Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  123  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
35934342--35934398
18
3.1
19
85
10
73
35
0
8
56
1.31
35934347--35934404
19
3.0
19
82
2
71
32
0
10
56
1.33
35935603--35935645
6
7.0
6
97
2
77
16
0
0
83
0.64
35936639--35936694
28
2.0
28
100
0
112
25
25
10
39
1.87
35939895--35939949
20
2.8
19
78
10
67
40
9
1
49
1.45
35940505--35940536
17
1.9
16
93
6
55
56
0
0
43
0.99
35941835--35941883
18
2.7
18
75
12
55
42
0
0
57
0.99
35941823--35941876
19
2.9
19
77
2
56
42
0
0
57
0.98
35942653--35942719
28
2.4
28
89
0
98
58
1
8
31
1.38
35942709--35942743
15
2.2
16
90
5
54
77
8
0
14
0.99
35942708--35942744
16
2.3
17
81
13
51
78
8
0
13
0.96
35943739--35943825
45
2.0
44
90
2
138
50
16
4
28
1.64
35946766--35946811
23
2.0
22
83
4
56
54
4
0
41
1.20
35949692--35949775
26
3.2
26
96
0
150
33
4
25
36
1.77
35955442--35955525
26
3.2
26
96
0
150
33
4
25
36
1.77
35960324--35960583
131
2.0
131
87
2
380
35
18
18
28
1.94
35963060--35963154
17
5.4
18
69
15
65
58
6
2
32
1.35
35964175--35964231
28
2.0
28
100
0
114
40
24
0
35
1.56
35968780--35968854
33
2.3
33
85
0
96
41
22
13
22
1.89
35970256--35970297
17
2.5
16
82
17
50
19
2
0
78
0.86
35970269--35970307
20
2.0
20
89
0
60
20
5
0
74
1.01
35976166--35976221
27
2.1
27
100
0
112
26
10
25
37
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
35979117--35979194
31
2.5
31
81
4
86
51
11
6
30
1.63
35980143--35980181
13
2.9
13
88
3
51
35
17
7
38
1.79
35987038--35987071
18
1.9
18
88
5
52
29
0
5
64
1.17
35987146--35987184
18
2.3
18
86
8
55
64
0
0
35
0.94
35989897--35990068
46
3.7
46
77
13
181
27
19
28
24
1.98
35989899--35990203
140
2.2
139
81
8
343
29
17
28
24
1.97
35989995--35990207
47
4.6
45
80
10
193
28
17
29
24
1.97
35989981--35990207
94
2.4
93
80
9
243
28
16
29
24
1.97
35991845--35991880
6
6.0
6
100
0
72
0
16
50
33
1.46
35998313--35998346
11
3.0
11
86
4
50
70
0
26
2
1.01
36002336--36002374
20
1.9
20
84
5
51
61
2
2
33
1.23
36016492--36016541
23
2.2
23
85
3
66
14
0
36
50
1.43
36016557--36016620
26
2.5
26
100
0
128
43
0
15
40
1.47
36016604--36016644
16
2.5
17
77
22
52
58
0
0
41
0.98
36016719--36016970
125
2.0
125
86
3
355
36
15
19
28
1.92
36018037--36018094
19
3.2
19
68
22
61
36
1
10
51
1.46
36018040--36018106
35
1.9
35
93
0
116
34
1
13
50
1.51
36021741--36021810
27
2.5
28
88
2
106
28
14
25
31
1.95
36021741--36021822
27
3.0
27
80
8
103
29
13
23
34
1.93
36029817--36029886
27
2.5
28
88
2
106
28
14
25
31
1.95
36029817--36029898
27
3.0
27
80
8
103
29
13
23
34
1.93
36034303--36034400
27
3.6
27
70
22
87
57
5
4
33
1.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
36034286--36034418
56
2.4
56
97
0
248
51
7
3
37
1.45
36034325--36034411
27
3.2
26
67
23
70
52
6
2
37
1.41
36035492--36035547
7
8.0
7
93
0
94
57
12
1
28
1.46
36036489--36036587
48
2.0
49
90
1
155
57
3
6
33
1.38
36036747--36036826
10
7.6
10
74
20
74
38
0
28
32
1.57
36036747--36036823
32
2.4
32
97
0
145
40
0
28
31
1.57
36038978--36039043
27
2.4
27
100
0
132
48
3
13
34
1.58
36040302--36040330
2
14.5
2
100
0
58
51
0
0
48
1.00
36046686--36046838
65
2.4
65
88
0
225
22
21
22
33
1.97
36046881--36046967
26
3.3
26
88
0
120
19
20
19
40
1.92
36052635--36052827
40
4.8
40
87
3
239
23
20
28
27
1.99
36052647--36052851
40
5.1
40
84
3
135
24
20
27
27
1.99
36052647--36052851
80
2.6
80
80
3
243
24
20
27
27
1.99
36060575--36060767
40
4.8
40
87
3
230
25
20
26
26
1.99
36071790--36071890
27
3.7
28
90
2
152
32
20
25
20
1.97
36072296--36072326
8
3.9
8
91
0
53
3
22
25
48
1.66
36079568--36079635
27
