Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  103  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
29758633--29758836
40
5.1
40
82
5
216
25
22
27
25
1.99
29758633--29758836
80
2.5
80
85
1
266
25
22
27
25
1.99
29769449--29769618
40
4.2
40
85
1
207
24
21
26
27
1.99
29769419--29769618
80
2.5
80
82
0
229
26
21
26
26
1.99
29774640--29774884
55
4.6
54
78
8
229
35
17
25
21
1.95
29774647--29774847
108
1.8
110
90
4
327
33
17
26
22
1.96
29776992--29777029
19
2.0
20
85
15
53
36
0
23
39
1.55
29788310--29788340
16
1.9
16
93
0
53
41
0
22
35
1.54
29798345--29798407
22
2.8
22
95
2
108
58
26
1
12
1.43
29798969--29799002
17
1.9
18
88
5
52
73
2
0
23
0.97
29800122--29800159
16
2.4
16
86
0
58
28
23
10
36
1.88
29804001--29804030
9
3.3
9
100
0
60
0
33
0
66
0.92
29806407--29806486
40
2.0
40
97
0
151
38
25
11
25
1.88
29808175--29808235
30
2.0
30
83
0
77
31
22
8
37
1.84
29809360--29809480
58
2.1
57
81
6
136
46
4
20
28
1.71
29809642--29809692
26
1.9
27
88
4
77
45
7
9
37
1.67
29811470--29811497
12
2.3
12
100
0
56
7
25
42
25
1.80
29817167--29817227
30
2.0
30
83
0
77
31
22
8
37
1.84
29818052--29818133
43
1.9
42
87
7
121
21
19
26
31
1.97
29818863--29818910
10
4.4
10
78
17
51
16
0
27
56
1.41
29823539--29823566
2
14.0
2
100
0
56
50
0
0
50
1.00
29835124--29835150
12
2.2
12
100
0
54
14
0
14
70
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
29847175--29847216
22
2.0
22
90
4
68
9
40
26
23
1.85
29850508--29850550
18
2.4
18
84
7
52
62
4
2
30
1.28
29852305--29852411
29
3.7
28
79
8
99
27
28
15
28
1.96
29852316--29852428
29
4.0
29
81
4
97
28
29
14
28
1.95
29852639--29852674
16
2.2
17
90
5
56
8
22
16
52
1.70
29852639--29852689
24
2.1
24
82
13
61
9
21
17
50
1.74
29852647--29852689
16
2.8
16
85
3
52
11
20
16
51
1.75
29860085--29860258
40
4.4
40
89
3
228
25
28
22
22
1.99
29864342--29864420
34
2.3
35
84
6
99
31
5
13
49
1.64
29866338--29866384
23
2.1
22
84
11
60
27
6
0
65
1.16
29869594--29869757
71
2.3
71
98
0
319
34
17
28
18
1.94
29877129--29877291
70
2.3
71
98
1
319
34
17
28
19
1.94
29883044--29883263
46
4.7
45
77
14
198
28
19
28
23
1.98
29883089--29883258
93
1.8
94
84
6
238
28
18
28
23
1.98
29890602--29890805
46
4.4
46
83
9
227
27
19
30
22
1.98
29890602--29890852
47
5.4
47
79
13
209
27
18
31
22
1.97
29892944--29892994
22
2.3
22
86
3
75
64
3
0
31
1.11
29895012--29895108
45
2.2
44
85
9
126
27
27
14
29
1.95
29894987--29895363
90
4.2
90
73
4
305
27
25
16
29
1.97
29895030--29895138
44
2.4
45
81
4
132
30
26
16
26
1.97
29894940--29895273
178
1.9
178
87
0
497
26
26
18
28
1.98
29895043--29895406
45
8.2
45
69
6
170
29
25
15
29
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
29895310--29895406
44
2.2
45
81
5
108
35
23
12
28
1.91
29895253--29896030
178
4.4
178
83
4
942
28
25
16
29
1.97
29895263--29896030
354
2.2
356
83
4
937
28
25
16
29
1.97
29895665--29895750
44
1.9
45
81
11
106
30
27
11
30
1.92
29897288--29897362
25
3.1
24
76
19
84
14
0
8
77
0.98
29897306--29897347
9
4.6
9
77
16
50
14
0
2
83
0.75
29897305--29897362
28
2.2
25
85
11
80
13
0
5
81
0.86
29900594--29900626
12
2.8
12
95
0
57
9
27
18
45
1.79
29903069--29903120
23
2.3
23
82
0
68
63
3
1
30
1.23
29908646--29908829
40
4.6
40
78
4
147
22
24
29
23
1.99
29916414--29916526
40
2.8
40
86
0
136
24
23
29
22
1.99
29920769--29920844
40
1.9
40
83
5
100
39
31
13
15
1.86
29924640--29924742
40
2.6
40
78
4
111
37
36
9
15
1.81
29927252--29927276
2
12.5
2
100
0
50
52
0
0
48
1.00
29928060--29928221
35
4.6
35
78
0
180
42
17
9
30
1.81
29931107--29931162
28
2.0
28
100
0
112
