Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  751  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
238144252--238144435
40
4.6
39
75
6
138
26
23
27
22
2.00
238144292--238144480
80
2.4
81
77
4
186
23
24
29
22
1.99
238147450--238147599
40
3.8
39
83
5
151
25
22
26
25
2.00
238149739--238149831
43
2.2
43
88
0
132
39
23
10
25
1.87
238157829--238157929
28
3.5
28
86
6
114
29
26
13
29
1.94
238168474--238168681
40
5.2
40
84
2
249
25
21
26
26
1.99
238176487--238176692
39
5.2
40
83
5
249
25
21
27
26
1.99
238176487--238176693
79
2.6
79
80
6
240
25
21
27
26
1.99
238185651--238185727
37
2.0
39
95
5
140
40
11
20
27
1.87
238192251--238192308
25
2.3
25
85
11
75
37
3
0
58
1.15
238195891--238195924
17
1.9
18
94
5
61
58
8
5
26
1.51
238196643--238196702
10
6.0
10
86
11
79
70
3
8
18
1.27
238213758--238213870
43
2.6
43
83
2
138
30
15
22
31
1.95
238217440--238217657
40
5.4
40
85
3
251
26
24
26
22
2.00
238217439--238217629
79
2.4
80
84
1
249
25
23
27
23
2.00
238217439--238217671
79
2.9
78
80
4
241
26
24
26
22
2.00
238217600--238217683
40
2.1
40
82
4
98
26
27
26
20
1.99
238217440--238217672
119
1.9
119
81
3
279
26
24
26
22
2.00
238225809--238225878
27
2.6
27
93
2
113
30
28
14
27
1.95
238234323--238234631
80
3.9
80
85
5
410
28
22
9
39
1.85
238234323--238234631
27
11.6
27
86
3
403
28
22
9
39
1.85
238234323--238234631
53
5.8
54
85
3
403
28
22
9
39
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
238235864--238235911
25
2.0
24
83
4
60
31
25
18
25
1.98
238235950--238236006
9
5.9
9
73
15
51
35
8
21
35
1.84
238235948--238236018
20
3.5
20
94
0
124
35
11
21
32
1.89
238235959--238236013
11
5.4
11
70
16
55
36
12
20
30
1.90
238236063--238236228
24
7.0
24
86
6
223
28
22
21
26
1.99
238236065--238236229
47
3.5
46
87
6
217
29
22
21
26
1.99
238239331--238239642
27
11.6
27
84
5
382
27
23
9
39
1.86
238239329--238239642
80
3.9
81
85
5
406
27
23
9
39
1.86
238239334--238239642
53
5.7
54
83
8
346
27
22
9
39
1.85
238240873--238240919
24
2.0
24
86
0
67
31
25
17
25
1.97
238240956--238241006
20
2.5
20
93
0
84
35
11
21
31
1.90
238241051--238241216
24
7.0
24
86
6
223
28
22
21
26
1.99
238241053--238241217
47
3.5
46
87
6
217
29
22
21
26
1.99
238244322--238244633
27
11.6
27
86
3
414
27
22
9
40
1.85
238245821--238245867
24
2.0
24
86
0
67
31
25
17
25
1.97
238245906--238245962
9
5.9
9
73
15
51
35
8
21
35
1.84
238245904--238245974
20
3.5
20
94
0
124
35
11
21
32
1.89
238245915--238245969
11
5.4
11
70
16
55
36
12
20
30
1.90
238246019--238246184
23
7.0
24
86
6
223
28
22
21
26
1.99
238246019--238246185
47
3.5
47
86
7
223
29
22
21
26
1.99
238246019--238246184
70
2.3
71
90
4
255
28
22
21
26
1.99
238246852--238246945
37
2.5
37
89
5
145
41
17
8
32
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
238251691--238251733
23
1.9
23
85
4
61
69
13
0
16
1.19
238251853--238251913
19
3.3
19
90
6
99
36
8
18
37
1.80
238255704--238255852
80
1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
238255745--238255852
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
238263824--238263972
80
1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
238263865--238263972
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
238277145--238277177
12
2.6
13
90
4
50
81
6
6
6
0.97
238288098--238288398
47
6.3
47
94
0
467
31
8
31
29
1.87
238290514--238290790
40
6.9
40
93
0
466
26
20
27
25
1.99
238292148--238292314
40
4.2
40
82
2
185
25
27
21
25
1.99
238292148--238292314
80
2.1
79
83
7
205
25
27
21
25
1.99
238293140--238293185
17
2.5
19
74
22
53
34
23
17
23
1.96
238298154--238298453
47
6.3
48
91
3
439
31
8
31
29
1.86
238298154--238298453
96
3.2
95
90
4
446
31
8
31
29
1.86
238300360--238300468
25
4.1
26
81
12
107
34
22
25
17
1.95
238300360--238300439
26
3.0
26
88
