Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  245  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
73450944--73451102
43
3.7
43
80
9
182
25
19
23
30
1.98
73453035--73453205
46
3.7
46
78
12
206
23
20
26
29
1.99
73453030--73453200
93
1.8
93
92
2
290
22
20
27
29
1.99
73455860--73455891
4
8.0
4
92
0
55
25
3
0
71
1.00
73463342--73463444
51
2.0
51
94
0
179
36
17
12
33
1.88
73469096--73469303
40
5.2
40
82
2
202
25
23
25
25
2.00
73469098--73469303
80
2.6
80
83
3
236
25
23
26
24
2.00
73473478--73473627
40
3.8
40
77
12
132
26
24
26
22
2.00
73473517--73473643
40
3.2
40
77
4
132
24
24
28
22
2.00
73480347--73480553
40
5.2
40
82
2
193
25
23
25
25
2.00
73480388--73480553
80
2.1
80
85
4
219
24
24
27
23
2.00
73487898--73487951
24
2.2
24
86
0
72
12
40
31
14
1.84
73487985--73488104
58
2.1
59
87
3
172
30
25
21
22
1.99
73494532--73494585
24
2.2
24
96
0
99
7
42
35
14
1.74
73499565--73499604
19
2.0
20
86
13
57
50
0
7
42
1.30
73499558--73499855
133
2.3
133
88
4
448
44
3
11
40
1.59
73500487--73500919
133
3.2
133
94
1
735
43
3
12
40
1.60
73501041--73501194
83
1.9
83
98
0
299
29
25
12
32
1.92
73508376--73508480
47
2.2
47
96
0
192
34
7
30
27
1.85
73519312--73519336
13
1.9
13
100
0
50
24
12
8
56
1.62
73520226--73520316
45
2.0
45
89
0
137
38
24
13
24
1.91
73520245--73520320
21
3.5
21
65
16
55
40
26
11
21
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
73522120--73522210
45
2.0
45
91
0
146
39
24
10
25
1.88
73522139--73522214
21
3.5
21
65
16
55
39
26
11
22
1.88
73524774--73524828
21
2.6
21
72
11
58
30
38
10
20
1.87
73528050--73528093
22
2.0
22
86
0
61
40
0
18
40
1.50
73536126--73536241
43
2.7
42
80
10
119
31
21
18
28
1.97
73542163--73542200
2
18.5
2
94
5
67
50
0
2
47
1.15
73542914--73542950
5
7.6
5
93
6
67
81
0
0
18
0.70
73542914--73542950
14
2.6
14
95
4
65
81
0
0
18
0.70
73547371--73547398
5
5.6
5
100
0
56
82
0
0
17
0.68
73550358--73550462
43
2.4
43
93
0
183
30
14
21
33
1.93
73553123--73553162
20
2.0
20
85
9
55
27
25
20
27
1.99
73555437--73555472
3
12.0
3
87
0
54
63
5
0
30
1.17
73556102--73556152
18
2.9
17
74
25
61
31
0
29
39
1.57
73556281--73556449
41
4.1
41
86
3
198
28
21
15
34
1.94
73556274--73556464
82
2.3
81
82
3
222
29
21
17
31
1.96
73556823--73556869
22
2.1
22
84
7
60
44
31
2
21
1.64
73557466--73557756
41
7.1
41
82
1
298
23
19
20
36
1.95
73561707--73561869
25
6.6
25
67
17
65
38
20
22
18
1.93
73566140--73566333
96
2.0
96
90
0
307
35
17
34
12
1.88
73570270--73570421
17
8.5
18
87
4
193
38
12
12
36
1.81
73570270--73570421
70
2.1
72
90
3
236
38
12
12
36
1.81
73570902--73570956
17
3.4
16
75
18
53
36
1
0
61
1.06
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
73570933--73570981
26
1.9
25
83
4
62
36
4
0
59
1.17
73572843--73572885
19
2.2
18
84
12
50
65
11
2
20
1.36
73573242--73573285
23
1.9
23
85
0
61
36
18
20
25
1.95
73580953--73580991
21
1.9
21
89
5
62
69
0
12
17
1.19
73581614--73581653
20
2.0
20
85
0
53
77
7
0
15
0.98
73581671--73581746
18
4.3
18
76
14
59
28
7
17
46
1.76
73581680--73581746
27
2.5
27
83
7
75
29
8
16
44
1.78
73584015--73584047
2
16.5
2
100
0
66
51
0
0
48
1.00
73584078--73584157
29
2.7
29
86
5
108
27
32
15
25
1.95
73584623--73584656
2
17.0
2
100
0
68
50
0
0
50
1.00
73597009--73597068
30
2.0
30
90
0
93
31
25
6
36
1.82
73599291--73599395
27
3.9
26
86
5
111
39
16
9
35
1.81
73599306--73599395
27
3.3
27
89
3
128
40
16
10
33
1.82
73599407--73599611
27
7.6
27
91
0
293
28
23
8
39
1.84
73599455--73599729
27
10.2
27
86
2
122
33
23
8
34
1.84
73599407--73599639
81
2.9
81
83
1
279
29
23
8
38
1.84
73599590--73599813
