Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  259  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
77839664--77839730
8
8.4
8
69
18
50
53
31
1
13
1.49
77843923--77844023
28
3.5
28
86
6
114
28
13
27
29
1.95
77843952--77844023
29
2.5
28
91
6
110
29
13
27
29
1.95
77849292--77849357
28
2.4
28
80
11
75
42
1
4
51
1.31
77856477--77856514
15
2.4
16
86
8
51
63
0
2
34
1.09
77858503--77858671
40
4.2
39
80
5
185
20
26
18
34
1.96
77858539--77858641
20
5.2
20
60
9
57
19
28
19
33
1.96
77858524--77858672
80
1.9
81
89
1
237
18
25
19
36
1.95
77860293--77860453
86
1.9
86
81
5
200
36
22
15
26
1.94
77868258--77868428
93
1.8
93
93
0
297
28
28
21
21
1.98
77868253--77868425
46
3.7
46
79
10
208
29
27
20
21
1.98
77875808--77875978
93
1.8
93
93
0
297
28
28
21
21
1.98
77875803--77875975
46
3.7
46
79
10
208
29
27
20
21
1.98
77881414--77881469
27
2.1
27
100
0
112
16
17
14
51
1.76
77887468--77887523
27
2.1
27
100
0
112
16
17
14
51
1.76
77893020--77893186
40
4.2
40
81
2
176
23
27
22
26
1.99
77903080--77903201
61
2.0
61
91
0
199
49
23
3
23
1.65
77904873--77904965
43
2.1
44
84
4
116
22
16
33
27
1.95
77906520--77906610
45
2.0
45
86
0
128
24
15
24
36
1.94
77906564--77906718
43
3.7
41
76
8
123
27
16
25
30
1.96
77906532--77906731
84
2.3
89
73
12
193
27
17
26
29
1.98
77908286--77908362
38
2.0
38
94
0
136
19
25
33
20
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
77912066--77912127
27
2.3
27
88
0
88
25
20
17
35
1.95
77912616--77912718
51
2.0
51
98
0
197
29
23
18
29
1.98
77922670--77922694
13
1.9
13
100
0
50
32
0
0
68
0.90
77922838--77922885
25
1.9
25
87
8
71
37
6
0
56
1.25
77927204--77927236
15
2.2
15
100
0
66
54
0
39
6
1.25
77935135--77935828
205
3.4
205
88
2
1018
30
17
21
30
1.96
77937826--77937873
25
1.9
25
83
8
62
37
4
0
58
1.18
77939769--77939897
40
3.3
38
82
5
159
24
27
23
24
2.00
77944747--77944944
71
2.8
70
92
3
294
33
17
28
20
1.95
77944813--77944930
41
3.1
41
60
28
98
32
17
28
21
1.96
77944781--77944944
71
2.3
71
100
0
328
35
17
28
18
1.94
77954710--77954827
41
3.1
41
60
28
98
32
17
28
21
1.96
77954678--77954841
71
2.3
71
100
0
328
35
17
28
18
1.94
77956161--77956492
40
8.3
40
96
0
601
26
28
20
24
1.99
77957779--77957916
37
3.7
37
90
0
222
23
32
18
24
1.97
77958059--77958292
48
4.9
48
97
0
432
30
29
6
33
1.83
77958059--77958321
96
2.8
96
90
2
334
32
28
7
31
1.85
77958059--77958321
144
1.8
144
86
4
388
32
28
7
31
1.85
77961916--77961970
25
2.2
26
83
9
69
34
7
10
47
1.66
77964508--77964682
46
3.8
45
79
7
156
30
25
14
29
1.95
77966701--77966875
46
3.8
46
76
13
160
31
30
18
18
1.96
77966710--77966880
93
1.8
93
89
0
270
30
30
19
19
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
77968649--77968726
22
3.6
22
91
1
122
26
23
16
33
1.96
77969104--77969169
19
3.6
19
80
11
68
72
0
6
21
1.05
77970023--77970055
13
2.5
13
100
0
66
48
15
0
36
1.45
77970624--77970657
15
2.3
15
89
0
50
17
0
0
82
0.67
77978138--77978321
40
4.6
40
75
9
144
25
27
21
26
1.99
77978166--77978269
39
2.6
40
87
1
156
25
29
20
25
1.99
77978166--77978322
79
2.0
80
82
6
194
25
27
21
26
1.99
77985197--77985266
27
2.6
27
95
2
122
30
27
14
28
1.95
77994901--77994969
15
4.6
15
83
0
84
11
17
13
57
1.64
77994892--77994979
30
3.0
30
81
8
99
10
17
15
56
1.66
78001377--78001446
27
2.6
27
95
2
122
30
27
14
28
1.95
78005631--78005813
79
2.3
81
85
7
241
26
27
21
24
1.99
78005610--78005813
40
5.1
40
84
7
247
25
27
21
24
1.99
78010976--78011017
17
2.4
17
84
11
50
78
0
2
19
0.86
78011008--78011062
19
2.8
19
78
10
58
69
0
7
23
1.14
78010996--78011062
19
3.7
18
73
13
57
71
0
5
22
