genome.fa.s14.2.7.7.80.10.50.1000.334.html

Tandem Repeats Finder Program written by:

Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          769   770   

This is table  334  of  770  ( 92376 repeats found )

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Table Explanation

Indices	Period Size	Copy Number	Consensus Size	Percent Matches	Percent Indels	Score	A	C	G	T	Entropy (0-2)
102181026--102181113	37	2.4	37	92	0	140	17	18	14	50	1.79
102183046--102183208	27	6.0	27	86	0	200	40	21	6	31	1.78
102183055--102183207	54	2.8	54	89	0	225	41	21	5	30	1.77
102183055--102183206	81	1.9	81	91	0	250	42	21	5	30	1.76
102183055--102183292	27	8.8	27	81	7	191	39	21	8	31	1.83
102183081--102183303	81	2.8	81	80	4	218	40	20	8	30	1.81
102183326--102183845	27	19.3	27	86	0	646	34	19	21	25	1.96
102184301--102184393	19	4.6	19	71	21	73	17	17	16	49	1.80
102184301--102184365	25	2.6	25	90	0	94	16	18	16	47	1.83
102184298--102184401	31	3.5	31	71	19	89	17	16	15	50	1.78
102184298--102184410	6	18.3	6	72	18	90	17	15	15	50	1.78
102184320--102184410	37	2.5	37	85	3	121	17	16	16	49	1.80
102186357--102186616	27	9.6	27	84	1	245	39	21	8	31	1.83
102186651--102187087	27	16.3	27	87	2	549	34	18	21	25	1.96
102188669--102188878	40	5.2	40	88	2	305	21	28	24	25	1.99
102201328--102201457	40	3.3	39	76	8	136	23	27	23	24	2.00
102201344--102201495	40	3.8	40	78	6	148	22	26	23	27	1.99
102201344--102201493	80	1.9	80	83	8	198	22	26	24	27	1.99
102212610--102212688	38	2.1	38	100	0	158	41	16	5	36	1.70
102213308--102213339	15	2.1	15	100	0	64	34	21	12	31	1.91
102224094--102224124	16	1.9	16	93	0	53	35	22	0	41	1.54
102224091--102224130	20	2.0	20	85	0	53	37	22	0	40	1.54
Indices	Period Size	Copy Number	Consensus Size	Percent Matches	Percent Indels	Score	A	C	G	T	Entropy (0-2)
102224315--102224569	55	4.8	53	81	9	254	21	25	17	36	1.94
102224362--102224562	108	1.8	110	91	2	334	22	25	17	34	1.95
102226569--102226610	20	2.1	20	95	0	75	26	16	16	40	1.90
102228042--102228106	33	1.9	34	96	3	123	41	15	9	33	1.79
102235094--102235270	39	4.6	39	86	6	245	23	22	25	28	1.99
102235094--102235270	38	4.6	39	87	5	227	23	22	25	28	1.99
102235094--102235270	77	2.3	78	88	6	254	23	22	25	28	1.99
102246407--102246641	125	1.8	129	83	9	320	49	6	3	40	1.46
102246661--102246718	30	2.0	30	82	3	73	43	12	8	36	1.73
102262536--102262666	30	4.5	30	86	8	171	28	25	13	32	1.94
102262535--102262666	58	2.3	58	85	4	176	28	26	13	31	1.94
102270488--102270618	30	4.5	30	86	8	171	28	25	13	32	1.94
102270487--102270618	58	2.3	58	85	4	176	28	26	13	31	1.94
102273517--102273551	17	2.1	17	94	0	61	14	22	37	25	1.92
102273537--102273611	29	2.6	29	86	0	114	21	14	36	28	1.93
102274664--102274698	18	2.0	18	88	5	54	37	20	14	28	1.91
102279159--102279294	40	3.4	40	93	0	227	28	27	21	22	1.99
102281949--102282162	40	5.4	40	89	3	292	25	22	27	24	2.00
102281943--102282168	79	2.9	80	86	4	300	25	22	26	25	2.00
102290984--102291151	40	4.2	40	78	6	164	23	25	22	28	1.99
102298103--102298310	40	5.2	40	82	2	202	25	23	25	25	2.00
102298105--102298310	80	2.6	80	83	3	236	25	23	26	24	2.00
Indices	Period Size	Copy Number	Consensus Size	Percent Matches	Percent Indels	Score	A	C	G	T	Entropy (0-2)
102301955--102302160	40	5.2	40	81	4	193	25	23	26	25	2.00
102301957--102302160	78	2.6	80	84	3	243	25	23	26	25	2.00
102309656--102309863	40	5.2	39	78	9	186	25	24	25	25	2.00
102309657--102309863	80	2.6	78	80	8	220	25	24	25	25	2.00
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102325460--102325629	40	4.2	40	85	3	225	21	28	24	25	1.99
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102356896--102357055	85	1.9	84	83	7	207	26	20	26	27	1.99
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102502373--102502516	71	2.0	72	86	6	204	29	21	22	26	1.99
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102520069--102520191	38	3.2	38	84	2	147	33	26	19	20	1.96
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102527209--102527316	40	2.7	39	81	13	123	25	25	28	20	1.99
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Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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