Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  79  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23327364--23327432
28
2.5
28
95
2
122
18
10
27
43
1.82
23331483--23331551
28
2.5
28
95
2
122
18
10
27
43
1.82
23335602--23335663
27
2.3
27
86
10
99
19
9
27
43
1.82
23343962--23344010
17
2.8
18
74
22
50
24
18
22
34
1.96
23344833--23344999
40
4.2
40
79
6
169
25
21
27
25
1.99
23347346--23347390
10
4.3
10
86
8
63
77
0
0
22
0.76
23350842--23351060
79
2.8
79
83
5
273
40
19
8
31
1.82
23350773--23351061
27
10.9
27
75
11
231
39
18
9
32
1.83
23350774--23351063
53
5.5
53
80
5
259
38
18
9
32
1.83
23351040--23351102
27
2.3
27
83
5
74
36
17
19
26
1.94
23351561--23351586
11
2.4
11
100
0
52
26
0
19
53
1.45
23356912--23356984
29
2.5
29
97
0
137
27
28
13
30
1.94
23359594--23359743
49
3.0
49
96
0
264
35
8
25
31
1.85
23359818--23359904
37
2.3
36
94
5
147
20
19
33
26
1.97
23361792--23362103
40
7.8
40
93
0
509
29
19
23
27
1.99
23362952--23363015
31
2.1
31
90
0
101
23
25
15
35
1.94
23363207--23363349
24
6.0
24
91
4
209
26
22
22
28
1.99
23363207--23363348
47
3.0
48
90
5
207
26
22
22
28
1.99
23363206--23363349
71
2.0
72
89
4
220
26
22
22
29
1.99
23363399--23363459
20
3.0
20
92
0
104
32
21
11
34
1.89
23363502--23363549
25
1.9
25
86
0
69
25
16
25
33
1.96
23369689--23369751
31
2.1
31
90
3
101
23
23
15
36
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23369943--23370108
24
7.0
24
91
4
248
26
22
22
28
1.99
23369943--23370108
47
3.5
48
91
4
248
26
22
22
28
1.99
23369942--23370108
71
2.3
70
89
5
246
26
22
22
29
1.99
23370158--23370218
20
3.0
20
92
0
104
32
21
11
34
1.89
23370261--23370308
25
1.9
25
86
0
69
25
16
25
33
1.96
23372622--23372760
40
3.5
40
82
4
154
25
24
26
23
2.00
23375773--23375873
49
2.0
50
94
1
177
34
7
25
31
1.85
23375773--23375907
49
2.7
49
83
8
137
34
8
25
31
1.87
23375948--23376034
37
2.3
36
94
5
147
20
19
33
26
1.97
23387240--23387406
40
4.2
40
81
2
176
25
26
21
26
1.99
23389107--23389304
48
4.1
47
78
10
188
23
18
32
25
1.97
23389125--23389304
96
1.9
96
81
6
222
24
18
32
25
1.97
23397263--23397405
42
3.3
42
79
10
146
29
20
23
27
1.99
23410478--23410711
48
4.9
47
79
6
229
25
20
30
24
1.98
23410487--23410665
95
1.9
96
85
3
254
25
20
30
22
1.98
23412570--23412694
43
2.9
43
86
2
144
33
28
13
24
1.93
23417323--23417434
43
2.6
43
78
12
124
28
29
17
24
1.97
23428068--23428276
38
5.0
38
72
18
148
30
24
15
29
1.96
23428113--23428246
48
2.8
48
86
1
180
31
23
15
29
1.95
23430520--23430561
15
2.8
15
81
0
57
52
14
14
19
1.75
23433799--23433960
38
4.0
38
71
16
137
31
22
15
30
1.95
23433801--23434006
85
2.4
85
87
3
306
32
21
15
31
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23434935--23435114
48
3.8
48
80
5
220
23
28
21
26
1.99
23434930--23435111
96
1.9
97
88
3
278
23
28
21
26
1.99
23438771--23438839
28
2.5
28
95
2
122
18
10
27
43
1.82
23440468--23440505
20
1.9
20
88
0
58
52
10
2
34
1.50
23446781--23446849
28
2.5
28
95
2
122
18
10
27
43
1.82
23448473--23448510
20
1.9
20
88
0
58
52
10
2
34
1.50
23448952--23449079
37
3.4
37
93
1
202
27
32
17
23
1.96
23449119--23449270
48
3.2
48
84
0
223
31
26
6
35
1.82
23449262--23449470
49
4.3
49
96
3
381
30
29
7
32
1.85
23449262--23449470
96
2.2
95
95
3
375
30
29
7
32
1.85
23454193--23454433
50
4.8
50
80
5
227
33
26
14
25
1.95
23454193--23454433
100
2.4
99
80
2
266
33
26
14
25
1.95
23460901--23461165
48
5.5
47
86
4
239
26
30
16
26
1.96
23460936--23461171
48
4.9
48
87
1
321
26
30
16
25
1.97
23469269--23469306
19
2.0
19
94
0
67
36
18
5
39
1.73
23491339--23491382
15
