Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  489  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
151254863--151255031
47
3.6
47
92
3
286
28
22
20
28
1.99
151274993--151275053
30
2.0
30
83
0
77
31
22
8
37
1.84
151277230--151277414
40
4.6
39
89
5
239
25
26
21
26
2.00
151277230--151277414
79
2.3
79
85
8
259
25
26
21
26
2.00
151285387--151285571
40
4.6
39
89
5
239
25
26
21
26
2.00
151285387--151285571
79
2.3
79
85
8
259
25
26
21
26
2.00
151288881--151288972
28
3.4
28
85
10
129
34
13
25
27
1.92
151288996--151289096
51
2.0
51
92
3
168
30
11
27
29
1.92
151291868--151291936
28
2.5
28
93
6
115
18
8
27
44
1.79
151293454--151293491
20
1.9
20
88
0
58
52
10
2
34
1.50
151300589--151300804
39
5.6
39
88
2
294
29
25
22
22
1.99
151300589--151300772
77
2.4
78
91
0
298
30
23
21
23
1.99
151309230--151309401
46
3.7
46
79
13
199
27
28
21
22
1.99
151309235--151309405
93
1.8
93
93
0
297
27
29
21
21
1.99
151311420--151311634
39
5.5
39
89
1
272
29
26
20
22
1.99
151335481--151335653
43
4.0
43
76
12
176
23
17
26
32
1.97
151338234--151338389
43
3.6
42
79
9
145
28
16
23
32
1.96
151344190--151344271
29
2.8
29
98
0
155
29
14
30
25
1.95
151351002--151351185
40
4.6
39
75
6
138
26
23
27
22
2.00
151351042--151351230
80
2.4
81
77
4
186
23
24
29
22
1.99
151359122--151359305
40
4.6
39
75
6
138
26
23
27
22
2.00
151359162--151359350
80
2.4
81
77
4
186
23
24
29
22
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
151363681--151363847
40
4.2
40
82
2
185
24
26
22
26
2.00
151365615--151365691
34
2.3
34
81
0
91
25
18
16
38
1.92
151375737--151375779
23
2.0
21
81
9
50
13
32
9
44
1.76
151382131--151382190
15
3.9
15
79
12
68
58
5
3
33
1.36
151382224--151382291
17
3.8
18
75
17
63
69
5
1
23
1.19
151382224--151382304
38
2.1
39
80
15
89
67
6
2
23
1.25
151385071--151385168
26
3.8
26
89
1
153
27
23
23
25
2.00
151385218--151385332
20
5.8
20
84
4
146
33
20
9
36
1.85
151389208--151389370
70
2.3
71
98
1
319
34
17
28
19
1.94
151396769--151396886
41
3.1
41
60
28
98
32
17
28
21
1.96
151396737--151396900
71
2.3
71
100
0
328
35
17
28
18
1.94
151400416--151400613
71
2.8
70
92
3
294
33
17
28
20
1.95
151400482--151400599
41
3.1
41
60
28
98
32
17
28
21
1.96
151400450--151400613
71
2.3
71
100
0
328
35
17
28
18
1.94
151407980--151408177
71
2.8
70
92
3
294
33
17
28
20
1.95
151408046--151408163
41
3.1
41
60
28
98
32
17
28
21
1.96
151408014--151408177
71
2.3
71
100
0
328
35
17
28
18
1.94
151413031--151413159
43
3.0
43
79
10
156
24
19
27
28
1.98
151423202--151423793
27
22.1
27
81
4
592
31
10
19
38
1.85
151426323--151426357
17
2.1
17
94
0
61
25
20
28
25
1.99
151428521--151428630
40
2.8
40
85
0
148
23
26
23
26
2.00
151436573--151436682
40
2.8
40
85
0
148
23
26
23
26
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
151444869--151445038
85
2.0
86
91
5
283
27
21
25
25
1.99
151444869--151445099
40
5.7
40
83
10
249
26
20
26
25
1.99
151444869--151445076
85
2.5
78
81
14
258
27
21
25
25
1.99
151449142--151449311
40
4.2
40
83
1
207
24
24
27
24
2.00
151457121--151457328
40
5.2
40
81
2
211
25
23
25
25
2.00
151459654--151459683
13
2.3
13
94
0
51
26
13
3
56
1.52
151468483--151468654
93
1.8
93
96
0
317
27
30
22
20
1.98
151468475--151468650
46
3.8
46
81
10
232
28
29
21
20
1.98
151471034--151471122
30
3.0
30
80
8
101
57
15
16
10
1.65
151471034--151471113
15
5.4
15
80
7
92
58
13
17
10
1.62
151471045--151471122
15
5.2
15
78
9
79
56
15
16
11
1.67
151474070--151474241
93
1.8
93
96
0
317
27
30
22
20
1.98
151474062--151474237
46
3.8
46
81
10
232
28
29
21
20
1.98
151480304--151480417
51
2.2
51
93
0
192
28
22
14
33
1.94
151480405--151480431
7
3.9
7
100
0
54
0
29
25
44
1.54
151486878--151486991
51
2.2
51
93
0
192
28
22
14
33
1.94
