Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: Chr14 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  48  of  770  ( 92376 repeats found )
Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13746511--13746647
44
3.1
43
76
12
152
29
26
16
27
1.97
13746425--13746669
88
2.8
88
86
1
321
28
23
20
27
1.98
13746520--13746668
44
3.4
43
73
10
140
30
22
18
28
1.97
13746750--13746909
45
3.6
45
74
10
157
28
20
20
31
1.97
13751064--13751097
12
2.8
12
90
4
50
0
23
5
70
1.09
13753449--13753624
46
3.8
46
79
12
207
21
21
28
28
1.98
13753446--13753617
93
1.8
93
94
0
308
21
21
29
27
1.99
13760970--13761145
46
3.8
46
79
12
216
20
21
29
28
1.98
13760967--13761138
93
1.8
93
96
0
317
20
21
29
27
1.98
13767093--13767276
40
4.6
40
78
10
180
26
28
22
23
1.99
13767095--13767277
79
2.3
81
82
7
214
26
27
22
23
1.99
13770594--13770696
29
3.6
29
90
0
152
24
33
15
27
1.95
13770565--13770696
58
2.3
58
79
0
147
24
34
15
25
1.95
13775089--13775134
21
2.2
21
88
0
65
13
23
39
23
1.90
13780518--13780669
66
2.3
66
88
1
214
30
11
20
38
1.87
13784975--13785025
22
2.2
24
79
6
61
68
3
3
23
1.23
13789843--13789899
29
2.0
28
83
10
71
26
26
26
21
1.99
13792762--13792896
66
2.0
66
98
0
261
46
15
8
28
1.76
13801603--13801656
25
2.2
25
96
0
99
29
12
25
31
1.93
13804076--13804132
22
2.7
21
73
10
62
21
3
12
63
1.43
13804335--13804372
16
2.4
16
86
4
51
34
0
18
47
1.49
13805378--13805422
17
2.6
16
86
13
63
35
8
6
48
1.61
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13806401--13806436
18
2.0
18
88
0
54
36
25
16
22
1.94
13806600--13806708
41
2.7
40
85
2
137
24
23
23
27
2.00
13807399--13807441
15
2.9
14
82
3
50
20
0
37
41
1.53
13810417--13810669
134
1.9
133
98
0
488
19
9
18
51
1.74
13812659--13812698
21
1.9
21
94
0
71
30
10
12
47
1.74
13813728--13814638
371
2.5
371
99
0
1781
36
14
10
38
1.81
13814726--13814793
24
2.8
24
82
8
93
27
17
7
47
1.74
13814970--13815025
15
3.8
15
80
20
73
46
0
0
53
1.00
13815130--13815328
9
21.6
9
75
10
107
47
12
1
38
1.51
13815099--13815352
114
2.3
105
83
7
276
47
12
1
38
1.51
13815198--13815402
105
2.0
102
80
6
234
47
13
0
38
1.49
13820967--13821017
21
2.4
21
80
0
66
29
19
49
1
1.60
13826289--13826376
28
3.1
28
95
0
158
28
21
10
39
1.86
13831864--13831896
15
2.3
15
89
5
50
54
18
3
24
1.57
13832238--13832282
20
2.2
20
96
0
81
33
17
0
48
1.48
13839401--13839517
48
2.4
49
84
4
139
23
25
20
29
1.99
13839540--13839665
46
2.7
46
81
3
128
26
26
17
29
1.97
13842168--13842865
64
10.7
63
69
15
353
35
13
15
35
1.87
13842073--13842865
131
6.1
131
85
1
937
35
13
14
35
1.87
13846605--13846630
2
13.0
2
100
0
52
50
0
0
50
1.00
13847620--13847664
18
2.4
19
78
14
58
57
2
8
31
1.41
13849973--13850163
96
2.0
96
94
0
337
27
18
18
36
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13850624--13850733
26
4.2
26
92
0
175
33
5
23
37
1.78
13852207--13852258
25
2.0
26
82
10
63
36
23
15
25
1.93
13852506--13852789
135
2.1
136
95
2
509
24
17
25
32
1.97
13856550--13856656
25
4.2
25
93
2
178
33
5
23
37
1.78
13856550--13856656
51
2.1
50
92
1
178
33
5
23
37
1.78
13858133--13858184
25
2.0
26
82
10
63
36
23
15
25
1.93
13858432--13858715
135
2.1
136
95
2
509
24
18
25
32
1.97
13871116--13871148
12
2.8
12
90
4
50
78
0
21
0
0.75
13871594--13871622
14
2.1
14
100
0
58
55
0
0
44
0.99
13872147--13872203
30
1.9
29
86
10
80
68
5
3
22
1.25
13872569--13872643
30
2.8
25
78
18
87
69
4
4
22
1.22
13871626--13872935
145
9.1
146
88
5
1906
58
7
6
27
1.49
13872868--13872903
12
2.8
13
91
4
56
69
2
2
25
1.15
13876984--13877047
32
2.0
32
100
0
128
37
12
15
34
1.85
13885972--13886100
46
2.8
