Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  744  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
235763834--235763934
39
2.5
40
85
1
132
30
22
24
21
1.99
235763834--235764016
40
4.6
40
82
3
181
27
22
26
23
1.99
235771660--235771830
40
4.3
39
77
10
159
28
21
26
23
1.99
235779501--235779671
40
4.3
39
77
10
159
28
21
26
23
1.99
235781155--235781258
42
2.5
42
81
9
115
25
18
25
30
1.98
235783644--235783794
53
2.8
53
89
4
214
29
27
16
25
1.97
235791125--235791275
53
2.8
53
89
4
214
29
27
16
25
1.97
235793561--235793621
30
2.0
30
87
0
86
39
8
22
29
1.83
235794038--235794077
16
2.5
16
100
0
80
17
20
27
35
1.95
235801755--235801811
23
2.4
24
94
2
98
31
22
21
24
1.98
235801869--235801911
20
2.2
20
100
0
86
32
18
11
37
1.87
235803333--235803500
40
4.2
40
82
1
185
24
26
22
26
2.00
235810484--235810650
40
4.2
40
82
2
185
24
26
22
26
2.00
235811966--235812001
8
4.5
8
92
0
63
11
22
22
44
1.84
235819039--235819101
31
2.1
31
90
3
101
23
23
15
36
1.94
235819305--235819386
23
3.4
24
91
6
130
29
21
19
29
1.98
235819432--235819484
20
2.7
20
93
0
88
32
20
11
35
1.88
235819521--235819567
24
1.9
25
91
4
78
23
14
25
36
1.93
235822338--235822509
93
1.8
93
96
0
317
27
30
22
20
1.98
235822330--235822505
46
3.8
46
81
10
232
28
29
21
20
1.98
235824885--235824973
30
3.0
30
80
8
101
57
15
16
10
1.65
235824885--235824964
15
5.4
15
80
7
92
58
13
17
10
1.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
235824896--235824973
15
5.2
15
78
9
79
56
15
16
11
1.67
235827923--235828094
93
1.8
93
96
0
317
27
30
22
20
1.98
235827915--235828090
46
3.8
46
81
10
232
28
29
21
20
1.98
235831570--235831711
40
3.5
40
83
1
124
27
23
26
22
1.99
235831609--235831737
40
3.2
39
84
6
152
24
22
27
25
2.00
235842265--235842394
40
3.2
40
83
4
165
23
29
25
22
1.99
235850305--235850434
40
3.2
40
83
4
165
23
29
25
22
1.99
235852634--235852660
13
2.1
13
100
0
54
48
14
22
14
1.81
235857317--235857525
40
5.2
40
89
3
264
26
25
22
25
2.00
235857323--235857525
79
2.5
79
86
5
284
27
25
21
25
1.99
235865784--235865845
28
2.2
28
94
0
106
33
27
8
30
1.86
235865953--235866042
28
3.2
27
85
7
119
20
24
23
32
1.98
235865953--235866067
55
2.1
56
83
8
146
19
24
21
34
1.96
235867131--235867164
10
3.3
10
84
8
50
29
8
8
52
1.62
235871247--235871278
15
2.1
15
100
0
64
28
12
25
34
1.92
235874049--235874233
40
4.6
39
85
4
217
28
22
25
23
2.00
235874048--235874254
80
2.6
80
83
4
247
26
22
26
25
2.00
235874047--235874254
40
5.2
39
83
5
211
26
22
25
25
2.00
235876104--235876142
19
2.1
19
100
0
78
23
10
30
35
1.88
235880572--235880644
29
2.5
29
100
0
146
31
15
28
24
1.95
235880631--235880703
29
2.5
29
84
0
92
28
17
26
27
1.98
235889442--235889608
40
4.2
40
82
2
176
24
26
22
25
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
235896637--235896804
40
4.2
40
83
3
187
24
26
22
26
2.00
235898105--235898223
48
2.5
47
82
9
125
22
26
21
29
1.99
235899990--235900093
39
2.6
40
90
1
165
25
27
20
25
1.99
235899990--235900145
79
2.0
78
80
9
174
26
27
21
25
1.99
235906235--235906404
40
4.2
40
84
3
225
25
24
28
21
1.99
235914331--235914500
40
4.2
40
84
3
225
25
24
28
21
1.99
235921552--235921599
25
1.9
25
86
0
69
33
25
16
25
1.96
235921647--235921702
11
5.5
11
71
16
57
35
12
19
32
1.89
235921642--235921702
20
3.0
20
95
0
113
34
11
19
34
1.88
235921752--235921894
24
6.0
24
91
4
209
28
22
22
26
1.99
235921752--235921894
47
3.0
47
90
5
207
28
22
22
26
1.99
235921752--235921895
71
2.0
72
89
4
220
29
22
22
26
1.99
235922085--235922147
31
2.1
31
90
3
101
36
15
23
23
1.94
235929653--235929700
25
1.9
25
86
0
69
33
25
16
25
1.96
235929748--235929801
11
5.4
11
70
20
55
37
11
20
31
1.88
235929743--235929801
19
3.0
20
95
5
111
35
10
20
33
