Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  316  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
96621945--96622044
40
2.5
40
95
0
173
23
26
25
26
2.00
96639131--96639175
23
2.0
23
100
0
90
33
17
17
31
1.94
96645873--96646078
40
5.2
40
92
1
308
22
21
27
28
1.99
96654748--96654883
29
4.7
29
86
3
157
24
30
15
29
1.95
96654694--96654882
58
3.3
58
78
4
177
24
33
15
26
1.95
96661799--96661921
29
4.2
29
87
4
149
24
28
15
31
1.95
96661799--96661920
58
2.1
58
87
0
172
23
28
15
31
1.95
96662860--96662938
29
2.7
29
86
5
106
27
32
15
24
1.95
96663577--96663614
2
19.0
2
88
0
58
44
2
2
50
1.30
96670684--96670752
27
2.5
28
81
13
90
31
26
14
27
1.95
96670766--96670849
42
2.0
41
95
2
150
21
34
15
28
1.94
96673545--96673665
39
3.1
40
81
5
124
22
26
28
23
1.99
96681445--96681646
40
5.1
40
75
9
148
23
24
27
24
2.00
96681444--96681595
78
1.9
79
84
5
200
25
23
26
24
2.00
96684943--96685012
27
2.5
28
95
2
124
28
14
27
30
1.95
96684943--96685024
27
3.0
27
85
8
78
29
15
24
30
1.96
96688350--96688528
40
4.4
40
80
3
189
26
23
25
24
2.00
96688350--96688528
80
2.2
81
84
3
227
26
23
25
24
2.00
96691360--96691577
40
5.5
40
82
2
244
22
21
28
27
1.99
96699833--96699933
28
3.5
28
86
6
114
29
26
13
29
1.94
96707775--96707875
28
3.5
28
86
6
114
29
26
13
29
1.94
96710618--96710835
40
5.5
40
84
2
262
22
22
27
27
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
96715338--96715377
2
20.0
2
100
0
80
50
0
0
50
1.00
96717115--96717237
43
2.9
43
96
2
221
14
21
31
31
1.94
96717108--96717249
43
3.3
43
92
2
214
16
21
30
32
1.95
96717297--96717399
29
3.6
29
70
10
84
24
16
33
26
1.96
96717281--96717430
58
2.6
58
88
1
212
24
20
28
26
1.99
96719448--96719476
2
14.5
2
100
0
58
48
0
0
51
1.00
96721462--96721497
2
18.0
2
100
0
72
50
0
0
50
1.00
96723021--96723116
48
2.0
48
95
0
174
27
29
12
31
1.93
96726262--96726358
29
3.4
28
79
12
101
30
30
12
25
1.92
96726283--96726367
29
2.9
29
81
6
84
30
32
11
24
1.91
96726435--96726471
19
2.0
19
89
5
58
16
40
18
24
1.90
96726444--96726480
19
1.9
19
88
0
56
16
37
18
27
1.92
96726573--96726615
16
2.7
16
88
0
68
11
13
20
53
1.71
96734586--96734629
22
2.0
21
82
4
52
15
36
0
47
1.46
96735785--96735854
25
2.8
25
93
0
113
25
25
22
25
2.00
96740998--96741041
22
2.0
22
82
8
54
38
13
18
29
1.89
96741268--96741489
40
5.6
40
89
1
331
28
26
22
22
1.99
96746587--96746770
40
4.6
39
75
6
138
26
23
27
22
2.00
96746627--96746815
80
2.4
81
77
4
186
23
24
29
22
1.99
96752705--96752748
22
2.0
22
82
8
54
38
13
18
29
1.89
96752973--96753193
40
5.6
40
90
2
340
28
26
22
22
1.99
96752973--96753193
79
2.8
80
91
3
358
28
26
22
22
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
96758419--96758549
30
4.5
30
86
8
171
32
13
25
28
1.94
96758419--96758549
58
2.2
58
86
4
174
32
13
25
28
1.94
96766373--96766503
30
4.5
30
86
8
171
32
13
25
28
1.94
96766373--96766503
58
2.2
58
86
4
174
32
13
25
28
1.94
96768416--96768581
40
4.2
39
82
4
158
24
27
22
25
2.00
96768431--96768581
80
1.9
79
83
6
198
23
27
23
26
2.00
96776364--96776529
40
4.2
40
80
3
167
23
27
23
25
2.00
96776380--96776489
39
2.8
39
86
8
143
22
29
25
22
1.99
96780728--96780790
31
2.1
31
96
3
119
22
22
15
39
1.92
96780981--96781097
24
5.0
24
81
13
136
26
23
21
28
1.99
96781146--96781205
20
3.0
20
90
0
102
31
20
11
36
1.88
96781248--96781295
25
1.9
25
86
0
69
25
16
25
33
1.96
96785403--96785505
37
2.8
37
93
0
179
24
31
20
24
1.98
96785654--96786607
48
19.9
48
97
1
1716
29
28
6
35
1.83
96787744--96787777
2
17.0
2
100
0
68
50
0
0
50
1.00
96789959--96790037
40
2.0
40
97
0
149
25
31
22
20
1.98
