Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: Chr14 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  34  of  770  ( 92376 repeats found )
Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9797952--9798042
19
4.9
19
85
8
134
37
12
14
36
1.83
9797960--9798040
35
2.2
37
89
6
121
37
13
12
37
1.83
9798529--9798587
16
3.5
16
74
23
50
35
1
0
62
1.05
9798522--9798596
30
2.6
29
76
17
75
36
1
0
62
1.04
9799913--9799940
6
4.7
6
100
0
56
50
0
0
50
1.00
9800443--9800509
31
2.2
31
89
2
100
65
7
8
17
1.43
9803966--9803990
6
4.2
6
100
0
50
52
0
0
48
1.00
9804446--9804478
2
17.0
2
93
6
59
48
0
0
51
1.00
9808457--9808497
20
2.0
21
85
4
57
31
4
0
63
1.15
9808538--9808590
20
3.0
17
84
13
54
33
0
1
64
1.05
9808546--9808682
22
7.2
19
67
27
69
32
3
0
62
1.18
9808546--9808682
17
7.2
20
70
23
75
32
3
0
62
1.18
9808546--9808661
35
3.1
36
70
17
94
31
4
0
62
1.20
9808892--9808926
18
1.9
18
88
0
52
37
5
0
57
1.23
9809285--9809354
33
2.1
33
94
0
122
25
10
5
58
1.52
9821164--9821668
205
2.5
206
88
2
755
31
18
21
28
1.97
9823271--9823329
25
2.5
23
81
13
59
37
1
1
59
1.18
9823286--9823330
22
2.1
22
84
8
58
37
0
2
60
1.09
9823292--9823387
3
32.7
3
71
21
53
33
4
0
62
1.14
9823344--9823424
33
2.4
32
84
12
92
32
4
1
61
1.25
9824036--9824105
33
2.1
33
97
0
131
24
10
7
58
1.55
9824146--9824178
2
16.5
2
100
0
66
48
0
0
51
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9825235--9825360
32
3.9
32
82
3
110
34
18
13
34
1.90
9825353--9825538
29
6.4
29
88
0
255
24
27
12
35
1.91
9830007--9830114
26
4.2
26
93
0
189
36
24
7
32
1.83
9837014--9837120
26
4.2
26
92
1
180
36
24
6
32
1.81
9839462--9839495
6
5.7
6
100
0
68
50
0
0
50
1.00
9839994--9840061
31
2.2
31
89
2
102
66
5
7
20
1.38
9840002--9840050
17
3.1
17
74
11
50
67
6
6
20
1.35
9843510--9843534
6
4.2
6
100
0
50
52
0
0
48
1.00
9844624--9844669
25
1.9
23
82
8
56
67
6
6
19
1.36
9845157--9845203
22
2.2
21
84
3
58
36
21
8
34
1.84
9845174--9845248
19
3.9
19
89
10
118
36
16
10
37
1.83
9845174--9845246
36
2.0
38
94
5
132
35
15
10
38
1.82
9845196--9845233
17
2.5
15
87
12
51
34
15
10
39
1.82
9845705--9846279
175
3.3
175
92
1
920
26
20
20
33
1.97
9846231--9846316
44
1.9
45
88
4
129
25
24
17
32
1.97
9846283--9846528
123
2.0
124
90
0
386
26
22
17
33
1.96
9852874--9852939
19
3.2
21
87
6
64
36
19
9
34
1.84
9852891--9852987
19
5.2
19
91
8
155
36
16
10
37
1.83
9852913--9852969
17
3.5
15
88
11
53
35
15
10
38
1.82
9852891--9852987
36
2.6
37
88
11
144
36
16
10
37
1.83
9853433--9853465
2
17.0
2
93
6
59
48
0
0
51
1.00
9857942--9858049
26
4.2
26
92
0
180
37
26
5
30
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9858315--9858451
32
4.2
32
93
0
211
33
21
13
31
1.92
9858444--9858512
29
2.4
29
92
0
111
24
28
11
34
1.91
9862391--9862418
6
4.7
6
100
0
56
50
0
0
50
1.00
9862910--9862977
31
2.2
31
89
2
102
64
4
8
22
1.40
9864396--9864446
23
2.4
21
78
15
59
29
21
11
37
1.89
9866425--9866449
6
4.2
6
100
0
50
52
0
0
48
1.00
9867975--9868053
19
4.2
19
90
9
126
35
15
10
39
1.81
9867997--9868053
17
3.5
15
88
11
53
35
15
10
38
1.82
9867975--9868053
36
2.1
38
90
9
126
35
15
10
39
1.81
9868635--9868836
87
2.3
89
93
3
338
26
21
19
32
1.97
9868958--9869436
84
5.8
84
88
7
719
23
23
23
29
1.99
9868960--9869436
166
2.9
167
89
5
699
23
23
23
29
1.99
9869179--9869318
43
3.3
43
68
15
137
26
20
22
30
1.98
9868958--9869436
250
1.9
250
95
0
859
23
23
23
29
1.99
9870748--9871235
47
10.3
47
89
0
699
32
8
30
28
1.87
