Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          769   770   

This is table  518  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
160822072--160822197
47
2.7
46
82
11
152
23
18
28
30
1.97
160830351--160830492
40
3.5
40
82
3
117
28
23
26
21
1.99
160830389--160830518
40
3.3
39
78
11
147
23
23
26
25
2.00
160831621--160831650
14
2.1
14
100
0
60
50
13
6
30
1.67
160834741--160834873
59
2.3
58
81
3
151
24
33
15
26
1.95
160834791--160834873
29
2.9
29
98
0
157
26
30
14
28
1.95
160838972--160839057
43
2.0
43
100
0
172
44
30
6
18
1.76
160842966--160843136
93
1.8
93
93
0
297
28
27
22
22
1.99
160842961--160843132
46
3.7
46
77
13
190
28
26
22
22
1.99
160843009--160843152
46
3.1
44
75
15
132
28
27
21
22
1.99
160843555--160843614
30
2.0
30
90
0
93
30
25
8
36
1.85
160853782--160853824
20
2.2
20
95
0
77
13
2
53
30
1.53
160864931--160865324
127
3.1
125
84
5
517
28
17
17
37
1.92
160867510--160867539
1
30.0
1
93
0
51
96
0
3
0
0.21
160868374--160868403
11
2.7
11
89
0
51
40
0
0
60
0.97
160870630--160870665
12
3.0
12
87
0
54
25
22
5
47
1.73
160877552--160877815
71
3.7
69
83
6
332
25
14
22
37
1.92
160877694--160877940
122
2.0
124
90
3
392
24
13
22
39
1.90
160877385--160877977
263
2.3
257
95
2
1042
25
14
22
36
1.93
160877815--160878255
72
6.1
71
69
10
306
25
16
21
36
1.94
160878045--160878256
74
2.9
74
83
4
259
26
17
23
31
1.97
160878246--160878280
14
2.5
14
90
0
52
17
20
5
57
1.60
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
160878261--160878945
75
8.8
77
72
17
337
29
18
19
32
1.96
160878099--160878899
166
5.0
165
84
8
949
28
18
20
33
1.96
160878427--160878586
74
2.1
75
85
6
209
28
18
21
31
1.96
160878612--160879111
75
6.5
73
74
14
398
29
17
19
34
1.94
160878887--160879058
88
2.0
88
84
4
231
28
16
17
37
1.92
160879093--160879153
29
2.1
30
93
3
106
19
9
29
40
1.84
160878751--160879314
247
2.3
243
83
8
697
27
17
18
36
1.93
160883728--160883786
28
2.1
28
100
0
118
16
11
25
45
1.82
160885407--160885444
20
1.9
20
88
0
58
52
10
2
34
1.50
160887732--160887907
46
3.8
46
81
10
232
20
21
29
28
1.98
160887728--160887899
93
1.8
93
96
0
317
20
22
30
27
1.98
160890856--160890924
15
4.6
15
83
0
84
11
17
13
57
1.64
160890847--160890934
30
3.0
30
81
8
99
10
17
15
56
1.66
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1.98
Indices
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Copy
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1.99
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Period
Size
Copy
Number
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29
22
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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