1.86
235929852--235929970
24
5.0
24
88
5
170
28
21
22
26
1.99
235929852--235929970
47
2.5
48
89
5
170
28
21
22
26
1.99
235930162--235930224
31
2.1
31
90
3
101
36
15
23
23
1.94
235936655--235936762
27
3.9
27
77
15
96
32
8
17
41
1.79
235936746--235936901
54
2.9
54
83
3
181
28
10
21
38
1.88
235936718--235936901
81
2.3
81
81
5
203
28
10
21
39
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
235936718--235936908
27
7.1
27
79
4
163
28
10
23
38
1.87
235936900--235937070
81
2.1
81
86
5
231
39
6
25
28
1.80
235936900--235937070
27
6.4
27
86
3
195
39
6
25
28
1.80
235937025--235937082
27
2.2
27
84
3
73
32
12
24
31
1.91
235939245--235939472
46
5.0
46
98
0
429
33
7
27
31
1.84
235939476--235939586
47
2.4
47
89
0
168
36
9
27
27
1.87
235942146--235942408
40
6.6
40
94
0
429
25
21
28
25
1.99
235943072--235943172
40
2.5
40
82
6
107
26
22
25
24
2.00
235943110--235943206
40
2.5
40
78
8
99
27
24
24
22
2.00
235945873--235946054
46
4.0
46
97
0
337
34
7
27
31
1.84
235946058--235946168
47
2.4
47
89
0
168
36
9
27
27
1.87
235948726--235948988
40
6.6
40
94
0
429
25
21
28
25
1.99
235949652--235949787
40
3.4
40
75
8
116
26
23
26
23
2.00
235952455--235952636
46
4.0
46
97
0
337
34
7
27
31
1.84
235952640--235952750
47
2.4
47
89
0
168
36
9
27
27
1.87
235956659--235956696
19
2.0
20
85
15
53
39
23
0
36
1.55
235975251--235975492
40
6.2
38
78
10
181
23
22
27
26
2.00
235975290--235975502
117
1.8
116
85
7
297
23
23
27
25
2.00
235983323--235983506
40
4.6
39
75
6
138
26
23
27
22
2.00
235983363--235983551
80
2.4
81
77
4
186
23
24
29
22
1.99
235995474--235995543
27
2.5
28
88
2
106
31
25
14
28
1.95
236003379--236003448
27
2.5
28
88
2
106
31
25
14
28
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
236011198--236011290
29
3.2
28
80
3
87
23
34
16
25
1.95
236011226--236011355
29
4.6
29
82
6
131
24
30
14
30
1.95
236019898--236019967
27
2.6
27
95
2
122
30
27
14
28
1.95
236025067--236025157
42
2.2
42
87
0
128
27
37
19
15
1.92
236029996--236030125
47
2.8
47
80
2
145
23
16
28
32
1.96
236033460--236033626
40
4.2
40
82
2
185
25
27
21
25
1.99
236033460--236033626
80
2.1
79
83
7
205
25
27
21
25
1.99
236034451--236034496
17
2.5
19
74
22
53
34
23
17
23
1.96
236041468--236041634
40
4.2
40
82
2
185
25
27
21
25
1.99
236041468--236041634
80
2.1
79
83
7
205
25
27
21
25
1.99
236042459--236042504
17
2.5
19
74
22
53
34
23
17
23
1.96
236047296--236047452
29
5.4
29
86
5
194
27
16
29
26
1.97
236055399--236055505
39
2.7
39
86
2
151
26
20
28
24
1.99
236055405--236055534
40
3.3
40
89
3
183
23
22
29
24
1.99
236063441--236063577
38
3.6
39
89
6
208
26
21
28
24
1.99
236063441--236063606
38
4.3
39
88
6
205
25
21
28
24
1.99
236066157--236066375
40
5.6
39
87
2
122
28
22
26
22
1.99
236066197--236066401
40
5.2
40
91
3
299
26
23
28
21
1.99
236066197--236066386
79
2.4
81
91
4
291
27
24
27
20
1.99
236071733--236071839
54
2.0
54
100
0
214
33
22
21
22
1.97
236075533--236075581
17
2.8
18
74
22
50
24
18
22
34
1.96
236076403--236076569
40
4.2
40
79
6
169
25
21
27
25
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
236078016--236078041
2
13.0
2
100
0
52
50
0
0
50
1.00
236078748--236078925
40
4.5
39
84
5
205
26
24
26
22
2.00
236078782--236078951
80
2.1
80
80
3
182
28
24
25
21
1.99
236086236--236086414
40
4.4
40
81
4
191
27
23
26
22
2.00
236086236--236086386
81
1.9
81
84
5
207
26
22
27
23
2.00
236090279--236090484
40
5.2
40
82
4
211
25
26
22
25
2.00
236090279--236090482
79
2.6
81
82
4
229
25
26
22
25
2.00
236097945--236098045
28
3.5
28
86
6
114
29
13
26
29
1.94
236105902--236106002
28
3.5
28
86
6
114
29
13
26
29
1.94
236109488--236109577
27
3.3
27
73
16
80
56
3
5
34
1.39

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770