Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  51  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14741179--14741307
71
1.9
70
85
10
187
38
4
5
51
1.46
14742255--14742289
18
1.9
18
88
11
54
0
25
0
74
0.82
14751847--14752064
45
4.9
45
86
3
273
27
28
20
23
1.99
14760949--14760977
3
9.7
3
100
0
58
31
0
0
68
0.89
14769860--14769902
18
2.4
18
96
0
77
18
13
16
51
1.77
14772830--14773014
79
2.3
82
82
8
229
26
27
21
24
1.99
14772829--14773014
40
4.6
41
82
9
215
26
27
21
24
1.99
14780989--14781160
67
2.6
66
81
7
170
31
16
29
22
1.96
14781013--14781197
67
2.9
64
77
8
196
28
16
30
24
1.96
14786199--14786423
27
8.3
26
77
9
139
35
23
9
32
1.86
14786193--14786324
54
2.4
54
82
0
174
33
26
6
33
1.83
14786193--14786340
54
2.7
54
81
2
154
33
24
8
34
1.85
14786306--14786396
28
3.3
28
89
4
123
39
19
9
30
1.85
14786292--14786424
28
4.9
27
81
8
99
36
21
9
31
1.86
14786292--14786425
55
2.4
54
79
8
146
36
21
10
31
1.87
14786402--14786470
27
2.6
27
83
4
95
28
21
7
42
1.80
14786238--14786488
137
1.9
134
82
5
319
35
21
8
34
1.84
14786777--14786882
31
3.4
31
93
0
185
28
25
16
29
1.97
14786910--14786997
42
2.1
42
89
0
131
36
18
13
31
1.90
14787143--14787239
26
3.8
26
88
1
144
26
22
23
26
2.00
14787130--14787239
26
4.4
25
83
4
125
26
22
21
29
1.99
14787130--14787239
51
2.2
49
88
8
159
26
22
21
29
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14787289--14787375
20
4.3
20
92
2
140
31
18
10
40
1.84
14788178--14788330
27
5.7
27
76
6
123
30
7
20
40
1.81
14788235--14788370
27
5.0
27
71
8
89
28
11
21
38
1.87
14788342--14788590
27
9.2
27
75
7
137
34
7
23
34
1.83
14788404--14788635
54
4.3
54
69
8
137
33
8
23
34
1.85
14788445--14788525
28
2.9
27
83
7
83
27
9
24
38
1.87
14788431--14788563
55
2.4
54
79
6
142
30
8
23
37
1.84
14788477--14788549
28
2.7
27
91
6
112
30
6
20
42
1.78
14788404--14788628
27
8.3
27
72
11
118
32
8
23
35
1.85
14790571--14790656
25
3.4
25
84
6
104
29
17
24
29
1.97
14790789--14790877
41
2.1
41
87
2
124
31
13
19
35
1.90
14792817--14792980
71
2.3
71
97
0
310
18
28
18
34
1.95
14792817--14793014
71
2.8
70
90
3
249
20
28
17
32
1.96
14800539--14800572
17
1.9
18
94
5
61
32
11
23
32
1.91
14803090--14803130
20
2.0
20
85
0
55
31
9
9
48
1.69
14809586--14809617
6
5.3
6
92
0
55
15
3
0
81
0.82
14813568--14813624
17
3.5
15
84
15
53
38
10
15
35
1.82
14813568--14813646
36
2.1
38
90
9
126
37
10
16
35
1.82
14813568--14813646
19
4.2
19
90
9
126
37
10
16
35
1.82
14816860--14816899
18
2.2
18
86
8
55
17
0
15
67
1.23
14816901--14816933
11
2.9
12
86
13
52
66
0
0
33
0.92
14818789--14818966
79
2.2
81
92
2
297
34
5
8
52
1.54
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14819636--14819706
24
3.0
23
81
8
81
66
5
1
26
1.22
14821393--14821658
77
3.5
77
85
5
353
37
4
39
19
1.71
14828000--14828187
41
4.5
41
83
6
218
19
18
25
36
1.95
14829178--14829212
18
1.9
18
100
0
70
54
28
5
11
1.59
14838743--14838782
21
2.0
21
85
5
55
47
32
5
15
1.66
14842733--14842969
121
2.0
121
94
1
422
35
22
21
20
1.96
14856291--14856322
16
2.0
16
93
0
55
46
15
25
12
1.81
14856962--14857028
29
2.3
28
85
7
82
20
23
28
26
1.99
14858992--14859030
2
19.5
2
100
0
78
48
0
0
51
1.00
14865161--14865242
43
1.9
43
92
5
139
24
21
1
52
1.54
14873135--14873346
23
9.0
24
91
4
317
27
21
23
27
1.99
14873135--14873347
47
4.5
48
90
5
319
27
21
23
27
1.99
14873404--14873460
9
5.9
9
73
15
51
35
21
8
35
1.84
14873392--14873462
20
3.5
20
94
0
124
32
21
11
35
1.89
14873397--14873451
11
5.4
11
70
16
55
30
20
12
36
1.90
14881309--14881449
23
6.1
23
95
2
257
29
21
21
27
1.99
14881309--14881449