151490716--151490785
27
2.5
28
95
2
124
28
14
27
30
1.95
151490716--151490797
27
3.0
27
85
8
78
29
15
24
30
1.96
151501440--151501621
78
2.3
81
86
6
257
24
22
27
25
2.00
151501440--151501623
40
4.7
40
86
8
252
24
22
27
25
2.00
151501440--151501656
118
1.8
118
81
7
271
25
22
27
24
2.00
151509621--151509806
40
4.7
40
86
5
234
24
19
27
27
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
151509674--151509829
80
2.0
79
84
6
208
25
19
27
27
1.99
151514603--151514661
28
2.1
28
100
0
118
47
16
13
22
1.82
151521440--151521468
14
2.0
15
93
6
51
51
20
0
27
1.47
151523809--151523984
46
3.8
46
80
12
225
21
21
28
28
1.98
151523806--151523976
93
1.8
93
96
0
315
21
21
29
28
1.98
151526938--151527017
15
5.4
15
77
7
83
10
18
13
57
1.64
151526929--151527016
30
3.0
30
80
11
92
10
18
15
55
1.68
151529384--151529559
46
3.8
46
80
12
225
21
21
28
28
1.98
151529381--151529551
93
1.8
93
96
0
315
21
21
29
28
1.98
151539969--151540155
40
4.7
40
89
2
270
26
29
20
23
1.99
151539949--151540154
79
2.6
78
88
4
297
27
29
19
23
1.98
151546676--151546862
40
4.7
40
89
2
270
26
29
20
23
1.99
151546656--151546861
79
2.6
78
88
4
297
27
29
19
23
1.98
151558957--151559078
46
2.6
47
82
5
138
27
22
14
36
1.93
151562505--151562542
15
2.4
17
87
12
55
2
26
0
71
1.00
151573123--151573315
40
4.8
40
80
6
187
24
20
28
26
1.99
151580499--151580527
14
2.0
15
93
6
51
48
20
0
31
1.50
151584930--151585172
24
10.1
24
97
0
432
20
17
25
36
1.94
151592938--151593178
24
10.1
24
96
1
423
20
17
25
36
1.94
151594613--151594745
24
5.5
24
85
3
135
27
15
21
36
1.93
151599610--151599781
40
4.3
40
81
2
186
25
27
21
26
1.99
151607585--151607751
40
4.2
40
82
2
185
24
26
22
26
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
151612967--151613184
40
5.4
40
84
4
217
26
21
26
25
1.99
151628798--151628854
26
2.2
26
83
3
69
28
19
17
35
1.94
151631949--151632046
38
2.6
38
88
0
133
21
16
27
34
1.95
151632067--151632118
22
2.4
21
90
6
77
23
13
25
38
1.91
151637200--151637367
40
4.2
40
82
1
185
24
26
22
26
2.00
151645210--151645376
40
4.2
40
82
2
185
24
26
22
26
2.00
151650872--151650899
13
2.2
13
100
0
56
50
14
7
28
1.69
151658194--151658255
32
1.9
32
96
0
115
29
9
22
38
1.86
151666430--151666508
5
14.2
6
77
19
66
48
16
2
32
1.60
151666426--151666471
20
2.2
21
92
7
85
47
19
0
32
1.50
151666426--151666472
11
4.5
11
87
12
73
46
19
0
34
1.50
151666505--151666532
14
2.0
14
100
0
56
71
0
14
14
1.15
151674780--151674873
18
5.4
18
92
3
131
36
25
9
28
1.87
151674780--151674860
9
9.0
9
70
0
54
34
27
9
28
1.89
151677239--151677327
21
4.1
21
84
5
90
53
10
23
12
1.68
151677239--151677307
21
3.3
21
87
2
95
55
8
24
11
1.64
151681474--151681502
14
2.1
14
100
0
58
51
6
13
27
1.66
151684270--151684309
13
2.8
15
85
14
66
65
0
0
35
0.93
151700215--151700365
40
3.8
40
79
6
155
25
22
27
23
2.00
151708219--151708385
40
4.2
40
78
6
160
25
22
27
24
2.00
151717203--151717329
47
2.8
44
81
11
148
22
20
29
27
1.98
151730474--151730521
25
1.9
25
86
0
69
33
25
16
25
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
151730558--151730624
20
3.3
20
87
0
98
31
11
23
32
1.91
151730675--151730793
23
5.1
23
89
2
184
26
19
22
31
1.98
151731008--151731071
31
2.1
31
90
0
101
35
15
23
25
1.94
151735824--151735890
33
2.1
30
83
8
80
56
0
5
37
1.24
151741727--151741875
80
1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
151741768--151741875
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
151750784--151750893
40
2.8
39
82
10
134
23
24
29
22
1.99
151750784--151750893
39
2.8
37
82
11
130
23
24
29
22
1.99
151758786--151758895
40
2.8
39
82
10
134
23
24
29
22
1.99
151758786--151758895
39
2.8
37
82
11
130
23
24
29
22
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770