5
106
35
22
27
15
1.94
238303473--238303537
28
2.3
28
94
0
112
33
27
7
30
1.85
238303604--238303695
28
3.2
28
90
4
141
20
23
22
32
1.98
238303604--238303720
56
2.1
55
82
9
139
19
23
21
35
1.96
238304158--238304196
19
2.1
19
85
0
51
15
5
7
71
1.26
238304778--238304810
11
3.1
11
86
4
50
30
9
9
51
1.64
238310166--238310198
12
2.6
13
85
9
50
9
45
0
45
1.35
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
238311259--238311322
27
2.3
28
91
2
103
32
28
7
31
1.85
238311428--238311517
27
3.2
28
87
7
130
20
24
23
32
1.98
238311428--238311542
55
2.1
56
83
8
146
19
24
21
34
1.96
238311981--238312019
19
2.1
19
85
0
51
15
5
7
71
1.26
238315674--238315823
67
2.2
67
81
8
171
32
17
28
21
1.96
238315698--238315881
67
2.8
64
77
8
194
29
17
29
22
1.97
238316958--238316984
2
13.5
2
100
0
54
48
0
0
51
1.00
238320312--238320429
41
3.1
41
60
28
98
32
17
28
21
1.96
238320280--238320443
71
2.3
71
100
0
328
35
17
28
18
1.94
238325118--238325301
40
4.6
39
75
6
138
26
23
27
22
2.00
238325158--238325346
80
2.4
81
77
4
186
23
24
29
22
1.99
238333184--238333367
40
4.6
39
75
6
138
26
23
27
22
2.00
238333224--238333412
80
2.4
81
77
4
186
23
24
29
22
1.99
238337489--238337589
28
3.5
28
86
6
114
29
26
13
29
1.94
238345448--238345548
28
3.5
28
86
6
114
29
26
13
29
1.94
238348495--238348587
34
2.8
34
77
11
93
30
26
21
21
1.98
238351391--238351554
40
4.1
40
78
6
170
25
19
28
26
1.99
238354859--238355066
79
2.6
80
78
6
190
24
30
23
22
1.99
238354959--238355066
40
2.7
40
86
0
135
21
30
25
23
1.99
238363053--238363163
40
2.8
40
88
0
159
21
28
23
26
1.99
238364269--238364371
29
3.6
29
81
2
118
21
16
33
29
1.95
238371704--238371732
14
2.1
14
100
0
58
13
13
13
58
1.63
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
238372849--238372934
38
2.2
38
78
19
97
30
8
2
59
1.39
238372928--238372965
4
9.2
4
83
16
51
23
2
0
73
0.95
238372927--238372966
21
1.9
21
100
0
80
25
2
0
72
0.97
238373799--238373841
20
2.2
19
87
8
59
20
2
2
74
1.04
238373799--238373844
21
2.4
19
82
13
58
23
2
2
71
1.08
238375496--238375663
40
4.2
40
82
2
196
25
27
22
25
2.00
238383796--238383963
40
4.2
40
82
2
196
25
27
22
25
2.00
238388678--238388822
40
3.6
39
82
4
112
26
23
27
22
1.99
238388717--238388845
40
3.2
39
84
6
152
24
22
27
25
2.00
238392694--238392757
31
2.1
31
96
0
119
23
21
15
39
1.92
238392949--238393090
24
6.0
24
90
5
200
26
22
22
28
1.99
238392949--238393089
46
3.0
48
88
7
198
26
22
22
27
1.99
238392948--238393089
70
2.0
71
89
4
216
26
22
22
28
1.99
238393140--238393193
11
5.4
11
70
20
55
31
20
11
37
1.88
238393140--238393198
19
3.0
20
95
5
111
33
20
10
35
1.86
238393241--238393288
25
1.9
25
86
0
69
25
16
25
33
1.96
238399220--238399283
31
2.1
31
96
0
119
23
21
15
39
1.92
238399474--238399590
23
5.0
24
87
9
161
26
23
21
29
1.99
238399635--238399717
20
4.2
20
92
3
125
32
21
12
33
1.90
238401224--238401357
40
3.3
40
85
0
160
23
27
22
26
1.99
238404020--238404044
12
2.1
12
100
0
50
24
36
16
24
1.94
238405411--238405480
27
2.5
28
88
2
106
31
25
14
28
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
238413342--238413411
27
2.5
28
88
2
106
31
25
14
28
1.95
238418873--238418926
21
2.6
21
87
0
72
29
35
3
31
1.75
238423474--238423658
40
4.7
40
97
0
354
25
23
29
21
1.99
238423474--238423722
80
3.1
80
90
1
358
26
23
28
21
1.99
238434665--238434813
80
1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
238434706--238434813
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
238440470--238440516
25
1.9
24
83
12
60
36
2
4
57
1.30
238445427--238445594
40
4.2
40
80
3
196
25
22
27
25
2.00
238460433--238460481
17
2.8
18
74
22
50
24
18
22
34
1.96
238461303--238461469
40
4.2
40
79
6
169
25
21
27
25
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770