Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          769   770   

This is table  172  of  770  ( 92376 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
51224648--51224678
5
6.2
5
100
0
62
22
0
0
77
0.77
51230624--51230661
17
2.2
18
85
4
51
26
10
2
60
1.43
51231404--51231433
8
3.6
8
95
4
51
36
0
0
63
0.95
51233472--51233509
19
2.0
20
84
5
51
34
0
18
47
1.49
51236729--51236770
20
2.2
19
87
12
59
54
0
42
2
1.13
51238480--51238746
44
6.0
45
81
9
271
30
28
16
23
1.96
51238517--51238738
89
2.5
89
91
2
358
30
29
16
22
1.96
51238924--51239149
38
5.9
38
88
1
299
34
25
19
19
1.96
51244149--51244191
21
2.1
21
86
4
61
62
0
2
34
1.08
51246892--51246950
17
3.5
17
70
25
54
64
0
1
33
1.04
51247425--51247522
17
5.5
18
85
4
128
37
12
10
39
1.77
51247425--51247531
35
3.0
35
91
4
160
38
13
9
39
1.76
51247932--51248257
83
3.9
83
92
0
526
27
19
19
33
1.96
51248181--51248442
119
2.2
119
93
0
443
29
18
19
32
1.95
51249866--51249944
29
2.7
29
86
5
106
27
32
15
24
1.95
51257650--51257728
29
2.7
29
86
5
106
27
32
15
24
1.95
51258829--51258866
19
2.1
18
85
9
51
13
18
2
65
1.37
51265446--51265524
29
2.7
29
86
5
106
27
32
15
24
1.95
51266625--51266662
19
2.1
18
85
9
51
13
18
2
65
1.37
51273239--51273317
29
2.7
29
86
5
106
27
32
15
24
1.95
51274893--51275072
44
4.1
44
73
8
159
28
23
15
32
1.95
51275939--51276000
8
7.8
8
79
13
74
1
12
0
85
0.67
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
51275941--51276002
14
4.8
12
81
16
63
1
12
0
85
0.67
51275940--51276000
18
3.8
16
77
16
72
1
13
0
85
0.68
51275960--51276002
18
2.4
18
96
0
77
0
11
0
88
0.52
51281771--51281827
17
3.5
17
76
11
57
63
0
1
35
1.05
51282301--51282398
17
5.5
18
84
4
128
36
12
10
40
1.77
51282301--51282407
35
3.0
35
91
4
160
37
13
9
40
1.76
51284974--51285108
40
3.4
40
92
0
216
29
28
18
22
1.98
51293060--51293194
40
3.4
40
96
0
243
28
29
20
21
1.98
51295512--51295725
40
5.3
40
86
3
245
25
28
21
24
1.99
51295501--51295725
120
1.9
119
81
8
278
25
28
21
24
1.99
51303734--51303958
40
5.7
40
87
1
267
25
28
22
24
1.99
51309550--51309730
46
3.9
46
80
9
224
21
21
29
27
1.99
51309552--51309722
93
1.8
93
94
0
306
21
22
29
27
1.99
51312122--51312164
20
2.2
19
87
4
59
44
2
16
37
1.60
51313053--51313112
30
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0
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1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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23
2.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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