Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  318  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
97265813--97265886
31
2.3
33
86
6
100
51
0
4
44
1.20
97271513--97271562
25
2.0
25
100
0
100
28
8
0
64
1.22
97271513--97271555
15
3.2
15
69
30
51
27
6
0
65
1.18
97271517--97271570
25
2.3
23
84
12
67
35
7
0
57
1.27
97287607--97287664
29
2.0
29
100
0
116
31
13
17
37
1.89
97288823--97288850
14
2.0
14
100
0
56
35
21
7
35
1.81
97289391--97289436
23
2.0
23
100
0
92
39
13
13
34
1.83
97294091--97294129
16
2.7
15
88
11
55
76
0
5
17
0.96
97294793--97294817
11
2.3
11
100
0
50
28
0
8
64
1.22
97295401--97295440
21
1.9
21
89
0
62
57
0
12
30
1.36
97295565--97295593
14
2.1
14
100
0
58
51
13
0
34
1.42
97297280--97297319
19
2.1
19
90
0
62
52
2
15
30
1.55
97298818--97298850
16
2.1
16
94
0
57
39
12
9
39
1.74
97311578--97311615
20
1.9
20
100
0
76
15
10
18
55
1.68
97312488--97312617
40
3.2
40
84
4
174
22
24
29
23
1.99
97314219--97314255
15
2.5
15
86
0
56
24
18
27
29
1.98
97318198--97318443
49
5.0
49
81
3
276
30
27
17
24
1.97
97319089--97319148
30
2.0
30
84
9
79
26
26
8
38
1.85
97324093--97324237
40
3.6
40
81
3
166
23
24
26
25
2.00
97324091--97324244
80
1.9
80
82
2
193
24
23
26
25
2.00
97327159--97327389
49
4.7
49
83
3
293
30
27
17
24
1.97
97327150--97327389
100
2.4
98
86
3
329
30
27
18
24
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
97332496--97332669
45
3.8
45
81
9
217
28
29
20
21
1.98
97332504--97332671
93
1.8
92
94
1
300
27
29
20
21
1.98
97339018--97339078
30
2.0
30
83
0
77
39
8
22
29
1.83
97339813--97339984
67
2.7
64
74
11
170
28
17
30
23
1.97
97351710--97351774
32
2.1
32
97
2
123
27
20
33
18
1.96
97352721--97352772
27
2.0
26
84
3
68
17
26
21
34
1.95
97352812--97352871
27
2.3
27
85
2
77
21
23
20
35
1.96
97352788--97352850
32
2.0
32
83
0
81
19
23
20
36
1.95
97359641--97359818
43
4.1
43
90
0
284
12
25
31
30
1.93
97366490--97366543
22
2.3
23
82
14
67
22
24
20
33
1.97
97366549--97366610
25
2.5
26
82
10
67
32
19
19
29
1.96
97372586--97372687
29
3.5
28
79
10
109
27
24
16
31
1.96
97375646--97375692
24
1.9
24
82
4
58
48
29
2
19
1.60
97376438--97376520
43
1.9
43
92
0
139
36
24
14
25
1.93
97389967--97390108
40
3.6
40
87
2
198
23
20
27
28
1.99
97391902--97391981
29
2.8
28
87
7
117
22
15
35
27
1.94
97395684--97395722
16
2.5
15
84
12
51
48
10
25
15
1.76
97395948--97396034
28
3.1
28
80
6
104
24
11
35
28
1.90
97396703--97396728
11
2.4
11
100
0
52
26
0
19
53
1.45
97399586--97399688
42
2.4
44
80
9
124
28
18
22
31
1.97
97399618--97399706
43
2.1
42
85
10
119
25
19
24
30
1.98
97404999--97405181
78
2.3
80
83
7
214
24
27
23
24
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
97404992--97405181
39
4.8
39
75
10
154
23
28
23
24
2.00
97411438--97411538
28
3.5
30
82
6
118
29
14
26
28
1.95
97411467--97411542
29
2.7
28
76
13
75
30
14
26
28
1.95
97419325--97419425
28
3.5
30
82
6
118
29
14
26
28
1.95
97419354--97419429
29
2.7
28
76
13
75
30
14
26
28
1.95
97423310--97423479
45
3.7
44
75
16
166
23
20
27
29
1.99
97427379--97427527
43
3.5
43
80
7
176
31
26
16
24
1.97
97427360--97427541
44
4.2
44
73
10
151
30
26
17
25
1.97
97428635--97428659
13
1.9
13
100
0
50
40
24
4
32
1.73
97434866--97435173
49
6.4
49
92
2
489
28
30
8
32
1.87
97439673--97439803
47
2.8
47
84
1
163
23
15
29
32
1.95
97440526--97440581
23
2.6
22
76
15
55
26
10
23
39
1.87
97443496--97443526
12
2.6
12
94
0
53
9
16
6
67
1.39
97443579--97443614
19
1.9
18
88
5
54
8
16
0
75
1.04
97446161--97446255
48
2.0
48
89
0
145
29
21
21
28
1.98
97450140--97450168
13
2.2
13
100
0
