Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  560  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
174425384--174425411
14
2.0
14
100
0
56
14
14
0
71
1.15
174425408--174425486
5
14.2
6
80
17
66
32
2
16
48
1.60
174425409--174425490
11
7.5
11
69
23
50
32
2
17
47
1.60
174425445--174425490
20
2.2
21
92
7
85
32
0
19
47
1.50
174433662--174433723
32
1.9
32
96
0
115
38
22
9
29
1.86
174441015--174441042
13
2.2
13
100
0
56
28
7
14
50
1.69
174457212--174457239
13
2.2
13
100
0
56
28
7
14
50
1.69
174467144--174467187
21
2.1
21
83
8
54
25
9
2
63
1.35
174469418--174469461
22
2.0
22
100
0
88
18
22
4
54
1.61
174473580--174473641
32
1.9
32
96
0
115
29
9
22
38
1.86
174481818--174481896
5
14.2
6
77
19
66
48
16
2
32
1.60
174481814--174481859
20
2.2
21
92
7
85
47
19
0
32
1.50
174481814--174481860
11
4.5
11
87
12
73
46
19
0
34
1.50
174481893--174481920
14
2.0
14
100
0
56
71
0
14
14
1.15
174490164--174490257
18
5.4
18
92
3
131
36
25
9
28
1.87
174490164--174490244
9
9.0
9
70
0
54
34
27
9
28
1.89
174493990--174494092
29
3.6
29
81
2
118
21
16
33
29
1.95
174501987--174502089
29
3.6
29
81
2
118
21
16
33
29
1.95
174505322--174505485
71
2.3
71
98
0
319
35
17
28
18
1.94
174514637--174514700
21
3.0
21
76
0
74
12
17
17
53
1.73
174523220--174523368
41
3.7
41
82
3
203
27
28
23
20
1.99
174531398--174531547
41
3.7
41
86
0
221
28
28
23
20
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
174534241--174534363
39
3.2
39
88
1
185
32
19
26
21
1.97
174534240--174534393
77
2.0
76
82
6
186
30
20
27
21
1.98
174542233--174542360
39
3.3
39
83
2
177
33
18
25
22
1.97
174551661--174551685
7
3.6
7
100
0
50
12
0
28
60
1.32
174554305--174554446
40
3.5
40
82
1
124
27
24
26
21
1.99
174554343--174554472
40
3.3
39
78
11
147
23
24
26
24
2.00
174567762--174567852
28
3.2
29
77
10
82
25
12
30
31
1.92
174571343--174571412
35
2.0
35
100
0
140
25
20
17
37
1.94
174575376--174575403
2
14.0
2
100
0
56
50
0
0
50
1.00
174582552--174582769
40
5.5
39
84
6
233
24
26
22
26
2.00
174582552--174582770
80
2.7
79
83
2
276
24
26
22
26
2.00
174582552--174582769
120
1.8
120
86
4
314
24
26
22
26
2.00
174587856--174588379
47
11.1
47
92
1
787
32
11
30
26
1.91
174588353--174588489
46
3.0
46
87
0
193
34
8
31
26
1.85
174601916--174601952
7
5.3
7
86
0
56
16
51
0
32
1.45
174601911--174601959
21
2.3
21
96
3
89
18
44
0
36
1.50
174606186--174606393
40
5.2
39
84
1
218
25
25
22
25
2.00
174606186--174606391
80
2.6
81
84
3
247
25
26
22
25
2.00
174614335--174614542
40
5.2
39
84
1
218
25
25
22
25
2.00
174614335--174614540
80
2.6
81
84
3
247
25
26
22
25
2.00
174619183--174619231
17
2.8
18
74
22
50
24
18
22
34
1.96
174620054--174620220
40
4.2
40
79
6
169
25
21
27
25
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
174627189--174627237
17
2.8
18
74
22
50
24
18
22
34
1.96
174628059--174628225
40
4.2
40
79
6
169
25
21
27
25
1.99
174632840--174633015
46
3.8
45
76
12
169
21
17
28
32
1.96
174632837--174633008
93
1.8
93
89
0
272
21
18
29
31
1.97
174635501--174635615
45
2.8
39
83
15
160
25
22
13
39
1.90
174635555--174635582
7
4.0
7
100
0
56
28
14
0
57
1.38
174635517--174635615
45
2.2
45
100
0
198
26
21
10
42
1.84
174635569--174635632
31
2.1
30
88
2
92
25
21
14
39
1.91
174635826--174636043
25
9.0
24
91
3
307
27
21
21
29
1.98
174636092--174636158
20
3.3
20
89
0
107
32
19
13
34
1.91
174636195--174636242
25
1.9
25
86
0
69
25
16
25
33
1.96
174639331--174639419
40
2.2
40
83
0
106
21
19
25
33
1.97
174639297--174639447
80
1.9
80
79
8
173
23
25
23
27
2.00
174643986--174644152
40
4.2
40
82
2
185
24
26
22
26
2.00
174644972--174645017
17
2.5
19
74
22
53
34
23
17
23
1.96
174651985--174652149
40
4.2
40
79
5
167
24
27
22
26
2.00
