Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  351  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
107707519--107707627
56
2.0
55
85
1
146
36
18
24
20
1.94
107708858--107708914
18
3.2
18
80
7
71
64
0
31
3
1.10
107713488--107713768
49
5.6
49
75
7
208
25
15
27
31
1.96
107713491--107713775
150
1.9
151
85
4
396
25
15
27
31
1.95
107720086--107720119
17
2.0
17
88
0
50
20
11
5
61
1.50
107724317--107724524
40
5.2
40
82
1
184
21
26
24
27
1.99
107724343--107724524
80
2.3
80
83
0
220
21
26
23
28
1.99
107732135--107732342
40
5.2
40
82
1
184
21
26
24
27
1.99
107732161--107732342
80
2.3
80
83
0
220
21
26
23
28
1.99
107742094--107742271
40
4.5
40
89
3
245
25
27
23
24
2.00
107744829--107744967
40
3.5
40
85
4
149
24
29
22
23
1.99
107744803--107745020
79
2.7
81
79
8
225
25
27
22
24
1.99
107751800--107751935
26
5.2
26
93
0
227
33
5
24
36
1.78
107753717--107754002
136
2.1
137
97
0
538
25
19
23
31
1.98
107755733--107755764
15
2.1
16
94
5
57
68
3
0
28
1.04
107758408--107758493
18
4.9
18
78
8
88
31
22
15
31
1.94
107758406--107758493
35
2.6
34
87
1
122
30
21
15
31
1.95
107775052--107775323
40
6.8
40
93
0
440
22
23
27
25
2.00
107788706--107788744
20
2.0
20
84
0
51
53
0
12
33
1.39
107789850--107789886
17
2.2
17
100
0
74
35
10
16
37
1.83
107793784--107793818
7
4.7
7
92
7
52
80
0
20
0
0.72
107793784--107793818
15
2.4
14
90
9
52
80
0
20
0
0.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
107796090--107796133
2
22.0
2
100
0
88
50
0
0
50
1.00
107798410--107798450
19
2.2
19
90
0
64
34
0
9
56
1.32
107798621--107798654
14
2.4
14
90
0
50
38
8
5
47
1.59
107816980--107817251
40
6.8
40
94
0
449
22
23
27
26
1.99
107827729--107827767
20
2.0
20
84
0
51
53
0
12
33
1.39
107828873--107828909
17
2.2
17
100
0
74
35
10
16
37
1.83
107832806--107832840
7
4.7
7
92
7
52
80
0
20
0
0.72
107832806--107832840
15
2.4
14
90
9
52
80
0
20
0
0.72
107835112--107835155
2
22.0
2
100
0
88
50
0
0
50
1.00
107837415--107837455
19
2.2
19
90
0
64
34
0
9
56
1.32
107837625--107837658
14
2.4
14
90
0
50
38
8
5
47
1.59
107840646--107840746
28
3.5
28
86
6
114
29
26
13
29
1.94
107848423--107848523
28
3.5
28
83
6
105
29
27
12
29
1.93
107852423--107852657
39
6.0
39
84
3
251
30
30
21
18
1.97
107852456--107852657
78
2.6
78
88
1
289
30
29
21
18
1.97
107852992--107853316
109
3.0
110
97
0
616
24
22
8
44
1.80
107855270--107855556
27
10.6
27
86
0
349
39
20
8
31
1.82
107855270--107855664
81
4.9
79
78
4
288
39
21
8
31
1.83
107855270--107855665
27
14.7
27
78
4
255
39
20
8
31
1.83
107855649--107855898
27
9.3
27
86
0
295
35
20
19
24
1.96
107856324--107856388
22
3.0
21
75
8
58
20
23
23
33
1.97
107856547--107856620
27
2.8
27
83
6
80
18
22
20
37
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
107856757--107856848
6
14.8
6
76
15
89
18
16
15
50
1.79
107856757--107856837
31
2.6
31
96
2
144
18
16
16
49
1.80
107858804--107859090
27
10.6
27
86
0
367
39
20
8
31
1.82
107858795--107859150
81
4.4
80
80
4
322
38
20
8
32
1.83
107859074--107859133
26
2.3
27
85
2
86
40
21
8
30
1.83
107858839--107859200
27
13.4
27
80
6
218
38
21
8
32
1.83
107859182--107859321
27
5.2
27
92
0
217
35
20
20
23
1.96
107859180--107859350
81
2.1
80
84
1
234
35
19
20
23
1.96
107859182--107859349
27
6.3
27
87
0
212
34
20
20
24
1.96
107859999--107860072
27
2.8
27
83
6
80
17
24
20
37
1.93
107860209--107860300
6
14.8
6
76
15
89
17
16
16
50
1.79
107860209--107860289
31
2.6
31
94
2
135
17
16
17
49
1.80
107866808--107866960
39
3.9
39
92
0
252
23
20
32
23
1.98
107866809--107866990
39
4.6
39
89
0
247
23
21
31
23
1.98
107874897--107875049
39
3.9
39
92
0
252
23
20
32
23
1.98
107874898--107875079
39
4.6
39
89
0
247
23
21
31
23
1.98
