Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  223  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
66747844--66747869
2
13.0
2
100
0
52
50
0
0
50
1.00
66755288--66755349
31
2.0
32
84
9
83
35
17
24
22
1.95
66757254--66757385
50
2.6
51
82
3
167
34
14
12
37
1.84
66757287--66757392
52
2.1
52
85
3
144
32
13
14
40
1.84
66759558--66759684
29
4.4
29
90
1
202
25
16
29
27
1.97
66764728--66764754
10
2.7
10
100
0
54
40
29
11
18
1.85
66764728--66764776
21
2.4
21
82
3
55
34
30
10
24
1.89
66766302--66766348
15
3.2
15
72
6
51
29
0
25
44
1.54
66766295--66766354
29
2.1
29
90
0
93
28
1
28
41
1.66
66766989--66767033
14
3.3
14
84
6
65
48
13
0
37
1.42
66767045--66767114
22
3.3
22
64
28
60
38
15
11
34
1.84
66767016--66767121
42
2.5
42
98
1
203
40
14
12
33
1.83
66767568--66767594
10
2.7
10
100
0
54
18
11
29
40
1.85
66769405--66769452
20
2.4
20
71
0
51
31
16
29
22
1.96
66769434--66769482
20
2.5
20
77
16
57
30
14
36
18
1.90
66771821--66771863
22
2.0
22
86
9
61
37
18
11
32
1.87
66775231--66775279
20
2.5
20
72
0
53
32
16
28
22
1.95
66775261--66775309
20
2.5
20
77
16
57
30
14
36
18
1.90
66776835--66776873
18
2.1
19
85
4
53
7
23
2
66
1.30
66776891--66776940
18
2.8
18
87
0
73
12
30
0
58
1.34
66776952--66777040
42
2.1
42
91
0
142
15
23
4
56
1.58
66779499--66779547
20
2.5
20
77
16
57
30
12
36
20
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
66784118--66784238
50
2.4
52
83
2
165
37
13
16
33
1.87
66784257--66784382
39
3.2
39
88
2
180
45
15
9
30
1.77
66786079--66786117
20
1.9
20
84
5
51
7
23
0
69
1.14
66791503--66791544
16
2.6
16
96
0
75
66
0
16
16
1.25
66795336--66795432
30
3.2
30
70
8
81
27
14
28
28
1.95
66797896--66797935
19
2.1
19
85
0
53
25
35
17
22
1.95
66799174--66799221
14
3.4
14
85
0
60
18
31
6
43
1.75
66800254--66800350
42
2.3
42
89
1
142
56
4
23
15
1.56
66800255--66800321
21
3.2
21
67
0
53
52
2
25
19
1.60
66800354--66800403
18
2.8
18
87
0
73
58
0
28
14
1.37
66800347--66800428
24
3.4
24
77
0
101
60
0
26
12
1.31
66800345--66800465
48
2.5
48
80
5
120
60
0
26
12
1.38
66800421--66800459
18
2.1
19
85
4
53
66
2
23
7
1.30
66802040--66802087
20
2.4
20
75
0
60
20
29
18
31
1.97
66811032--66811256
27
8.4
27
82
1
218
25
16
20
38
1.92
66811032--66811249
54
4.1
54
82
4
244
25
16
19
38
1.93
66811036--66811249
81
2.7
80
81
2
259
26
15
20
38
1.92
66815558--66815615
30
1.9
31
83
13
77
43
0
22
34
1.54
66818859--66818975
50
2.3
50
85
2
144
35
13
16
34
1.88
66819037--66819061
9
2.8
9
100
0
50
60
12
8
20
1.57
66821556--66821693
45
3.0
45
88
3
197
21
18
23
36
1.94
66822369--66822443
37
2.0
37
89
0
114
33
9
26
30
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
66828360--66828428
28
2.5
28
95
2
122
18
10
27
43
1.82
66830057--66830094
20
1.9
20
88
0
58
52
10
2
34
1.50
66836370--66836438
28
2.5
28
95
2
122
18
10
27
43
1.82
66838066--66838103
20
1.9
20
88
0
58
52
10
2
34
1.50
66849090--66849190
28
3.5
30
82
6
118
29
14
26
28
1.95
66849119--66849194
29
2.7
28
76
13
75
30
14
26
28
1.95
66852680--66852860
40
4.6
40
80
4
188
23
26
24
24
2.00
66853569--66853598
2
15.0
2
92
0
51
50
3
0
46
1.18
66860399--66860679
47
5.7
47
85
9
330
29
31
7
31
1.86
66860399--66860679
150
1.9
150
90
1
456
29
31
7
31
1.86
66867290--66867368
30
2.6
31
87
2
115
22
26
17
32
1.96
66867581--66867632
25
2.1
25
85
3
70
28
17
19
34
1.94
66867575--66867633
24
2.4
23
81
10
64
27
20
20
32
1.97
66869127--66869184
3
19.3
3
100
0
116
65
0
0
34
0.93
66872130--66872154
11
2.3
11
100
0
50
52
20
0
28
1.47
66872248--66872711
49
9.8
49
76
9
363
23
29
19
28
1.98