2.5
26
81
6
73
39
17
20
22
1.92
36079614--36079673
27
2.2
28
90
3
95
33
13
25
28
1.93
36082030--36082078
21
2.3
21
89
6
73
14
32
26
26
1.94
36089557--36089644
44
2.0
44
84
8
117
37
21
13
27
1.91
36089768--36091631
936
2.0
933
92
1
3126
37
19
8
34
1.82
36107549--36107579
12
2.6
12
94
0
53
6
22
41
29
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
36108526--36108680
43
3.6
43
79
8
174
29
23
19
28
1.98
36115622--36115669
24
2.0
24
100
0
96
45
8
20
25
1.79
36118487--36118658
43
4.0
43
78
6
159
31
28
17
22
1.97
36119787--36119815
14
2.0
15
93
6
51
51
20
0
27
1.47
36120068--36120106
20
2.1
19
85
9
53
30
5
12
51
1.62
36122914--36123012
28
3.5
29
80
6
105
30
26
15
28
1.96
36133502--36133606
27
3.9
27
82
9
126
17
24
21
36
1.95
36133502--36133613
54
2.1
54
86
6
156
16
24
22
36
1.94
36140351--36140424
29
2.6
29
87
8
98
27
16
32
24
1.96
36143864--36144035
93
1.8
93
88
2
265
27
27
22
22
1.99
36143856--36144031
46
3.8
46
76
12
171
28
27
21
22
1.99
36150559--36150647
30
3.0
30
79
8
92
57
14
16
11
1.65
36150559--36150638
15
5.4
15
79
7
83
58
12
17
11
1.62
36150570--36150647
15
5.2
15
75
9
70
56
14
16
12
1.68
36152182--36152357
46
3.8
46
77
15
191
30
28
19
22
1.98
36152191--36152362
93
1.8
93
91
0
281
29
29
19
21
1.98
36154741--36154820
30
2.7
30
79
11
83
55
13
17
13
1.70
36154743--36154811
15
4.6
14
80
10
68
57
11
17
13
1.64
36157765--36157936
93
1.8
93
92
2
292
29
29
20
20
1.98
36157757--36157931
46
3.8
45
79
10
201
29
29
20
21
1.98
36157808--36157951
46
3.1
44
71
21
116
29
28
20
22
1.98
36162998--36163146
42
3.5
43
81
6
151
24
19
28
27
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
36170908--36170937
2
15.0
2
100
0
60
50
0
0
50
1.00
36175202--36175264
27
2.2
28
83
8
92
20
25
31
22
1.98
36180292--36180334
21
2.0
21
100
0
86
44
4
23
27
1.73
36190172--36190297
46
2.7
46
92
2
200
22
21
26
30
1.99
36199411--36199656
40
6.2
40
81
3
252
23
26
21
28
1.99
36199411--36199614
80
2.6
80
91
3
317
23
27
21
27
1.99
36213971--36214275
80
3.9
80
89
3
433
25
22
26
25
2.00
36213971--36214236
40
6.7
40
92
3
441
24
22
27
25
2.00
36222706--36223085
48
7.9
48
77
6
313
25
27
17
28
1.98
36222706--36223075
144
2.6
143
83
6
428
24
27
18
29
1.98
36222704--36223085
96
4.0
97
77
8
366
25
27
18
29
1.98
36239597--36239633
19
2.0
19
89
5
58
27
18
37
16
1.92
36239706--36239853
29
5.2
29
77
4
140
26
14
31
27
1.95
36247423--36247450
10
2.8
10
100
0
56
21
10
46
21
1.81
36247537--36247640
29
3.7
29
79
3
113
26
13
30
28
1.94
36247589--36247652
29
2.2
29
82
0
74
29
15
29
25
1.96
36249601--36249696
44
2.2
43
85
7
124
26
16
26
31
1.97
36249602--36249757
42
3.7
42
75
14
142
26
17
25
31
1.97
36254192--36254663
232
2.0
232
98
0
908
35
9
22
32
1.86
36255624--36255771
43
3.5
42
78
11
149
31
25
16
26
1.96
36255624--36255771
44
3.5
42
81
8
165
31
25
16
26
1.96
36255615--36255772
86
1.8
85
83
4
210
31
26
16
25
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
36258201--36258239
14
3.0
13
82
10
53
61
10
10
17
1.55
36260502--36260659
68
2.3
68
78
9
167
20
28
15
35
1.93
36267529--36267686
68
2.3
68
76
11
160
21
29
14
34
1.93
36269920--36269960
6
6.7
6
83
5
55
78
0
4
17
0.93
36278589--36278839
46
5.4
46
74
11
154
23
29
19
28
1.98
36278719--36278839
46
2.6
46
85
5
156
22
28
19
29
1.98
36287681--36287910
40
5.8
40
91
1
329
23
20
27
28
1.99
36287681--36287936
40
6.4
40
89
2
322
24
19
27
28
1.99
36291501--36291704
40
5.1
40
89
1
284
22
21
29
26
1.99
36291497--36291708
80
2.7
80
89
2
320
23
21
28
26
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770