Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          769   770   

This is table  566  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
176363616--176363773
40
4.0
40
79
4
151
26
24
26
22
2.00
176363616--176363803
80
2.3
80
79
12
206
26
23
27
22
2.00
176371624--176371781
40
4.0
40
79
4
151
26
24
26
22
2.00
176371624--176371811
80
2.3
80
79
12
206
26
23
27
22
2.00
176378091--176378276
40
4.7
40
100
0
372
21
29
23
25
1.99
176386198--176386454
40
6.4
40
91
1
399
22
29
23
24
1.99
176388245--176388405
29
5.6
29
81
4
83
25
32
16
26
1.96
176388244--176388405
58
2.8
59
85
3
195
25
32
16
26
1.96
176393377--176393415
2
20.0
2
94
5
71
48
0
0
51
1.00
176393585--176393744
43
3.7
44
72
10
132
25
14
26
33
1.94
176402827--176402957
30
4.5
30
86
8
171
32
13
25
28
1.94
176402827--176402957
58
2.2
58
86
4
174
32
13
25
28
1.94
176408922--176409105
40
4.6
40
80
4
165
28
21
26
23
1.99
176421052--176421152
28
3.5
30
82
6
118
29
14
26
28
1.95
176421081--176421156
29
2.7
28
76
13
75
30
14
26
28
1.95
176423565--176423742
79
2.2
81
85
2
243
24
25
23
25
2.00
176423565--176423744
40
4.5
40
84
3
211
25
25
23
26
2.00
176429334--176429403
27
2.6
27
90
2
113
30
25
14
30
1.95
176432465--176432688
40
5.6
40
87
3
297
24
22
26
26
2.00
176432469--176432688
83
2.7
80
88
6
295
23
22
27
26
2.00
176434043--176434467
234
1.8
234
96
0
787
37
8
22
31
1.85
176435807--176435977
93
1.8
93
93
0
297
30
28
19
21
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
176435802--176435974
46
3.7
46
77
13
192
31
27
19
21
1.97
176442905--176443073
93
1.8
91
94
2
302
28
29
20
21
1.98
176442900--176443081
44
4.0
44
76
16
183
29
29
19
21
1.98
176447515--176447681
40
4.2
40
79
6
169
26
22
26
24
2.00
176461002--176461129
40
3.2
40
78
8
120
28
21
25
24
1.99
176465546--176465684
40
3.5
40
86
4
149
24
29
21
24
1.99
176465521--176465735
79
2.7
80
77
11
201
25
27
21
25
1.99
176468149--176468366
40
5.5
40
90
2
298
23
23
27
24
2.00
176471993--176472023
14
2.2
14
100
0
62
22
35
12
29
1.91
176475439--176475658
40
5.6
40
92
2
347
22
20
30
25
1.99
176483505--176483685
40
4.6
40
86
2
231
24
20
29
25
1.99
176485921--176486101
40
4.6
40
78
8
165
24
24
27
23
2.00
176485920--176486071
78
1.9
79
84
5
200
25
23
26
24
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176488212--176488343
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29
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20
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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C
G
T
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137
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1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
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Score
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3.1
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119
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28
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1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
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27
24
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
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A
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0
1.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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