54
4.1
55
76
7
172
40
20
8
30
1.82
73599388--73599729
81
4.2
81
79
1
220
33
23
8
35
1.84
73599604--73599732
27
4.8
27
86
3
179
41
21
6
29
1.79
73599605--73599759
81
1.9
81
85
2
213
40
21
8
29
1.82
73599860--73599933
27
2.7
27
76
12
71
37
20
18
22
1.94
73599873--73599937
27
2.4
27
82
5
78
36
20
23
20
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
73600740--73600837
26
3.8
26
91
1
162
26
22
23
27
1.99
73600982--73601073
42
2.2
42
90
0
139
30
14
20
34
1.92
73601097--73601175
31
2.5
31
91
0
131
30
17
25
26
1.97
73604661--73604700
16
2.6
16
92
4
64
67
2
10
20
1.31
73613560--73613808
96
2.6
96
81
1
302
27
17
28
26
1.97
73613557--73613781
48
4.7
48
89
0
315
25
17
30
26
1.97
73618921--73619074
39
3.9
39
86
0
191
24
31
21
22
1.98
73618951--73619074
39
3.2
39
90
1
194
25
32
20
22
1.98
73621233--73621263
15
2.1
15
100
0
62
16
19
19
45
1.86
73626825--73626966
40
3.6
40
87
1
182
23
31
21
23
1.98
73626855--73626978
39
3.2
39
88
3
178
25
32
19
22
1.97
73634732--73634854
38
3.2
39
89
2
185
25
31
20
22
1.98
73636145--73636312
40
4.2
40
79
3
178
24
27
22
25
2.00
73644200--73644368
40
4.2
40
77
1
160
27
26
21
25
1.99
73647201--73647373
46
3.7
46
76
14
185
21
19
27
30
1.98
73647198--73647368
93
1.8
93
91
2
281
21
19
28
29
1.98
73647597--73647634
19
2.0
20
85
15
53
36
0
23
39
1.55
73651891--73652063
46
3.7
46
80
13
219
21
20
28
30
1.98
73651888--73652058
93
1.8
93
96
0
315
21
20
29
29
1.98
73652288--73652325
19
2.0
20
85
15
53
36
0
23
39
1.55
73654504--73654779
39
7.1
39
93
0
462
22
25
29
23
1.99
73656678--73656708
14
2.2
14
100
0
62
29
16
19
35
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
73656791--73657221
27
16.2
27
75
10
235
30
10
18
39
1.85
73656875--73657135
54
4.8
53
80
6
265
28
8
20
42
1.81
73656875--73657165
81
3.6
81
80
3
318
29
9
20
40
1.83
73658826--73658992
71
2.3
72
89
4
248
26
20
22
30
1.98
73658826--73658992
24
7.0
24
91
3
248
26
20
22
30
1.98
73659042--73659108
20
3.3
20
91
0
107
32
22
11
32
1.90
73667116--73667264
48
3.1
48
95
0
253
29
20
19
30
1.97
73667116--73667264
24
6.2
24
92
1
228
29
20
19
30
1.97
73667319--73667360
20
2.1
20
90
0
66
30
21
14
33
1.93
73683013--73683187
46
3.8
45
80
11
203
20
21
29
29
1.98
73683010--73683180
92
1.9
92
94
0
306
20
21
29
28
1.98
73689635--73689659
10
2.5
10
100
0
50
28
0
8
64
1.22
73693716--73693939
46
4.8
45
74
14
120
29
17
27
25
1.97
73700054--73700112
20
3.0
20
92
0
100
33
10
22
33
1.87
73700170--73700264
24
4.0
24
95
2
174
31
22
21
25
1.98
73700170--73700264
47
2.0
48
97
2
183
31
22
21
25
1.98
73704805--73705008
49
4.2
49
96
2
351
29
7
31
30
1.86
73706368--73706534
40
4.2
40
82
2
185
25
27
21
25
1.99
73706368--73706534
80
2.1
79
83
7
205
25
27
21
25
1.99
73707360--73707405
17
2.5
19
74
22
53
34
23
17
23
1.96
73714373--73714539
40
4.2
40
82
2
185
25
27
21
25
1.99
73714373--73714539
80
2.1
79
83
7
205
25
27
21
25
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
73715364--73715409
17
2.5
19
74
22
53
34
23
17
23
1.96
73722937--73723153
40
5.5
40
88
2
278
23
23
28
25
1.99
73726118--73726165
25
1.9
25
91
0
78
31
25
16
27
1.97
73726202--73726242
20
2.0
20
95
0
73
34
9
21
34
1.87
73726297--73726465
24
7.0
24
90
2
232
30
21
21
26
1.99
73729396--73729781
50
7.7
50
76
2
344
26
17
26
29
1.98
73729357--73729569
101
2.1
102
82
0
248
27
14
26
31
1.95
73729403--73729773
101
3.7
101
76
3
228
26
17
26
29
1.98
73729398--73729782
151
2.5
151
86
2
549
26
17
26
29
1.98
73730357--73730682
179
1.8
179
89
1
510
39
9
19
32
1.83

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770