
21
27
24
1.99
211907218--211907355
44
3.2
42
79
7
136
28
18
21
32
1.96
211907257--211907365
42
2.6
42
80
1
128
27
17
22
33
1.96
211907257--211907374
43
2.8
42
79
3
112
26
16
23
33
1.96
211910159--211910259
28
3.5
29
82
9
118
29
25
14
29
1.95
211918021--211918120
29
3.5
28
83
8
114
29
26
15
30
1.95
211922307--211922376
27
2.5
28
88
2
106
28
14
25
31
1.95
211922307--211922388
27
3.0
27
80
8
103
29
13
23
34
1.93
211930214--211930283
27
2.5
28
88
2
106
28
14
25
31
1.95
211930214--211930295
27
3.0
27
80
8
103
29
13
23
34
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
211935881--211935941
30
2.0
30
83
0
77
31
22
8
37
1.84
211938674--211938837
40
4.1
40
81
3
195
24
21
28
25
1.99
211946705--211946868
40
4.1
40
81
3
195
24
21
28
25
1.99
211952133--211952413
39
7.2
39
89
0
409
25
22
28
23
2.00
211952133--211952413
117
2.4
117
94
0
481
25
22
28
23
2.00
211955257--211955420
71
2.3
71
100
0
328
18
28
17
35
1.94
211955257--211955454
71
2.8
70
91
3
258
20
28
17
33
1.95
211962806--211962992
71
2.7
68
93
5
281
18
28
18
34
1.95
211962829--211962992
71
2.3
71
100
0
328
18
28
17
35
1.94
211962829--211963026
71
2.8
70
91
3
258
20
28
17
33
1.95
211982726--211982816
45
2.0
45
91
0
146
25
13
23
38
1.91
211989807--211989845
20
1.9
21
89
5
62
35
15
0
48
1.45
211990017--211990128
41
2.7
43
78
8
115
28
26
18
25
1.98
211991253--211991282
14
2.1
15
93
6
53
50
20
0
30
1.49
211998693--211998804
24
4.7
24
84
6
113
25
16
23
34
1.95
212005883--212005994
24
4.7
24
84
6
113
25
16
23
34
1.95
212009592--212009799
40
5.2
39
84
1
218
25
25
22
25
2.00
212009592--212009797
80
2.6
81
84
3
247
25
26
22
25
2.00
212017563--212017769
40
5.2
39
81
3
200
25
26
22
25
2.00
212026516--212026616
28
3.5
28
86
6
114
29
13
26
29
1.94
212034461--212034561
28
3.5
28
86
6
114
29
13
26
29
1.94
212038763--212038863
28
3.5
28
86
6
114
29
26
13
29
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
212049375--212049475
28
3.5
28
86
6
114
29
26
13
29
1.94
212052644--212052857
80
2.7
80
81
3
245
25
21
25
28
1.99
212052642--212052843
40
5.1
39
82
7
219
23
20
26
28
1.99
212060602--212060818
40
5.4
40
92
2
316
23
23
27
25
2.00
212063830--212064082
55
4.8
52
75
15
186
36
15
24
23
1.93
212074092--212074242
40
3.8
40
76
11
139
22
27
23
26
2.00
212074092--212074241
80
1.9
80
83
5
196
22
27
24
26
1.99
212078161--212078229
28
2.5
28
95
2
122
18
10
27
43
1.82
212082398--212082736
123
2.8
123
96
0
606
30
10
25
33
1.90
212082705--212082948
40
6.1
40
88
1
301
24
21
26
27
1.99
212087990--212088119
40
3.2
40
84
4
174
22
24
29
23
1.99
212103429--212103590
40
4.1
40
81
2
175
25
27
22
25
2.00
212113777--212113857
42
2.0
39
83
11
101
33
2
2
61
1.22
212119637--212119804
40
4.2
39
81
3
167
26
27
20
25
1.99
212119627--212119804
80
2.2
80
80
3
198
25
26
20
26
1.99
212129432--212129561
40
3.3
39
76
8
136
23
27
23
24
2.00
212129448--212129598
40
3.8
40
78
6
146
22
26
23
27
2.00
212129448--212129596
80
1.9
79
83
6
194
22
26
24
26
2.00
212137421--212137550
40
3.3
39
76
8
136
23
27
23
24
2.00
212137437--212137587
40
3.8
40
78
6
146
22
26
23
27
2.00
212137437--212137585
80
1.9
79
83
6
194
22
26
24
26
2.00
212145415--212145544
40
3.3
39
76
8
136
23
27
23
24
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
212145431--212145582
40
3.8
40
78
6
148
22
26
23
27
1.99
212145431--212145580
80
1.9
80
83
8
198
22
26
24
27
1.99
212152786--212152810
12
2.1
12
100
0
50
40
0
0
60
0.97
212155340--212155506
40
4.2
40
82
2
185
25
27
21
25
1.99
212155340--212155506
80
2.1
79
83
7
205
25
27
21
25
1.99
212156331--212156376
17
2.5
19
74
22
53
34
23
17
23
1.96
212163330--212163495
40
4.2
40
81
3
176
24
27
21
25
1.99
212163346--212163457
39
2.8
38
85
4
134
25
29
22
23
1.99
212163346--212163495
79
1.9
78
83
6
196
24
28
22
26
1.99
212164321--212164366
17
2.5
19
74
22
53
34
23
17
23
1.96
212170169--212170299
30
4.5
30
86
8
171
28
25
13
32
1.94
212170168--212170299
58
2.3
58
85
4
176
28
26
13
31
1.94
212172709--212172881
46
3.7
46
79
10
190
23
20
26
30
1.99
212172706--212172876
93
1.8
93
91
0
279
23
20
26
29
1.99
212180166--212180336
46
3.7
46
81
9
215
22
21
26
29
1.99
212181930--212181999
25
2.8
24
69
6
59
62
4
8
24
1.42
212184561--212184699
40
3.5
40
100
0
278
22
28
23
25
1.99
212192622--212192871
40
6.2
40
91
1
385
22
28
24
25
1.99
212204374--212204474
28
3.5
28
86
6
114
29
26
13
29
1.94
212209663--212209905
24
10.1
24
97
0
423
20
18
25
36
1.95
212213679--212213768
40
2.2
40
94
0
153
21
22
26
30
1.99
212213740--212213789
26
1.9
26
95
0
91
20
16
24
40
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
212213705--212213834
66
2.0
66
93
0
224
20
20
25
33
1.97
212213766--212213886
40
3.1
39
85
3
154
23
21
26
28
1.99
212213679--212213869
106
1.8
106
93
2
330
21
21
25
30
1.98
212214113--212214156
22
2.0
22
86
8
63
31
15
13
38
1.87
212218823--212219046
49
4.5
48
77
8
200
29
26
18
25
1.98
212226219--212226410
50
3.8
50
84
2
199
29
27
18
24
1.98
212233607--212233877
49
5.6
47
80
12
243
29
27
18
24
1.98
212233595--212233877
98
2.9
94
79
9
311
29
27
18
24
1.98
212235653--212235721
28
2.5
28
95
2
122
18
10
27
43
1.82
212237511--212237554
19
2.4
18
85
7
54
40
9
0
50
1.34

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770