Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          769   770   

This is table  477  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
147367585--147367679
40
2.4
40
82
3
111
24
15
27
32
1.95
147368267--147368379
56
2.0
56
100
0
226
28
7
19
45
1.76
147373906--147373956
25
2.0
26
81
11
61
39
13
9
37
1.78
147374116--147374252
12
11.8
12
64
19
51
51
3
3
41
1.37
147374118--147374169
20
2.8
18
76
21
54
50
3
3
42
1.39
147374067--147374407
175
1.9
175
99
0
673
50
4
5
40
1.44
147379186--147379287
40
2.5
40
82
0
114
31
23
24
20
1.98
147379227--147379337
40
2.8
40
81
9
127
25
25
26
23
2.00
147387155--147387305
40
3.8
40
79
6
155
26
23
27
22
2.00
147387192--147387321
40
3.2
40
80
2
154
23
23
27
24
2.00
147401393--147401429
2
18.5
2
88
0
56
48
2
2
45
1.30
147401518--147401656
2
72.0
2
71
14
78
50
5
4
39
1.46
147402175--147402211
11
3.2
12
88
11
60
45
0
54
0
1.00
147402173--147402222
11
4.5
11
82
9
57
44
0
56
0
0.99
147402485--147402520
14
2.5
15
95
4
65
16
5
13
63
1.47
147402484--147402521
15
2.5
16
87
12
62
15
5
13
65
1.43
147402483--147402556
33
2.3
33
84
9
98
12
5
18
63
1.47
147402951--147403020
35
2.0
34
97
2
131
24
10
48
17
1.77
147411941--147412010
25
2.8
25
91
0
104
25
22
18
32
1.97
147419440--147419491
27
1.9
27
84
0
68
19
5
17
57
1.59
147424690--147424749
29
2.0
30
81
9
70
41
0
23
35
1.55
147425299--147425428
47
2.8
47
82
2
145
23
15
26
33
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
147434234--147434395
39
4.2
39
91
2
254
23
20
31
24
1.98
147434245--147434395
77
1.9
79
93
2
261
23
21
31
23
1.98
147434234--147434425
39
4.9
39
88
1
242
23
21
31
23
1.98
147442109--147442269
39
4.1
39
93
0
259
23
20
31
24
1.98
147442109--147442299
39
4.8
39
90
0
247
23
21
31
23
1.98
147446692--147446823
29
4.6
29
83
1
149
25
32
16
25
1.96
147448461--147448562
47
2.1
47
96
1
186
29
16
27
26
1.97
147448825--147448907
27
3.1
27
85
0
121
33
14
21
30
1.93
147448889--147449203
27
11.7
27
78
4
213
41
20
8
29
1.81
147448913--147449200
81
3.6
80
80
3
256
43
20
8
28
1.80
147457883--147458029
28
5.1
29
81
8
160
27
31
12
28
1.93
147458149--147458186
19
2.0
19
89
0
58
28
36
18
15
1.92
147458206--147458248
16
2.7
16
88
0
59
9
25
16
48
1.75
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27
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Copy
Number
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Percent
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Copy
Number
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Period
Size
Copy
Number
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Percent
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9
37
1.83

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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