Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          769   770   

This is table  520  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
161428457--161428585
40
3.2
39
84
6
152
24
22
27
25
2.00
161435560--161435743
40
4.6
39
75
6
138
26
23
27
22
2.00
161435600--161435788
80
2.4
81
77
4
186
23
24
29
22
1.99
161438259--161438384
6
20.8
6
74
19
111
49
13
16
20
1.79
161438238--161438384
30
5.1
29
84
10
144
48
13
17
20
1.80
161438502--161438567
27
2.5
26
85
7
87
37
22
22
16
1.93
161438737--161438795
22
2.7
22
81
0
64
32
22
25
20
1.98
161438881--161438962
26
3.1
26
84
8
103
36
20
21
20
1.95
161439159--161439298
27
5.3
27
86
3
185
25
22
19
33
1.97
161439159--161439291
53
2.5
53
87
2
187
24
23
19
33
1.97
161439303--161439813
27
19.2
27
82
6
589
39
9
23
27
1.85
161439308--161439813
160
3.2
160
90
4
772
39
9
24
27
1.85
161441825--161441950
6
20.8
6
74
19
111
49
13
16
20
1.79
161441825--161441950
30
4.4
30
83
14
167
49
13
16
20
1.79
161442067--161442132
27
2.5
26
85
7
87
37
22
22
16
1.93
161442067--161442140
27
2.8
27
78
13
82
36
21
24
17
1.95
161442091--161442148
27
2.1
27
84
6
73
36
27
20
15
1.93
161442305--161442363
22
2.7
22
81
0
64
32
22
25
20
1.98
161442450--161442532
27
3.1
26
89
5
121
36
21
22
19
1.95
161442731--161442924
27
7.3
27
85
2
239
25
20
19
35
1.95
161442774--161442931
53
3.0
52
79
10
178
25
18
19
36
1.94
161442759--161442952
106
1.8
106
83
6
259
26
19
19
35
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
161442929--161443435
27
19.2
27
85
8
661
40
10
23
26
1.86
161445443--161445567
6
20.8
6
75
18
118
49
13
16
20
1.79
161445683--161445748
27
2.5
26
85
7
87
37
22
22
16
1.93
161445683--161445756
27
2.8
27
78
13
82
36
21
24
17
1.95
161445707--161445764
27
2.1
27
84
6
73
36
27
20
15
1.93
161445921--161445979
22
2.7
22
81
0
64
32
22
25
20
1.98
161446067--161446149
27
3.1
26
89
5
121
36
21
22
19
1.95
161446348--161446541
27
7.3
27
86
2
248
25
20
19
35
1.96
161446348--161446541
53
3.6
52
87
4
262
25
20
19
35
1.96
161446546--161447000
27
17.2
27
84
7
560
40
10
22
27
1.86
161446419--161446568
79
1.9
80
83
6
180
27
17
20
35
1.94
161449013--161449144
30
4.4
30
92
4
196
49
12
16
21
1.79
161449013--161449119
6
17.8
6
78
18
116
50
14
14
20
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Size
Copy
Number
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Percent
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
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Size
Copy
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25
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
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Score
A
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7
162
29
9
21
39
1.85

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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