107878056--107878585
48
11.0
48
93
0
862
31
25
6
36
1.81
107881285--107881502
39
5.5
39
91
1
330
29
28
22
19
1.98
107881845--107882064
110
2.0
110
99
0
431
24
21
7
46
1.77
107886111--107886180
27
2.5
28
95
2
124
28
14
27
30
1.95
107886111--107886192
27
3.0
27
85
8
78
29
15
24
30
1.96
107893918--107893987
27
2.5
28
95
2
124
28
14
27
30
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
107893918--107893999
27
3.0
27
85
8
78
29
15
24
30
1.96
107897658--107897702
15
3.0
15
76
0
54
44
8
17
28
1.79
107898055--107898128
28
2.6
27
79
12
78
35
16
25
22
1.95
107900970--107901064
29
3.3
29
92
2
129
26
31
14
27
1.95
107902674--107902704
16
1.9
16
93
0
53
54
12
19
12
1.70
107902925--107903010
29
2.9
30
81
10
115
29
12
29
29
1.93
107904198--107904347
28
5.3
28
68
14
85
31
16
22
29
1.96
107904248--107904466
29
7.7
29
71
12
121
33
15
25
26
1.95
107904185--107904443
57
4.6
57
81
7
233
34
16
22
26
1.95
107904211--107904425
114
1.9
114
87
0
313
33
15
23
26
1.95
107906060--107906112
25
2.1
25
83
13
65
41
0
11
47
1.39
107906104--107906164
3
20.3
3
100
0
122
67
0
0
32
0.91
107908289--107908322
18
1.9
18
88
5
52
23
2
0
73
0.97
107909728--107909818
34
2.7
34
80
11
98
30
23
18
27
1.98
107917039--107917206
40
4.2
40
80
12
175
23
22
27
26
1.99
107917039--107917206
80
2.1
79
86
4
230
23
22
27
26
1.99
107925034--107925176
40
3.6
39
81
13
150
25
21
27
25
1.99
107931785--107931812
2
14.0
2
100
0
56
50
0
0
50
1.00
107932011--107932116
42
2.5
41
80
7
115
27
27
18
26
1.98
107937068--107937139
37
1.9
37
94
0
126
22
34
20
22
1.97
107937273--107937378
48
2.2
48
93
0
176
33
27
5
33
1.80
107940783--107940862
28
2.8
28
77
7
90
26
30
20
23
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
107941041--107941254
43
5.0
43
98
0
401
30
32
24
12
1.92
107942959--107943030
37
1.9
37
94
0
126
22
34
20
22
1.97
107943164--107943269
48
2.2
48
93
0
176
33
27
5
33
1.80
107946073--107946153
29
2.7
31
81
9
96
27
22
18
32
1.97
107946375--107946445
26
2.8
26
93
2
117
23
21
25
29
1.99
107952660--107952737
29
2.6
30
82
11
90
26
24
19
29
1.98
107952956--107953026
25
2.8
26
89
2
99
23
21
23
30
1.99
107959772--107959926
42
3.7
42
86
3
204
27
16
25
29
1.97
107962300--107962394
42
2.2
42
81
9
104
27
22
20
30
1.98
107966842--107966942
28
3.5
28
86
6
114
29
13
26
29
1.94
107974775--107974875
28
3.5
28
86
6
114
29
13
26
29
1.94
107984460--107984500
21
1.9
22
95
5
75
60
9
9
19
1.55
107984675--107984858
40
4.6
40
77
14
173
26
16
26
31
1.96
107991706--107991754
25
1.9
26
87
4
73
28
20
20
30
1.98
107991737--107991797
22
2.7
23
85
7
63
32
19
22
24
1.97
107991875--107992011
67
2.0
67
95
0
247
32
28
19
18
1.96
107996076--107996123
24
2.0
24
95
0
87
41
6
20
31
1.77
108000296--108000500
53
3.8
54
76
4
171
21
23
18
35
1.95
108000339--108000491
55
2.8
53
75
7
148
21
25
18
34
1.96
108000466--108000736
47
5.8
46
77
7
210
23
25
17
33
1.96
108000741--108000825
44
1.9
44
83
9
111
27
23
14
35
1.93
108001362--108001419
30
1.9
31
85
3
82
27
24
12
36
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
108003583--108003800
40
5.5
40
87
3
264
23
23
27
24
2.00
108006781--108006952
93
1.8
93
94
0
308
28
29
20
20
1.98
108006774--108006949
46
3.8
46
78
12
207
29
29
20
20
1.98
108008948--108008988
21
1.9
22
95
5
75
24
29
14
31
1.95
108010511--108010681
93
1.8
93
96
0
315
28
29
21
21
1.98
108010503--108010678
46
3.8
46
80
12
225
28
28
21
21
1.98
108013049--108013137
30
3.0
30
80
8
101
57
15
16
10
1.65
108013049--108013128
15
5.4
15
80
7
92
58
13
17
10
1.62
108013060--108013137
15
5.2
15
78
9
79
56
15
16
11
1.67
108015630--108015674
21
2.1
21
84
8
56
22
0
28
48
1.50

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770