Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          769   770   

This is table  630  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
197579811--197579918
44
2.5
43
80
4
128
33
25
17
24
1.96
197585483--197585549
30
2.2
30
84
5
82
11
22
1
64
1.35
197585500--197585555
18
3.1
18
76
5
51
7
19
3
69
1.27
197585525--197585549
12
2.1
12
100
0
50
8
16
0
76
1.02
197585552--197585582
12
2.6
12
94
0
53
29
12
12
45
1.80
197601217--197601414
71
2.8
70
92
3
294
33
17
28
20
1.95
197601283--197601400
41
3.1
41
60
28
98
32
17
28
21
1.96
197601251--197601414
71
2.3
71
100
0
328
35
17
28
18
1.94
197608784--197608981
71
2.8
70
92
3
294
33
17
28
20
1.95
197608850--197608967
41
3.1
41
60
28
98
32
17
28
21
1.96
197608818--197608981
71
2.3
71
100
0
328
35
17
28
18
1.94
197611362--197611403
14
2.9
15
79
13
52
40
2
19
38
1.64
197611540--197611694
43
3.7
42
74
15
151
25
17
27
29
1.97
197611541--197611677
43
3.2
42
83
6
152
27
17
26
29
1.98
197613753--197613820
27
2.6
27
76
2
66
22
17
29
30
1.97
197622314--197622437
37
3.3
37
95
3
214
25
32
20
21
1.98
197622506--197622803
49
6.1
49
97
0
533
29
27
9
33
1.89
197626854--197627237
40
9.8
40
94
3
645
26
27
20
25
1.99
197626854--197627237
79
4.9
79
92
3
641
26
27
20
25
1.99
197626838--197627237
119
3.4
119
91
3
648
26
27
20
25
1.99
197626838--197627237
159
2.5
158
92
2
655
26
27
20
25
1.99
197629051--197629137
37
2.3
36
94
5
147
26
33
19
20
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
197629206--197629358
49
3.1
49
94
0
270
30
26
9
33
1.88
197634089--197634123
17
2.1
16
89
5
52
31
17
0
51
1.45
197634986--197635059
29
2.6
29
95
0
139
27
31
14
27
1.95
197634927--197635059
58
2.3
58
80
2
133
24
33
17
24
1.96
197642850--197642923
29
2.6
29
95
0
139
27
31
14
27
1.95
197642791--197642923
58
2.3
58
80
2
133
24
33
17
24
1.96
197653928--197653979
27
2.0
26
84
3
68
34
21
26
17
1.95
197659877--197660036
37
4.3
38
86
3
207
21
20
25
33
1.97
197659875--197660036
75
2.2
75
85
2
218
22
19
24
33
1.97
197660029--197660226
43
4.6
43
91
1
308
12
25
30
31
1.93
197661465--197661513
17
2.8
18
74
22
50
24
18
22
34
1.96
197662332--197662498
40
4.2
40
79
6
169
25
21
27
25
1.99
197670498--197670628
30
4.5
30
86
8
171
32
13
25
28
1.94
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28
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197676080--197676210
30
4.5
30
86
8
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32
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25
28
1.94
197676080--197676210
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2.2
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1.94
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2.6
165
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22
23
29
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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197693077--197693174
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2.1
31
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22
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1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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197757935--197758076
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1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
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T
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(0-2)
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24
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2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
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Score
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4.2
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2
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25
27
21
25
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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