Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          769   770   

This is table  481  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
148586206--148586240
17
2.1
17
89
10
54
11
17
5
65
1.43
148586381--148586661
77
3.7
77
90
3
385
26
17
20
35
1.94
148586381--148586701
77
4.2
78
87
5
356
25
18
19
36
1.94
148586380--148586701
152
2.1
152
80
5
366
25
18
19
36
1.95
148586692--148586728
14
2.8
13
84
8
56
10
13
8
67
1.41
148587493--148587667
30
5.8
30
89
1
228
26
48
4
21
1.68
148588174--148588298
58
2.2
59
81
8
143
36
4
3
56
1.34
148588234--148588343
25
4.1
27
67
14
75
33
5
2
58
1.35
148588330--148588378
25
2.0
25
91
0
80
34
8
6
51
1.57
148588532--148588579
16
3.1
15
90
6
69
31
2
2
64
1.16
148588532--148588583
8
6.5
8
82
8
61
30
1
1
65
1.14
148589154--148589201
16
3.1
15
90
6
69
64
2
2
31
1.16
148589150--148589201
8
6.5
8
82
8
61
65
1
1
30
1.14
148589149--148589205
24
2.4
24
79
5
71
64
1
3
29
1.20
148589329--148589393
25
2.8
24
83
6
80
52
6
7
33
1.55
148589408--148589468
25
2.5
24
83
5
77
63
0
3
32
1.10
148589413--148589470
13
4.5
13
74
18
50
62
0
3
34
1.12
148590034--148590208
30
5.8
30
88
1
228
21
4
48
26
1.68
148590574--148590607
18
1.9
18
88
5
52
11
8
41
38
1.73
148591429--148591453
9
2.8
9
100
0
50
84
0
16
0
0.63
148591806--148591830
13
1.9
13
100
0
50
12
16
32
40
1.84
148592155--148592219
30
2.2
30
81
10
71
44
1
3
50
1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
148594449--148594492
20
2.2
21
84
8
56
34
0
6
59
1.24
148595904--148596031
41
3.1
41
96
1
231
35
21
25
18
1.96
148596101--148596149
18
2.6
18
81
15
55
48
28
0
22
1.50
148596649--148596697
24
2.0
24
96
0
89
53
2
4
40
1.32
148596987--148597039
14
3.7
14
80
5
52
22
1
26
49
1.60
148597028--148597094
21
3.1
22
77
14
77
14
0
43
41
1.46
148597058--148597098
7
5.9
7
91
0
55
14
0
48
36
1.44
148597253--148597319
14
4.7
14
85
3
89
38
4
16
40
1.69
148597464--148597514
13
3.9
13
77
7
50
45
0
0
54
0.99
148597878--148597941
22
2.9
23
82
15
80
64
3
1
31
1.19
148597905--148597941
13
3.1
13
81
18
53
64
5
0
29
1.15
148597946--148598054
38
2.8
40
90
5
177
40
19
22
18
1.92
148598284--148598362
35
2.3
35
82
4
97
32
35
3
27
1.75
148600633--148601066
241
1.8
241
98
0
850
33
18
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1.13

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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