96791316--96791418
37
2.8
37
96
0
188
24
32
20
23
1.98
96791559--96792184
48
13.0
48
97
0
1099
29
28
7
34
1.84
96801001--96801029
2
14.5
2
100
0
58
51
0
0
48
1.00
96803046--96803117
36
2.0
36
94
0
126
54
6
20
18
1.66
96808511--96808669
43
3.8
40
74
15
133
29
27
18
23
1.98
96812721--96812811
29
3.2
29
84
3
114
24
14
32
28
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
96812738--96812806
28
2.4
29
90
2
104
26
14
31
27
1.95
96823202--96823258
30
1.9
30
85
0
78
28
22
8
40
1.84
96824344--96824376
2
16.5
2
100
0
66
51
0
0
48
1.00
96832102--96832131
15
2.1
15
93
6
53
0
10
0
90
0.47
96841066--96841237
93
1.8
93
94
0
308
27
30
21
20
1.98
96841058--96841233
46
3.8
46
81
10
214
28
29
21
21
1.98
96843593--96843632
15
2.7
15
88
3
55
62
15
12
10
1.54
96849243--96849364
47
2.6
44
82
11
138
29
17
31
22
1.96
96864724--96864754
2
15.5
2
100
0
62
51
0
0
48
1.00
96869042--96869096
19
2.9
19
100
0
110
38
9
10
41
1.72
96869637--96869670
14
2.3
15
85
10
52
44
0
0
55
0.99
96871807--96871884
29
2.7
29
83
0
102
26
17
33
21
1.96
96879648--96879723
29
2.7
29
85
4
102
27
17
31
23
1.97
96887368--96887575
40
5.2
39
85
1
236
25
26
22
25
2.00
96887368--96887575
80
2.6
80
85
1
265
25
26
22
25
2.00
96894479--96894581
29
3.6
28
81
5
116
21
16
33
29
1.95
96899093--96899709
79
7.9
78
82
4
686
28
27
22
21
1.99
96899126--96899709
236
2.5
236
89
2
845
28
27
22
21
1.99
96899093--96899709
39
15.7
39
83
3
684
28
27
22
21
1.99
96913626--96913726
38
2.6
38
88
3
139
22
24
26
25
2.00
96913642--96913749
38
2.8
38
88
0
117
20
24
27
27
1.99
96916282--96916491
48
4.4
48
78
5
203
30
17
26
26
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
96916282--96916491
96
2.2
96
87
3
307
30
17
26
26
1.97
96924759--96924888
40
3.2
40
84
4
174
23
29
24
22
1.99
96926781--96926890
40
2.8
40
85
0
148
26
23
26
23
2.00
96926781--96926930
40
3.8
39
80
7
133
26
22
26
24
2.00
96928354--96928529
48
3.7
48
81
5
230
26
16
29
27
1.97
96931023--96931055
14
2.5
13
90
9
50
69
12
6
12
1.35
96938945--96939116
93
1.8
93
92
0
290
27
28
22
21
1.99
96938938--96939113
46
3.8
46
76
12
189
28
28
22
21
1.99
96946490--96946660
93
1.8
92
93
1
297
27
29
21
21
1.98
96946483--96946657
46
3.8
46
77
13
198
28
29
21
20
1.98
96946531--96946669
47
3.0
46
74
16
135
28
28
20
22
1.98
96957872--96958029
40
4.0
41
84
8
184
25
20
26
26
1.99
96957876--96958057
80
2.3
80
80
13
205
26
20
26
26
1.99
96957876--96958057
40
4.6
40
83
7
178
26
20
26
26
1.99
96957906--96958090
80
2.3
80
78
14
188
28
21
24
24
1.99
96963719--96963824
47
2.2
47
89
1
158
34
26
13
25
1.93
96963717--96963932
54
4.1
53
77
13
162
33
26
13
26
1.94
96963771--96963932
54
3.0
53
83
8
188
32
27
14
25
1.95
96968526--96968570
21
2.1
21
95
0
81
33
31
0
35
1.58
96970883--96970961
27
2.9
27
86
3
106
37
20
13
27
1.91
96971106--96971358
127
2.0
127
85
0
344
20
21
22
35
1.96
96977256--96977324
28
2.5
28
88
6
97
27
14
27
30
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
96977256--96977334
28
2.9
27
85
9
81
27
15
25
31
1.95
96979211--96979313
29
3.6
29
90
0
152
24
33
15
27
1.95
96987274--96987376
29
3.6
29
90
0
152
24
33
15
27
1.95
96993667--96993841
45
3.8
46
79
13
207
29
30
20
20
1.97
96993674--96993844
93
1.8
92
94
1
306
28
30
21
20
1.98
96996086--96996128
21
2.1
21
86
4
61
25
2
23
48
1.62
96997732--96997813
34
2.4
34
85
0
110
25
29
20
24
1.99
97004466--97004583
29
4.1
28
79
8
114
26
29
14
29
1.95
97007387--97007559
46
3.7
46
79
10
208
21
20
27
29
1.98
97007384--97007554
93
1.8
93
93
0
297
21
21
28
28
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770