2.9
15
86
0
61
54
13
13
18
1.71
23502968--23503021
21
2.6
21
81
0
63
33
7
35
24
1.83
23509027--23509061
17
2.1
18
89
10
56
42
8
17
31
1.79
23510923--23510966
2
22.0
2
95
0
79
47
0
2
50
1.13
23511690--23511729
20
2.0
20
85
0
53
50
0
12
37
1.41
23513332--23513357
7
3.7
7
100
0
52
46
15
0
38
1.46
23513526--23513553
12
2.3
12
100
0
56
7
14
32
46
1.71
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23513559--23513650
39
2.3
40
81
1
96
38
21
18
21
1.94
23513721--23513860
40
3.6
38
75
14
115
28
22
19
30
1.98
23513917--23514014
40
2.4
40
81
8
110
24
22
19
33
1.97
23514140--23514237
49
2.0
49
97
0
187
39
2
11
46
1.51
23514226--23514277
21
2.4
21
78
9
52
25
0
25
50
1.50
23514287--23514442
7
21.9
7
70
11
57
21
0
32
46
1.52
23514287--23514500
28
7.5
28
72
17
111
21
0
34
44
1.52
23514339--23514466
22
5.9
22
76
14
99
19
0
37
42
1.51
23514367--23514520
71
2.3
66
92
7
249
20
0
35
44
1.52
23514438--23514497
28
2.1
28
100
0
120
20
0
38
41
1.52
23514340--23514543
7
28.6
7
73
7
106
20
0
36
42
1.56
23521561--23521829
43
6.3
43
90
2
371
22
20
31
26
1.98
23521561--23521829
86
3.1
86
91
0
430
22
20
31
26
1.98
23524471--23524499
5
6.0
5
92
8
51
37
0
0
62
0.96
23524470--23524502
15
2.4
14
85
14
50
33
0
0
66
0.92
23525172--23525339
86
2.0
86
90
0
264
37
14
11
36
1.83
23527086--23527152
31
2.2
31
84
10
84
41
1
2
53
1.25
23533937--23533979
17
2.6
16
77
3
50
41
2
0
55
1.12
23542260--23542351
44
2.1
44
84
8
116
35
21
17
25
1.95
23543793--23543851
25
2.5
24
81
13
68
38
10
5
45
1.60
23544058--23544203
3
49.3
3
91
2
224
61
2
0
34
1.15
23547149--23547192
22
1.9
24
90
9
74
25
20
0
54
1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23547741--23547811
3
23.7
3
94
0
124
64
1
0
33
1.02
23547823--23547855
15
2.1
16
88
5
50
45
0
0
54
0.99
23547938--23547975
14
2.4
17
87
12
55
52
0
0
47
1.00
23549481--23549551
24
3.0
24
87
0
106
35
2
38
23
1.70
23549481--23549575
48
2.0
47
81
8
111
35
5
36
22
1.77
23550967--23551078
27
4.1
27
84
7
138
15
24
23
37
1.93
23550967--23551078
54
2.1
54
88
3
163
15
24
23
37
1.93
23556837--23556882
6
7.7
6
90
0
65
50
0
32
17
1.47
23558859--23558891
16
1.9
18
88
11
52
75
6
0
18
1.00
23558861--23558952
49
2.0
47
85
12
127
58
11
4
25
1.51
23560618--23560673
27
2.1
27
100
0
112
23
21
14
41
1.89
23561142--23561190
25
1.9
26
87
4
73
63
10
10
16
1.52
23561142--23561196
25
2.2
25
83
6
67
65
9
10
14
1.47
23562127--23562197
35
2.0
35
100
0
142
42
8
19
29
1.81
23562518--23562654
45
3.0
45
78
12
122
45
18
15
21
1.85
23562869--23562906
2
19.0
2
100
0
76
50
0
0
50
1.00
23568457--23568514
29
2.0
29
86
0
80
27
36
18
17
1.94
23578988--23579039
25
2.1
24
82
10
61
40
5
0
53
1.25
23580669--23580716
19
2.5
18
77
12
51
58
0
8
33
1.28
23580706--23580738
14
2.4
14
90
5
50
69
0
0
30
0.88
23581227--23581273
2
23.5
2
100
0
94
48
0
0
51
1.00
23606083--23606249
40
4.2
40
82
2
185
24
26
22
26
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23614121--23614224
40
2.6
40
83
4
113
22
26
22
28
1.99
23616393--23616438
17
2.5
17
86
10
56
30
4
0
65
1.12
23616426--23616459
11
2.9
12
86
8
52
26
2
0
70
1.01
23616416--23616916
155
3.3
153
88
6
740
27
5
7
59
1.46
23617535--23617608
6
12.2
6
75
13
53
1
48
0
50
1.09
23619106--23619148
22
2.0
22
100
0
86
11
18
23
46
1.82
23619793--23619831
21
2.0
21
90
10
64
25
28
35
10
1.89
23620901--23621168
46
5.7
47
72
18
186
26
29
16
27
1.97
23624405--23624593
69
2.7
69
76
3
182
28
18
23
29
1.98
23624184--23624791
138
4.4
138
77
3
501
29
17
23
29
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770