1.07
78011916--78011971
13
4.5
13
75
20
57
46
17
0
35
1.49
78012660--78012692
5
6.6
5
86
13
50
18
0
0
81
0.68
78012660--78012695
14
2.5
15
91
8
58
16
0
0
83
0.65
78017714--78017797
39
2.2
38
82
2
96
45
19
5
29
1.74
78019872--78019900
2
15.0
2
92
7
51
48
0
0
51
1.00
78020930--78020987
30
2.0
29
86
3
80
53
6
3
36
1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
78028790--78028944
47
3.3
47
97
1
283
32
7
31
28
1.84
78028873--78028953
22
3.5
22
67
23
60
32
8
33
25
1.86
78028914--78028973
29
2.1
29
96
0
111
33
11
33
21
1.90
78028867--78029020
76
2.0
76
98
0
299
32
9
32
25
1.88
78028943--78029123
96
1.9
96
91
2
301
33
8
30
27
1.86
78028790--78029108
172
1.9
171
93
2
559
32
8
31
27
1.86
78028943--78029135
47
4.1
47
90
5
291
34
8
30
26
1.86
78030975--78031128
40
3.9
40
95
0
265
20
23
30
25
1.99
78031374--78031424
25
2.0
25
81
7
59
33
13
31
21
1.92
78035177--78035434
47
5.4
47
91
3
401
34
7
30
28
1.84
78035177--78035419
96
2.5
94
93
2
396
34
7
29
28
1.85
78035177--78035446
143
1.9
143
90
3
436
34
7
30
28
1.84
78038211--78038284
31
2.5
30
82
10
98
21
32
21
24
1.98
78041162--78041218
25
2.3
25
90
0
87
28
24
17
29
1.97
78048571--78048638
29
2.4
28
83
9
84
33
5
10
50
1.61
78053134--78053234
24
4.2
23
88
6
139
36
5
37
19
1.77
78053551--78053638
45
2.0
45
90
0
140
21
21
13
43
1.87
78055542--78055722
77
2.3
81
83
10
232
25
27
22
24
2.00
78055521--78055722
40
5.1
40
81
9
229
25
27
21
24
1.99
78063681--78063862
78
2.3
81
83
9
232
25
28
21
24
1.99
78063660--78063862
40
5.1
40
82
8
238
25
28
21
24
1.99
78069227--78069410
79
2.3
81
82
8
218
23
27
24
24
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
78069220--78069410
39
4.8
39
75
10
154
23
28
24
24
2.00
78073394--78073731
49
6.9
49
94
2
554
34
8
27
29
1.87
78073394--78073731
96
3.4
98
92
2
554
34
8
27
29
1.87
78073402--78073731
145
2.2
148
92
2
549
33
9
27
29
1.88
78073688--78073933
123
2.0
123
98
0
474
32
8
26
32
1.86
78073795--78073830
18
2.0
18
88
0
54
33
11
22
33
1.89
78073747--78073885
75
2.0
69
82
12
167
32
9
25
32
1.88
78073846--78073997
48
3.2
48
97
0
277
33
5
27
32
1.81
78073639--78073980
171
2.0
172
87
5
496
32
7
27
32
1.85
78074037--78074164
37
3.4
37
95
1
229
24
18
32
25
1.97
78080420--78080520
24
4.2
23
90
6
148
37
4
37
19
1.74
78083259--78083400
47
3.0
47
94
1
241
28
12
14
44
1.81
78084205--78084467
45
6.0
44
81
5
266
26
20
26
25
1.99
78084205--78084467
44
6.0
45
81
5
274
26
20
26
25
1.99
78086722--78086929
40
5.2
40
80
3
231
25
26
22
25
2.00
78097484--78097705
40
5.6
40
91
3
351
22
22
26
27
1.99
78097484--78097705
79
2.8
79
93
4
358
22
22
26
27
1.99
78097484--78097705
119
1.9
120
91
4
369
22
22
26
27
1.99
78106063--78106281
40
5.6
40
91
3
340
22
23
25
28
1.99
78109366--78109483
43
2.8
43
79
6
141
30
22
16
29
1.96
78110762--78110873
55
2.0
55
94
0
197
25
23
16
34
1.95
78113083--78113269
71
2.7
68
93
5
281
18
28
18
34
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
78113106--78113269
71
2.3
71
100
0
328
18
28
17
35
1.94
78113106--78113303
71
2.8
70
92
3
276
20
28
17
33
1.95
78120140--78120326
71
2.7
68
93
5
281
18
28
18
34
1.95
78120163--78120326
71
2.3
71
100
0
328
18
28
17
35
1.94
78120163--78120360
71
2.8
70
92
3
276
20
28
17
33
1.95
78122822--78122859
19
2.0
20
85
15
53
39
23
0
36
1.55
78125429--78125538
18
6.1
18
81
4
123
36
15
14
33
1.88
78125435--78125538
54
1.9
54
86
0
145
35
15
14
34
1.88
78125429--78125538
36
3.1
36
83
0
139
36
15
14
33
1.88
78126484--78126524
12
3.5
11
90
6
55
26
17
0
56
1.41

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770