46
93
0
213
20
21
28
29
1.98
13891422--13891562
71
2.0
71
88
0
210
20
21
27
30
1.98
13893273--13893330
27
2.1
27
90
0
89
12
39
25
22
1.89
13897377--13897414
18
2.1
18
90
0
58
68
0
5
26
1.11
13899419--13899490
36
2.0
36
97
0
135
27
20
19
31
1.97
13902592--13902627
18
2.0
18
100
0
72
27
11
27
33
1.91
13903443--13903481
19
2.1
18
90
4
60
28
15
0
56
1.40
13906709--13906759
19
2.7
19
74
14
52
49
1
0
49
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13907173--13907211
21
1.9
20
94
5
69
66
2
5
25
1.25
13908238--13908279
17
2.6
16
81
7
50
50
2
4
42
1.36
13908529--13908792
79
3.3
79
89
0
402
33
15
12
38
1.86
13908413--13908792
158
2.3
164
83
8
436
32
15
13
38
1.86
13908806--13909172
86
4.3
86
81
3
366
33
7
13
45
1.72
13912734--13912785
23
2.4
21
83
6
59
57
1
7
32
1.38
13913612--13913721
26
4.2
26
95
0
175
34
5
22
37
1.78
13915500--13915775
137
2.0
137
98
0
534
25
19
24
31
1.98
13917874--13917913
14
2.9
14
88
11
64
27
12
0
60
1.33
13917874--13917911
13
2.7
14
92
8
60
26
13
0
60
1.33
13918104--13918153
25
2.0
26
84
11
68
40
12
2
46
1.52
13920452--13920505
12
4.6
11
80
13
56
24
3
3
68
1.22
13924776--13925698
44
20.2
44
70
11
405
34
17
18
29
1.94
13924807--13925290
89
5.4
89
73
6
355
34
17
18
29
1.94
13924776--13925289
133
3.8
132
76
8
450
33
17
19
29
1.95
13925448--13925571
51
2.4
51
90
0
185
35
15
16
33
1.90
13927323--13927363
12
3.5
11
84
15
55
24
2
4
68
1.22
13929822--13929867
3
15.7
3
95
4
85
34
0
0
65
0.93
13930643--13930691
3
16.3
3
100
0
98
32
0
0
67
0.91
13930757--13930790
15
2.1
15
89
10
50
64
0
35
0
0.94
13930756--13930794
17
2.3
18
82
13
55
66
0
33
0
0.92
13931599--13931642
18
2.4
18
88
0
61
31
11
15
40
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13931632--13931675
17
2.5
17
81
3
52
29
11
15
43
1.82
13934005--13934062
23
2.6
23
79
17
68
41
1
0
56
1.09
13933997--13934049
11
4.9
11
82
13
65
41
3
0
54
1.18
13935719--13935745
14
1.9
14
100
0
54
0
14
37
48
1.45
13936692--13936726
14
2.5
14
95
0
61
8
31
45
14
1.75
13936862--13936928
30
2.2
30
75
0
71
49
4
19
26
1.67
13936996--13937467
156
3.1
154
85
4
607
34
14
20
31
1.92
13940475--13940641
59
2.8
59
91
1
264
53
7
5
32
1.52
13941012--13941052
18
2.3
18
95
0
73
48
7
17
26
1.73
13952232--13952278
17
2.8
17
80
6
51
80
10
6
2
0.96
13959800--13959844
17
2.6
17
85
3
54
44
0
2
53
1.13
13962770--13962921
43
3.5
43
76
7
123
26
25
18
30
1.98
13966033--13966067
6
5.8
6
100
0
70
82
0
0
17
0.66
13969615--13969653
13
3.0
13
92
0
60
33
0
0
66
0.92
13970387--13970419
2
16.5
2
100
0
66
51
0
0
48
1.00
13971023--13971064
20
2.1
20
90
0
66
54
0
4
40
1.21
13971032--13971073
10
4.2
10
82
11
50
50
2
2
45
1.27
13971800--13971843
18
2.4
19
88
7
72
29
2
0
68
1.02
13972263--13972323
29
2.1
29
100
0
122
50
3
9
36
1.52
13976962--13977220
46
5.5
48
75
11
193
27
19
29
23
1.98
13978737--13978762
13
2.0
13
100
0
52
38
15
23
23
1.92
13983983--13984018
13
2.8
13
100
0
72
13
25
36
25
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13984390--13984479
45
2.0
45
100
0
180
46
24
4
24
1.71
13984966--13985082
42
2.8
40
81
10
135
29
27
19
23
1.98
13984966--13985082
43
2.8
40
80
14
128
29
27
19
23
1.98
13993466--13993501
15
2.4
15
95
0
63
41
30
5
22
1.76
13994741--13994786
21
2.2
21
96
0
83
23
26
6
43
1.78
13995933--13995986
11
4.7
11
84
13
65
81
1
11
5
0.93
13995938--13995981
6
7.5
6
80
14
56
81
2
13
2
0.88
13995938--13995984
17
2.7
18
90
6
78
80
2
12
4
0.94
13995928--13995986
17
3.5
17
84
11
77
81
1
10
6
0.94
14002450--14002566
43
2.8
42
80
2
128
25
17
24
32
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770