58
31
0
13
55
1.39
97455402--97455475
29
2.6
29
89
4
105
25
16
32
25
1.96
97462863--97462896
2
17.0
2
93
0
59
50
2
0
47
1.16
97463536--97463609
29
2.6
29
89
4
105
25
16
32
25
1.96
97466995--97467039
6
7.5
6
92
0
63
11
6
0
82
0.84
97466993--97467039
24
2.0
24
91
0
76
10
8
0
80
0.89
97466993--97467059
30
2.2
31
84
7
84
13
8
0
77
0.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
97468876--97468915
21
1.9
21
84
0
53
55
15
25
5
1.60
97469944--97469972
13
2.2
13
100
0
58
31
0
13
55
1.39
97472280--97472496
48
4.5
47
78
5
229
25
19
29
25
1.98
97478204--97478298
48
2.0
48
91
0
154
28
17
24
29
1.97
97478210--97478315
48
2.2
48
83
8
135
32
16
23
27
1.96
97483149--97483311
40
4.1
39
79
10
177
25
21
27
25
1.99
97488406--97488445
20
2.0
20
85
0
53
40
22
0
37
1.54
97488678--97488931
55
4.7
54
79
8
293
22
24
18
34
1.96
97488678--97488953
110
2.5
109
93
2
459
22
25
17
34
1.96
97496004--97496034
16
1.9
16
93
0
53
35
22
0
41
1.54
97496001--97496040
20
2.0
20
85
0
53
37
22
0
40
1.54
97496224--97496477
53
4.8
54
79
8
238
21
25
17
36
1.94
97502011--97502178
40
4.2
40
79
4
151
24
27
23
25
2.00
97503399--97503436
18
2.1
18
90
0
58
0
13
5
81
0.85
97510037--97510204
40
4.2
40
79
4
151
24
27
23
25
2.00
97511903--97512007
27
3.9
27
79
13
119
37
22
23
16
1.94
97521722--97521889
40
4.2
40
80
1
167
23
27
23
25
2.00
97521738--97521887
80
1.9
80
83
5
196
22
27
24
26
2.00
97527363--97527488
39
3.3
38
87
6
173
25
25
22
26
2.00
97531706--97531780
34
2.2
34
83
11
91
73
1
22
2
1.04
97531708--97531771
16
3.8
17
74
14
62
75
1
21
1
0.98
97536130--97536157
13
2.2
13
100
0
56
78
0
0
21
0.75
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
97538111--97538141
13
2.3
13
94
5
53
64
6
0
29
1.18
97544742--97544791
10
5.0
10
81
13
59
68
2
8
22
1.26
97545412--97545449
18
2.1
19
90
5
60
0
15
0
84
0.63
97545461--97545647
96
1.9
97
92
1
313
31
27
13
27
1.94
97546409--97546454
6
7.5
6
79
20
51
76
0
2
21
0.90
97550384--97550464
29
2.8
29
88
0
117
25
16
30
27
1.96
97552158--97552238
29
2.8
29
88
0
117
25
16
30
27
1.96
97559871--97559942
29
2.5
29
90
0
108
26
16
29
27
1.97
97566723--97566808
24
3.5
24
76
6
100
18
3
36
41
1.68
97566722--97566821
50
2.0
50
100
0
200
20
4
36
40
1.71
97567117--97567158
12
3.3
12
86
6
57
21
2
2
73
1.06
97567192--97567224
14
2.2
15
89
10
50
78
0
0
21
0.75
97567192--97567224
5
6.6
5
89
10
50
78
0
0
21
0.75
97571647--97571677
14
2.2
14
94
0
53
77
0
3
19
0.90
97575183--97575214
9
3.6
9
91
0
55
43
21
3
31
1.68
97576366--97576398
15
2.2
15
89
10
50
60
15
9
15
1.58
97580431--97580621
39
4.8
40
87
0
172
25
32
20
21
1.98
97580467--97580629
39
4.2
39
90
0
245
25
33
19
22
1.97
97585053--97585141
22
4.0
22
76
5
90
14
29
26
29
1.95
97586989--97587114
43
2.9
43
78
2
155
26
16
25
30
1.97
97593749--97593831
36
2.4
33
76
13
78
33
6
6
54
1.50
97600180--97600215
7
4.9
7
90
10
54
83
0
0
16
0.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
97601313--97601440
64
2.0
64
90
3
204
32
19
13
35
1.90
97603351--97603491
29
4.9
29
95
0
246
26
14
31
27
1.95
97603351--97603511
87
1.9
87
89
0
250
26
14
31
26
1.95
97603351--97603568
87
2.5
87
82
4
235
25
15
32
27
1.95
97604966--97605487
131
4.0
131
89
1
773
29
22
22
25
1.99
97604977--97605300
42
7.5
42
66
12
134
28
23
23
25
2.00
97605438--97605747
88
3.5
87
88
3
444
34
19
21
23
1.96
97605503--97605731
44
5.2
43
67
14
155
34
19
22
24
1.96
97606204--97606314
45
2.5
45
82
10
138
23
24
26
26
2.00
97606926--97606955
15
1.9
16
93
6
53
76
16
6
0
0.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770