Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          769   770   

This is table  439  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
135121755--135121802
25
1.9
25
86
0
69
16
20
25
37
1.93
135122408--135122439
2
16.0
2
100
0
64
50
0
0
50
1.00
135129285--135129649
181
2.0
181
100
0
730
30
16
25
27
1.97
135144883--135144916
18
1.9
18
88
5
52
29
8
2
58
1.43
135147191--135147362
64
2.7
63
83
4
195
25
20
25
28
1.99
135159790--135159814
2
12.5
2
100
0
50
48
0
0
52
1.00
135162525--135162555
13
2.3
14
94
5
55
41
0
6
51
1.27
135162757--135162845
11
7.2
12
69
22
53
34
3
2
59
1.26
135162757--135162808
21
2.4
22
87
9
72
32
0
1
65
1.04
135162757--135162831
25
3.2
23
80
10
73
33
4
1
61
1.23
135170383--135170410
13
2.2
13
100
0
56
28
7
14
50
1.69
135180309--135180352
21
2.1
21
83
8
54
25
9
2
63
1.35
135182585--135182628
22
2.0
22
100
0
88
18
22
4
54
1.61
135186747--135186808
32
1.9
32
96
0
115
29
9
22
38
1.86
135194985--135195063
5
14.2
6
77
19
66
48
16
2
32
1.60
135194981--135195026
20
2.2
21
92
7
85
47
19
0
32
1.50
135194981--135195027
11
4.5
11
87
12
73
46
19
0
34
1.50
135195060--135195087
14
2.0
14
100
0
56
71
0
14
14
1.15
135203336--135203429
18
5.4
18
92
3
131
36
25
9
28
1.87
135203336--135203416
9
9.0
9
70
0
54
34
27
9
28
1.89
135205795--135205883
21
4.1
21
84
5
90
53
10
23
12
1.68
135205795--135205863
21
3.3
21
87
2
95
55
8
24
11
1.64
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
135210030--135210058
14
2.1
14
100
0
58
51
6
13
27
1.66
135215744--135215776
16
2.1
16
94
0
57
39
9
12
39
1.74
135216242--135216275
15
2.3
15
89
0
50
35
2
23
38
1.70
135217276--135217315
19
2.1
19
90
0
62
30
15
2
52
1.55
135219003--135219031
14
2.1
14
100
0
58
34
0
13
51
1.42
135219156--135219195
21
1.9
21
89
0
62
30
12
0
57
1.36
135219779--135219803
11
2.3
11
100
0
50
64
8
0
28
1.22
135220467--135220506
14
2.7
15
88
7
55
17
5
0
77
0.94
135225161--135225206
23
2.0
23
100
0
92
34
13
13
39
1.83
135225749--135225776
14
2.0
14
100
0
56
35
7
21
35
1.81
135226935--135226990
29
2.0
29
96
3
105
35
17
12
33
1.88
135232203--135232245
19
2.3
19
95
0
77
16
25
23
34
1.95
135233826--135234219
50
7.9
50
76
5
373
30
24
17
26
1.97
135233887--135234218
101
3.3
100
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8
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