Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          769   770   

This is table  601  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
188069446--188069723
89
3.0
89
93
4
439
28
8
33
29
1.87
188069392--188069744
138
2.5
143
93
4
581
29
9
32
29
1.88
188069468--188069754
89
3.1
90
84
11
377
29
8
32
29
1.86
188069846--188069930
37
2.3
37
95
0
152
24
20
34
21
1.97
188071698--188071852
28
5.5
28
74
6
150
27
33
21
17
1.96
188071668--188071881
57
3.7
57
91
3
349
28
35
18
17
1.94
188071668--188071883
29
7.5
29
71
6
161
27
36
18
17
1.94
188073849--188073955
28
3.8
28
88
0
142
29
24
9
36
1.87
188080509--188080606
48
2.0
48
92
3
162
29
5
28
36
1.79
188085243--188085314
34
2.1
34
94
0
126
29
6
20
43
1.78
188086267--188086306
20
2.0
20
100
0
80
30
5
20
45
1.72
188092896--188093071
46
3.8
46
76
12
180
20
19
28
30
1.97
188092892--188093063
93
1.8
93
92
0
290
20
20
29
29
1.98
188095987--188096055
14
4.7
15
75
13
72
11
15
11
60
1.58
188095978--188096055
29
2.7
29
82
8
86
11
15
14
58
1.62
188100778--188100949
46
3.8
45
80
11
215
21
21
27
29
1.99
188100775--188100944
92
1.8
92
96
0
313
21
21
28
28
1.99
188105698--188105794
30
3.2
30
76
2
106
28
25
15
29
1.96
188109937--188110107
46
3.7
45
75
15
179
22
20
27
29
1.99
188109934--188110102
92
1.8
92
94
0
302
22
20
28
28
1.99
188111976--188112017
11
3.7
11
78
15
50
2
19
0
78
0.86
188111976--188112061
14
6.5
13
72
23
56
3
20
1
74
1.03
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
188111976--188112071
27
3.4
27
71
21
65
4
20
1
73
1.05
188113572--188113743
93
1.8
93
96
0
317
27
29
21
20
1.98
188113565--188113740
46
3.8
46
79
12
216
28
29
21
20
1.98
188121148--188121319
93
1.8
93
96
0
317
27
29
21
20
1.98
188121141--188121316
46
3.8
46
79
12
216
28
29
21
20
1.98
188125026--188125058
12
2.8
12
86
4
50
51
9
3
36
1.49
188127690--188127729
20
2.1
19
85
4
53
27
12
32
27
1.93
188128059--188128135
39
2.0
39
92
0
127
44
12
11
31
1.79
188131033--188131230
71
2.8
70
92
3
294
33
17
28
20
1.95
188131099--188131216
41
3.1
41
60
28
98
32
17
28
21
1.96
188131067--188131230
71
2.3
71
100
0
328
35
17
28
18
1.94
188137626--188137724
28
3.5
29
83
6
114
30
27
15
27
1.96
188145640--188145738
28
3.5
29
83
6
114
30
27
15
27
1.96
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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G
T
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26
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
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T
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(0-2)
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25
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1.99
188348270--188348475
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2.6
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83
3
238
25
26
21
26
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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