174652001--174652148
78
1.9
77
83
6
192
23
27
22
25
2.00
174652969--174653014
17
2.5
19
74
22
53
34
23
17
23
1.96
174660292--174660327
18
1.9
19
88
5
56
63
0
25
11
1.27
174661552--174661702
64
2.2
70
88
10
224
30
14
30
24
1.95
174661688--174661819
59
2.3
58
97
1
246
37
14
24
24
1.92
174661688--174661819
29
4.5
29
97
1
246
37
14
24
24
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
174668045--174668080
18
1.9
19
88
5
56
63
0
25
11
1.27
174669346--174669505
30
5.5
29
91
3
241
35
14
24
25
1.93
174669375--174669505
29
4.5
29
95
3
228
37
14
23
24
1.92
174669346--174669505
87
1.8
87
91
0
266
35
14
24
25
1.93
174671957--174672030
29
2.6
29
89
4
105
25
16
32
25
1.96
174679099--174679134
18
1.9
19
88
5
56
63
0
25
11
1.27
174680433--174680520
29
3.0
29
98
0
167
40
13
21
23
1.89
174680506--174680539
16
2.2
16
94
5
61
47
8
14
29
1.75
174680479--174680566
46
1.9
45
97
2
167
42
11
19
27
1.85
174680522--174680580
29
2.0
30
96
3
111
37
13
23
25
1.92
174686813--174686848
18
1.9
19
88
5
56
63
0
25
11
1.27
174688149--174688279
29
4.5
29
96
3
237
37
14
23
24
1.92
174688119--174688279
87
1.8
88
90
1
261
36
14
24
25
1.93
174690728--174690801
29
2.6
29
89
4
105
25
16
32
25
1.96
174702732--174702861
40
3.3
39
76
8
136
23
27
23
24
2.00
174702748--174702899
40
3.8
40
79
5
155
21
26
24
26
1.99
174702748--174702897
80
1.9
80
84
5
205
21
27
24
26
1.99
174709263--174709426
39
4.2
39
88
0
229
25
19
30
24
1.98
174709280--174709456
78
2.3
78
84
3
212
25
23
29
21
1.99
174709358--174709460
39
2.6
40
84
3
129
21
25
31
22
1.98
174717791--174718369
47
12.3
47
92
0
915
27
29
9
32
1.88
174720350--174720498
80
1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
174720391--174720498
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
174728468--174728616
80
1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
174728509--174728616
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
174747381--174747481
28
3.5
30
82
6
118
29
14
26
28
1.95
174747410--174747485
29
2.7
28
76
13
75
30
14
26
28
1.95
174754176--174754261
44
2.0
44
84
9
113
37
13
19
29
1.91
174754265--174754519
47
5.5
46
81
7
221
34
18
24
23
1.96
174756029--174756151
40
3.1
40
80
4
124
21
24
23
30
1.99
174757832--174757952
55
2.3
55
78
7
133
35
19
25
19
1.95
174763812--174763978
40
4.2
40
85
6
198
23
21
28
26
1.99
174763812--174763978
79
2.1
79
85
6
230
23
21
28
26
1.99
174765696--174765729
17
1.9
18
94
5
61
26
44
23
5
1.76
174768526--174768653
40
3.2
40
79
1
150
25
26
21
25
2.00
174772604--174772807
24
8.7
23
93
2
291
35
25
18
20
1.95
174772604--174772807
47
4.3
47
93
3
329
35
25
18
20
1.95
174772604--174772807
70
2.9
70
93
2
327
35
25
18
20
1.95
174780337--174780404
24
2.8
24
95
0
118
36
26
17
19
1.94
174783977--174784027
26
2.0
26
92
7
86
39
11
1
47
1.52
174786078--174786128
26
2.0
26
92
7
86
39
11
1
47
1.52
174788196--174788246
26
2.0
26
92
7
86
39
11
1
47
1.52
174790315--174790365
26
2.0
26
92
7
86
39
11
1
47
1.52
174792434--174792484
26
2.0
26
92
7
86
39
11
1
47
1.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
174794553--174794603
26
2.0
26
92
7
86
39
11
1
47
1.52
174796672--174796722
26
2.0
26
92
7
86
39
11
1
47
1.52
174798791--174798841
26
2.0
26
92
7
86
39
11
1
47
1.52
174800911--174800961
26
2.0
26
92
7
86
39
11
1
47
1.52
174803031--174803081
26
2.0
26
92
7
86
39
11
1
47
1.52
174805150--174805200
26
2.0
26
92
7
86
39
11
1
47
1.52
174805397--174805433
13
2.6
15
79
16
51
54
5
24
16
1.63
174807259--174807309
26
2.0
26
92
7
86
39
11
1
47
1.52
174808952--174809034
26
3.2
26
96
0
148
33
6
24
36
1.80
174810653--174810792
27
5.2
27
88
2
183
17
24
22
35
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770