66872251--66872711
93
4.9
94
79
10
381
23
28
19
28
1.98
66872447--66872659
47
4.6
46
76
12
172
24
28
19
27
1.98
66872539--66872695
47
3.4
46
73
15
135
24
31
17
26
1.97
66874897--66874942
18
2.6
17
83
10
56
67
2
0
30
1.03
66875173--66875254
37
2.2
39
80
8
105
39
9
10
40
1.74
66876295--66876329
17
2.1
16
89
5
52
54
0
0
45
0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
66876490--66876553
28
2.2
29
83
5
85
37
9
10
42
1.73
66877278--66877322
11
4.5
11
76
21
53
48
2
0
48
1.13
66877278--66877316
9
4.1
9
86
6
51
53
0
0
46
1.00
66877278--66877317
18
2.2
19
90
4
64
52
0
0
47
1.00
66877650--66877719
29
2.4
29
85
2
88
52
5
4
37
1.45
66878423--66878470
24
2.0
24
88
8
71
45
8
6
39
1.59
66880153--66880214
30
2.0
33
87
9
94
37
11
9
41
1.74
66882722--66882860
42
3.2
43
74
12
133
27
20
24
28
1.99
66883320--66883351
12
2.6
13
90
9
50
18
6
25
50
1.70
66886135--66886384
27
9.3
27
81
0
277
40
20
8
31
1.81
66886129--66886391
54
4.9
54
86
2
332
39
20
7
31
1.81
66886399--66886770
27
13.8
27
84
4
455
26
22
10
40
1.86
66886399--66886765
81
4.5
83
85
4
507
26
22
10
40
1.86
66886775--66886969
27
7.2
27
81
4
223
35
18
20
26
1.95
66886782--66886970
54
3.5
54
88
1
272
34
19
20
25
1.96
66886950--66887013
27
2.4
27
74
10
67
17
18
26
37
1.93
66887169--66887251
27
3.1
26
87
5
112
19
21
21
37
1.94
66887562--66887635
27
2.8
27
87
6
98
18
24
20
36
1.95
66887753--66887951
6
32.8
6
75
15
178
18
17
15
48
1.81
66887753--66887951
97
2.1
97
95
0
353
18
17
15
48
1.81
66887753--66887972
30
7.1
30
80
8
217
18
17
15
49
1.80
66891518--66891693
46
3.8
46
81
10
232
20
21
29
28
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
66891514--66891685
93
1.8
93
96
0
317
20
22
30
27
1.98
66895930--66896080
42
3.5
43
74
11
139
26
21
24
27
1.99
66895921--66896088
42
3.9
43
75
9
137
26
20
24
28
1.99
66898790--66898821
12
2.6
13
90
9
50
18
6
25
50
1.70
66900143--66900221
40
2.0
40
97
0
149
26
16
10
46
1.78
66900549--66900695
65
2.3
65
86
2
206
36
24
19
20
1.95
66900882--66900917
17
2.1
17
94
0
63
16
19
16
47
1.83
66903618--66903792
45
3.8
46
79
13
216
29
29
20
20
1.98
66903625--66903795
93
1.8
92
96
1
315
28
29
21
21
1.98
66911180--66911351
93
1.8
93
96
0
317
27
29
21
20
1.98
66911173--66911348
46
3.8
46
79
12
216
28
29
21
20
1.98
66913415--66913441
6
4.5
6
100
0
54
66
0
33
0
0.92
66913625--66913663
17
2.3
17
95
0
69
30
2
12
53
1.52
66913523--66913788
140
1.9
140
98
0
514
36
5
22
35
1.78
66922740--66922786
21
2.2
22
84
3
60
21
8
12
57
1.62
66938984--66939165
43
4.2
43
85
1
204
29
14
24
31
1.95
66946811--66946942
29
4.6
29
84
1
149
25
16
32
25
1.96
66950378--66950569
40
4.8
40
86
1
260
26
28
21
23
1.99
66950358--66950569
80
2.7
79
88
3
318
27
28
20
23
1.99
66953028--66953056
14
2.0
15
93
6
51
27
0
20
51
1.47
66956708--66956766
30
2.0
30
83
6
75
23
8
42
25
1.82
66961557--66961705
40
3.7
40
80
1
138
26
26
20
25
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
66972717--66972781
18
3.4
18
71
19
60
23
9
13
53
1.68
66972712--66972789
39
2.0
39
94
0
138
21
11
16
50
1.77
66973820--66973875
20
2.8
20
89
2
78
44
3
12
39
1.60
66976788--66976951
40
4.1
39
82
7
186
24
20
28
26
1.99
66981509--66981586
29
2.7
29
83
0
102
26
17
33
21
1.96
66989359--66989436
29
2.7
29
83
0
102
26
17
33
21
1.96
67002106--67002165
30
2.0
30
83
6
77
40
11
10
38
1.75
67002403--67002446
22
2.0
22
86
0
61
43
0
4
52
1.22
67019674--67019699
2
13.0
2
100
0
52
50
0
0
50
1.00
67019704--67019746
19
2.3
19
87
0
59
81
0
16
2
0.79

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770