9870748--9871235
94
5.2
94
92
1
771
32
8
30
28
1.87
9872899--9873117
43
5.2
43
67
20
129
26
21
21
30
1.99
9872942--9873074
41
3.2
41
69
19
130
24
22
24
29
1.99
9872896--9873127
84
2.8
84
94
0
410
26
21
22
29
1.99
9874093--9874142
24
2.1
23
85
3
64
4
10
0
86
0.71
9874116--9874153
10
3.8
10
80
13
51
0
18
0
81
0.69
9874093--9874154
20
3.3
18
79
14
63
3
12
0
83
0.75
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9876338--9876384
23
2.0
23
100
0
94
42
19
8
29
1.80
9878301--9878345
21
2.1
21
83
0
54
46
8
22
22
1.79
9879700--9879765
19
3.2
21
87
6
64
36
19
9
34
1.84
9879717--9879814
19
5.2
19
92
7
164
35
16
10
37
1.82
9879717--9879814
36
2.6
37
90
9
153
35
16
10
37
1.82
9880380--9880420
2
21.0
2
95
5
75
48
0
0
51
1.00
9881708--9881812
55
1.9
55
84
3
140
20
28
29
20
1.98
9882583--9882884
47
6.5
46
72
13
174
23
29
19
27
1.98
9882755--9882934
91
2.0
88
83
6
227
23
28
20
27
1.99
9882622--9882934
138
2.3
139
77
8
316
23
29
20
26
1.99
9883360--9883398
11
3.6
11
89
3
53
12
2
5
79
1.00
9883370--9883403
11
3.1
11
91
0
50
14
0
5
79
0.91
9884402--9884434
17
2.0
17
94
5
59
36
15
0
48
1.45
9884714--9884977
138
1.9
138
87
0
384
20
23
14
41
1.89
9884719--9884991
46
5.9
46
87
0
341
20
23
13
41
1.88
9885026--9885162
54
2.5
54
98
0
265
29
23
19
27
1.98
9889768--9889906
27
5.3
27
91
4
187
35
23
23
17
1.95
9891470--9891604
26
5.2
26
97
0
227
36
24
5
34
1.78
9895545--9895684
27
5.2
28
90
5
184
35
22
24
17
1.96
9897295--9897429
26
5.2
26
95
1
227
36
24
5
34
1.78
9897923--9897956
15
2.3
15
100
0
68
61
11
5
20
1.50
9902185--9902222
16
2.4
16
86
4
51
68
5
0
26
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9902494--9902613
21
5.7
20
68
22
77
60
1
3
35
1.23
9902501--9902602
42
2.5
40
79
19
120
59
0
3
35
1.22
9902532--9902613
10
7.7
12
74
20
51
59
0
2
37
1.11
9902503--9902605
24
3.7
28
69
27
85
59
0
3
35
1.23
9902570--9902622
25
2.1
25
82
6
63
62
1
1
33
1.17
9904203--9904883
44
15.5
44
88
2
915
29
27
13
29
1.95
9916973--9917083
10
10.6
10
71
25
79
57
1
4
36
1.29
9916964--9917023
21
2.8
22
76
23
65
61
3
3
31
1.28
9916951--9917083
12
11.1
12
72
14
62
58
2
3
35
1.28
9920577--9920624
23
2.1
23
84
7
62
27
20
12
39
1.89
9923016--9923095
19
4.3
19
79
6
83
37
17
7
37
1.78
9923448--9923645
45
4.5
45
82
3
240
23
29
14
31
1.94
9923462--9923626
87
1.9
89
88
2
253
26
30
13
29
1.94
9923947--9924603
44
14.9
44
72
13
248
28
26
15
29
1.96
9923949--9924608
176
3.8
176
93
0
1054
28
26
15
29
1.96
9925606--9925677
7
9.9
7
77
19
76
2
13
0
83
0.76
9925606--9925677
23
3.3
22
86
11
103
2
13
0
83
0.76
9931374--9931399
5
5.2
5
100
0
52
38
23
0
38
1.55
9931356--9931468
19
6.2
19
81
14
139
37
17
7
37
1.79
9932158--9932182
6
4.2
6
100
0
50
52
0
0
48
1.00
9933913--9934039
55
2.3
55
84
2
157
24
29
24
21
1.99
9934886--9935017
47
2.8
47
80
7
142
21
31
19
26
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9934792--9935104
92
3.4
92
74
11
239
22
30
20
26
1.98
9935526--9935582
5
10.6
5
81
10
60
22
0
0
77
0.77
9935526--9935588
29
2.2
29
88
5
92
25
0
0
74
0.82
9940370--9940407
20
2.0
20
89
5
60
39
2
13
44
1.57
9943268--9943463
17
11.4
17
69
15
75
59
3
4
32
1.33
9943367--9943465
3
33.7
3
69
22
50
62
3
1
33
1.17
9943299--9943422
10
13.0
10
68
15
66
61
2
4
31
1.30
9945136--9945403
45
5.9
45
78
6
274
26
27
15
30
1.96
9945144--9945312
89
1.9
89
90
2
268
27
29
14
28
1.95
9945343--9945637
78
3.8
78
89
1
466
24
23
19
32
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770