21
25
3
50
1.65
29932488--29932537
26
1.9
27
84
8
68
22
16
22
40
1.91
29934025--29934132
26
4.2
26
84
4
146
37
23
5
33
1.78
29934025--29934132
52
2.1
52
89
0
162
37
23
5
33
1.78
29939061--29939161
39
2.6
39
88
0
148
37
22
25
13
1.92
29943110--29943167
19
3.1
19
82
9
66
53
6
0
39
1.28
29945174--29945249
35
2.2
35
92
0
125
34
1
10
53
1.43
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
29945674--29945714
21
2.0
21
90
0
64
63
0
2
34
1.08
29945674--29945715
22
2.0
21
85
4
57
64
0
2
33
1.07
29946609--29946642
5
6.8
5
93
0
50
14
17
41
26
1.88
29948395--29948444
13
3.7
13
76
10
55
34
6
2
58
1.34
29948727--29948803
21
3.6
21
74
20
61
46
1
1
50
1.17
29952064--29952162
30
3.3
30
92
0
171
26
49
6
18
1.70
29952787--29952855
25
2.9
23
79
14
77
31
4
5
57
1.42
29952919--29952974
25
2.3
24
79
14
62
37
16
3
42
1.65
29963497--29963525
12
2.5
12
94
5
51
86
0
13
0
0.58
29964543--29964587
13
3.4
13
87
6
72
13
11
6
68
1.37
29964455--29964839
100
4.0
99
82
9
429
25
17
18
39
1.92
29964770--29965726
75
13.1
75
85
5
1266
30
15
19
33
1.94
29964770--29965720
148
6.5
148
89
4
1260
30
15
20
33
1.94
29964770--29965704
366
2.6
365
94
2
1617
31
15
20
32
1.94
29965797--29965829
14
2.4
14
94
0
57
18
12
6
63
1.48
29965740--29966133
92
4.4
89
79
9
349
30
17
17
35
1.93
29966010--29966236
87
2.6
86
80
5
235
31
15
18
33
1.93
29966851--29966947
30
3.2
30
88
4
151
25
48
6
19
1.72
29967433--29967615
25
7.4
25
65
19
80
33
4
3
57
1.38
29967572--29967639
22
2.9
23
82
10
84
32
4
5
57
1.43
29967572--29967647
22
3.3
22
78
10
80
31
3
5
59
1.38
29969587--29969648
3
20.7
3
100
0
124
32
0
0
67
0.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
29971093--29971158
18
3.6
18
69
27
50
54
0
6
39
1.25
29972713--29972814
50
2.0
50
100
0
204
25
23
15
35
1.94
29978914--29978941
2
14.0
2
100
0
56
50
0
0
50
1.00
29984546--29984593
22
2.2
22
81
7
53
14
18
6
60
1.55
29985636--29985663
11
2.5
11
100
0
56
42
10
0
46
1.38
29985843--29985950
50
2.1
51
81
8
123
40
13
12
32
1.83
29987744--29987791
18
2.6
18
81
12
62
8
25
0
66
1.19
29987861--29987907
17
2.6
17
78
18
51
6
19
4
70
1.26
29992947--29993034
21
4.1
22
77
10
92
35
26
23
14
1.94
29992952--29993033
44
1.9
41
82
7
101
32
28
24
14
1.94
29993205--29993261
23
2.5
23
85
5
71
52
35
1
10
1.46
29993237--29993322
28
3.0
28
84
5
120
48
29
2
19
1.61
29998308--29998395
21
4.1
22
77
10
92
35
26
23
14
1.94
29998313--29998394
44
1.9
41
82
7
101
32
28
24
14
1.94
29998564--29998620
23
2.5
23
85
5
71
52
35
1
10
1.46
29998596--29998681
28
3.0
28
84
5
120
48
29
2
19
1.61
30003439--30003478
18
2.2
18
86
8
55
20
0
12
67
1.22
30004217--30004370
45
3.4
45
69
9
125
24
18
20
36
1.95
30004970--30004995
3
8.7
3
100
0
52
30
0
0
69
0.89
30015355--30015602
124
2.0
124
100
0
496
30
17
23
28
1.97
30016486--30016523
18
2.2
17
86
9
51
21
7
2
68
1.28
30023338--30023488
41
3.7
40
81
7
153
25
22
20
31
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
30023744--30023864
7
17.0
7
70
12
59
19
1
37
42
1.61
30024006--30024059
7
7.6
7
81
4
63
20
0
29
50
1.49
30024011--30024059
14
3.4
14
88
2
71
18
0
32
48
1.48
30024054--30024086
14
2.3
15
89
5
50
15
3
45
36
1.61
30024875--30024927
15
3.6
15
82
5
72
73
1
0
24
0.93
30024882--30024923
7
5.9
7
86
5
57
78
2
0
19
0.86
30024875--30024924
14
3.5
14
83
5
64
74
2
0
24
0.93
30025029--30025068
19
2.2
17
91
8
62
75
0
2
22
0.93
30026575--30026599
7
3.6
7
100
0
50
12
0
28
60
1.32
30027477--30027546
27
2.5
28
90
2
115
25
12
28
32
1.93

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770