Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          769   770   

This is table  423  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
130588460--130588495
15
2.5
14
86
8
54
41
0
0
58
0.98
130588667--130588705
21
1.9
21
94
5
71
30
25
10
33
1.89
130591230--130591254
12
2.1
12
100
0
50
44
0
8
48
1.32
130602988--130603027
13
2.8
15
85
14
66
35
0
0
65
0.93
130605795--130605823
14
2.1
14
100
0
58
27
13
6
51
1.66
130609990--130610058
21
3.3
21
87
2
95
11
24
8
55
1.64
130612424--130612517
18
5.4
18
92
3
131
28
9
25
36
1.87
130619885--130620068
40
4.6
39
75
6
138
26
23
27
22
2.00
130619925--130620113
80
2.4
81
77
4
186
23
24
29
22
1.99
130628002--130628185
40
4.6
39
75
6
138
26
23
27
22
2.00
130628042--130628230
80
2.4
81
77
4
186
23
24
29
22
1.99
130639289--130639343
2
29.0
2
78
10
53
52
7
0
40
1.29
130639289--130639340
22
2.3
23
90
6
88
53
7
0
38
1.30
130639862--130639898
11
3.2
12
88
11
60
45
0
54
0
1.00
130639860--130639909
11
4.5
11
82
9
57
44
0
56
0
0.99
130640169--130640204
14
2.5
15
95
4
65
16
5
13
63
1.47
130640167--130640242
33
2.4
30
82
10
98
11
6
18
63
1.49
130640168--130640205
15
2.5
16
87
12
62
15
5
13
65
1.43
130640168--130640236
15
4.5
15
69
26
56
13
5
18
62
1.50
130640643--130640748
35
3.0
35
95
0
194
22
12
49
16
1.78
130641116--130641161
22
2.1
22
87
0
65
39
36
0
23
1.55
130641155--130641193
20
2.0
20
84
0
51
58
23
0
17
1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
130641726--130641832
25
4.2
25
93
2
178
34
5
22
37
1.78
130641726--130641832
51
2.1
50
92
1
178
34
5
22
37
1.78
130643316--130643367
25
2.0
26
85
3
70
38
23
13
25
1.91
130643614--130644035
136
3.1
136
97
0
790
24
18
25
31
1.97
130645733--130645855
17
7.1
18
70
16
64
29
4
2
63
1.28
130645759--130645994
3
80.3
3
70
14
145
30
5
2
62
1.29
130647167--130647205
2
20.0
2
94
5
71
48
0
0
51
1.00
130649097--130649150
23
2.5
23
82
8
60
61
7
0
31
1.24
130649160--130649221
25
2.5
23
75
17
54
54
1
9
33
1.43
130649361--130649409
15
3.1
15
82
8
53
69
0
6
24
1.11
130649371--130649426
29
2.0
28
86
10
78
66
0
8
25
1.21
130651606--130651670
35
1.9
32
90
9
103
55
9
15
20
1.67
130655213--130655237
6
4.2
6
100
0
50
0
48
52
0
1.00
130655290--130655346
21
2.6
22
83
8
71
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Size
Copy
Number
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Size
Percent
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Percent
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Score
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Period
Size
Copy
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24
21
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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