47
3.1
46
94
3
257
29
21
21
27
1.99
14881288--14881451
70
2.3
69
93
4
276
28
21
22
27
1.99
14881508--14881564
9
5.9
9
73
15
51
35
21
8
35
1.84
14881496--14881566
20
3.5
20
94
0
124
32
21
11
35
1.89
14881501--14881555
11
5.4
11
70
16
55
30
20
12
36
1.90
14884644--14884812
40
4.2
40
80
4
173
23
26
21
28
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14886008--14886116
56
2.0
53
82
12
132
28
16
18
36
1.92
14891091--14891119
2
14.5
2
100
0
58
51
0
0
48
1.00
14896125--14896215
45
2.0
45
91
0
146
25
12
23
39
1.89
14909175--14909301
40
3.2
39
76
8
121
22
29
24
23
1.99
14909191--14909341
40
3.8
40
77
6
137
23
26
23
26
2.00
14909191--14909340
80
1.9
80
83
8
198
22
26
24
26
2.00
14914379--14914447
27
2.6
27
80
0
84
26
21
13
39
1.90
14919274--14919456
63
2.9
63
82
5
219
28
7
29
34
1.84
14922237--14922346
40
2.8
40
85
0
148
26
23
26
23
2.00
14922237--14922386
40
3.8
39
80
7
133
26
22
26
24
2.00
14923998--14924040
20
2.2
20
95
0
77
9
30
39
20
1.84
14926231--14926412
39
4.6
39
89
2
258
30
30
21
18
1.97
14926170--14926376
78
2.6
78
84
3
263
29
28
21
20
1.98
14926160--14926478
78
4.1
79
79
4
245
30
29
20
19
1.97
14926320--14926478
39
4.1
39
82
9
173
29
30
22
18
1.97
14926551--14926623
28
2.6
28
86
0
110
28
23
9
38
1.86
14932059--14932084
12
2.2
12
100
0
52
69
0
7
23
1.14
14934041--14934105
23
2.8
23
88
0
94
16
15
26
41
1.88
14934039--14934121
23
3.7
23
85
1
87
18
18
22
40
1.91
14935477--14935520
19
2.3
19
88
4
61
45
0
0
54
0.99
14938569--14938604
14
2.5
15
86
4
56
58
8
13
19
1.61
14939883--14939949
28
2.4
27
78
7
71
28
7
1
62
1.31
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14941194--14941235
15
2.9
14
85
7
57
16
16
7
59
1.58
14945199--14945232
17
2.0
17
100
0
68
29
23
11
35
1.90
14948481--14948831
119
3.0
115
77
9
314
39
19
12
28
1.88
14955685--14955709
11
2.3
11
100
0
50
60
0
16
24
1.36
14960777--14960877
51
2.0
51
98
0
193
36
4
17
40
1.72
14962770--14962798
2
14.5
2
100
0
58
48
0
0
51
1.00
14964884--14964942
29
2.0
29
90
6
93
30
1
13
54
1.49
14968362--14968530
40
4.2
40
80
4
173
23
26
21
28
1.99
14976372--14976546
39
4.5
39
83
8
169
23
26
22
27
2.00
14976372--14976546
40
4.5
40
82
7
171
23
26
22
27
2.00
14983294--14983442
80
1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
14983335--14983442
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
14990850--14990957
42
2.6
42
85
1
137
18
29
32
19
1.96
14994878--14994944
34
2.0
34
88
2
100
25
22
23
28
1.99
15010470--15010517
13
3.8
12
76
17
53
4
14
2
79
0.98
15010470--15010517
6
7.7
6
80
13
53
4
14
2
79
0.98
15011794--15011886
6
15.5
6
73
8
64
45
13
16
24
1.84
15018925--15019053
47
2.7
47
79
4
136
26
17
24
31
1.97
15025924--15026005
43
1.9
43
92
5
139
21
19
28
30
1.98
15031874--15031916
21
2.0
21
100
0
86
41
9
13
34
1.77
15037797--15037926
47
2.8
47
79
0
143
22
18
26
32
1.97
15040366--15040487
46
2.6
46
81
2
136
31
19
26
22
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15040505--15040679
49
3.6
49
77
6
160
29
19
26
24
1.98
15044153--15044217
22
3.0
21
80
8
62
46
1
7
44
1.41
15050152--15050249
35
2.7
37
87
12
150
37
10
16
35
1.82
15050152--15050242
19
4.9
19
92
8
161
37
10
15
36
1.83
15050152--15050265
19
5.8
22
87
10
96
36
9
15
37
1.81
15058819--15058980
89
1.8
87
82
5
209
30
19
22
26
1.98
15059013--15059383
78
4.8
78
90
1
582
32
19
24
23
1.98
15059308--15059518
89
2.4
88
79
10
232
30
18
23
27
1.97
15059545--15059832
78
3.5
78
85
6
342
32
18
25
24
1.97
15059701--15059912
45
4.7
45
76
10
218
30
16
27
25
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770