Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          769   770   

This is table  403  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
123743245--123743387
47
3.0
47
90
5
207
28
22
22
26
1.99
123743245--123743388
71
2.0
72
89
4
220
29
22
22
26
1.99
123744215--123744480
133
2.0
133
97
0
505
28
21
21
28
1.99
123744478--123756241
535
21.9
538
97
1
22261
33
11
18
36
1.86
123756541--123756650
26
4.2
26
92
0
175
33
5
23
37
1.78
123761654--123771075
534
17.7
538
96
2
17367
33
11
18
36
1.86
123772207--123772275
28
2.5
28
95
2
122
18
10
27
43
1.82
123773903--123773940
20
1.9
20
88
0
58
52
10
2
34
1.50
123780205--123780273
28
2.5
28
95
2
122
18
10
27
43
1.82
123781883--123781920
20
1.9
20
88
0
58
52
10
2
34
1.50
123793657--123794105
44
10.2
44
91
0
720
27
14
31
26
1.95
123796883--123797189
131
2.3
130
79
3
330
24
20
20
34
1.96
123801301--123801355
28
1.9
29
88
3
85
54
7
1
36
1.39
123805322--123805359
2
19.0
2
100
0
76
50
0
0
50
1.00
123806426--123806478
22
2.4
22
90
0
88
11
32
47
9
1.71
123807130--123807197
24
2.8
24
78
17
68
33
0
5
60
1.21
123807293--123807327
2
17.5
2
100
0
70
48
0
0
51
1.00
123808462--123808528
34
1.9
36
85
11
95
26
2
7
62
1.36
123808512--123808543
16
2.0
16
93
0
55
28
6
6
59
1.46
123809505--123809614
26
4.2
26
92
0
175
33
5
23
37
1.78
123812671--123812725
24
2.3
24
77
0
56
63
5
10
20
1.46
123813172--123813204
12
3.0
11
87
12
50
51
9
0
39
1.34
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
123815112--123815615
87
5.8
87
77
6
491
22
21
21
35
1.96
123815150--123815307
44
3.6
44
73
6
151
19
22
22
35
1.96
123815055--123815576
264
2.0
264
93
1
886
23
21
19
35
1.96
123815617--123816014
177
2.2
177
95
0
708
25
20
21
32
1.98
123828319--123828351
12
3.0
11
87
12
50
51
9
0
39
1.34
123829766--123829837
31
2.3
31
100
0
144
15
19
48
16
1.81
123832964--123832994
15
2.0
16
93
6
55
61
0
0
38
0.96
123835294--123835339
23
2.0
23
83
8
58
34
4
0
60
1.16
123841286--123841318
13
2.4
14
95
5
59
0
21
0
78
0.75
123841535--123841564
5
6.0
5
100
0
60
60
0
0
40
0.97
123843719--123843758
19
2.1
19
85
0
53
50
2
0
47
1.14
123844614--123844640
2
13.5
2
100
0
54
51
0
0
48
1.00
123845289--123845362
29
2.5
30
88
4
105
21
14
14
48
1.80
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17
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1.98
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11
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44
17
1.83

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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