Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  655  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
205812212--205812260
17
2.8
18
74
22
50
24
18
22
34
1.96
205813080--205813245
40
4.2
39
77
9
158
25
21
27
24
1.99
205820207--205820255
17
2.8
18
74
22
50
24
18
22
34
1.96
205821076--205821240
39
4.2
38
77
11
154
26
21
27
24
2.00
205821076--205821224
78
1.9
78
84
5
203
26
22
27
24
2.00
205825255--205825469
40
5.5
40
92
3
325
24
23
28
24
2.00
205833221--205833438
40
5.5
40
89
3
273
23
23
27
25
2.00
205836028--205836090
26
2.3
27
78
8
74
36
23
11
28
1.89
205836200--205836309
27
4.1
27
95
0
193
18
23
23
34
1.96
205839432--205839578
40
3.7
40
90
3
244
24
27
22
25
2.00
205839432--205839578
78
1.9
80
91
2
244
24
27
22
25
2.00
205843977--205844144
40
4.2
40
80
3
196
25
22
27
25
2.00
205848488--205848532
20
2.2
20
100
0
90
55
13
13
17
1.69
205852254--205852421
40
4.2
40
80
3
196
25
22
27
25
2.00
205858948--205859026
29
2.7
29
86
0
86
22
32
16
27
1.96
205866801--205866872
29
2.5
29
84
2
92
22
33
16
27
1.95
205875302--205875602
47
6.3
48
93
3
457
30
7
31
29
1.86
205875302--205875602
96
3.2
96
92
0
480
30
7
31
29
1.86
205877459--205877527
28
2.5
28
95
2
122
18
10
27
43
1.82
205878832--205878869
20
1.9
20
88
0
58
52
10
2
34
1.50
205884523--205884591
28
2.5
28
95
2
122
18
10
27
43
1.82
205887495--205887595
28
3.5
30
82
6
118
29
14
26
28
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
205887524--205887599
29
2.7
28
76
13
75
30
14
26
28
1.95
205895374--205895474
28
3.5
30
82
6
118
29
14
26
28
1.95
205895403--205895478
29
2.7
28
76
13
75
30
14
26
28
1.95
205906286--205906434
80
1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
205906327--205906434
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
205910472--205910529
29
2.0
29
100
0
116
24
24
20
31
1.98
205914242--205914390
80
1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
205914283--205914390
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
205922190--205922283
40
2.3
40
83
0
116
27
23
25
23
2.00
205930262--205930373
40
2.8
39
84
8
129
25
23
27
23
2.00
205937150--205937325
46
3.8
46
80
12
225
21
21
28
28
1.98
205937147--205937317
93
1.8
93
96
0
315
21
21
29
28
1.98
205940274--205940342
15
4.6
15
83
0
84
11
17
13
57
1.64
205940265--205940352
30
3.0
30
81
8
99
10
17
15
56
1.66
205942722--205942897
46
3.8
46
80
12
225
21
21
28
28
1.98
205942719--205942889
93
1.8
93
96
0
315
21
21
29
28
1.98
205945844--205945912
15
4.6
15
83
0
84
11
17
13
57
1.64
205945835--205945922
30
3.0
30
81
8
99
10
17
15
56
1.66
205949813--205949979
40
4.2
40
78
6
160
25
22
27
24
2.00
205956943--205956991
17
2.8
18
74
22
50
24
18
22
34
1.96
205957812--205957978
40
4.2
40
78
6
160
25
22
27
24
2.00
205959628--205959891
48
5.6
48
85
5
342
27
26
18
26
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
205964000--205964136
29
4.7
29
79
8
127
27
29
14
28
1.95
205964001--205964135
60
2.3
58
82
5
155
27
30
14
27
1.95
205971778--205971961
40
4.6
39
75
6
138
26
23
27
22
2.00
205971818--205972006
80
2.4
81
77
4
186
23
24
29
22
1.99
205980994--205981153
29
5.5
29
82
4
171
25
30
16
26
1.97
205983431--205983533
41
2.5
41
84
6
127
20
33
29
17
1.95
205990945--205991151
40
5.2
39
82
2
209
25
26
22
26
2.00
205990945--205991150
79
2.6
80
82
4
238
25
26
22
25
2.00
205995945--205996111
40
4.2
40
82
2
185
24
26
22
26
2.00
206003926--206004092
40
4.2
40
82
2
185
24
26
22
26
2.00
206004911--206004956
17
2.5
19
74
22
53
34
23
17
23
1.96
206006283--206006311
14
2.1
14
93
6
51
34
0
10
55
1.34
206007028--206007112
31
2.7
31
87
1
98
14
8
20
57
1.62
206007047--206007112
31
2.1
31
94
0
114
15
10
22
51
1.73
206010942--206010982
21
1.9
22
85
5
57
63
0
17
19
1.31
206012051--206012189
24
5.8
24
95
0
251
20
18
25
34
1.96
206012054--206012211
48
3.3
48
85
7
214
22
18
25
32
1.97
206012050--206012211
72
2.2
72
91
2
254
23
18
24
33
1.97
206019830--206019968
24
5.8
24
95
0
251
20
17
26
35
1.95
206019833--206019990
48
3.3
48
85
7
214
22
18
25
33
1.96
206019829--206019990
72
2.2
72
89
2
236
22
17
25
33
1.96
206022319--206022350
14
2.3
14
94
0
55
46
9
21
21
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
206024729--206024761
15
2.2
15
100
0
66
66
0
27
6
1.15
206027546--206027634
26
3.3
25
72
15
88
47
2
0
50
1.13
206027527--206027597
38
1.9
37
86
8
101
50
1
2
45
1.25
206027790--206027872
16
5.2
16
76
5
87
27
30
3
38
1.74
206027790--206027872
32
2.6
31
81
7
103
27
30
3
38
1.74
206028271--206028318
22
2.2
22
92
0
78
41
0
2
56
1.11
206029596--206029634
19
2.1
19
85
4
53
53
5
15
25
1.62
206031440--206031554
41
2.8
41
90
0
167
22
23
6
46
1.76
206033784--206033827
22
2.0
23
86
13
65
56
0
6
36
1.26
206033908--206033948
4
10.2
4
83
0
55
46
2
4
46
1.37
206033908--206033948
6
6.8
6
85
0
55
46
2
4
46
1.37
206034114--206034165
20
2.5
21
87
6
79
53
7
0
38
1.30
206034991--206035026
14
2.5
15
95
4
65
16
5
13
63
1.47
206034990--206035028
15
2.6
16
84
16
64
15
5
15
64
1.46
206034988--206035063
32
2.4
32
82
8
93
11
6
18
63
1.49
206034990--206035057
15
4.5
15
72
24
63
13
5
19
61
1.51
206035463--206035568
35
3.0
35
92
0
185
22
11
49
16
1.78
206036275--206036420
53
2.9
50
82
10
190
34
19
16
29
1.94
206036274--206036420
48
3.0
48
82
10
188
34
19
16
29
1.94
206036477--206037063
70
8.2
70
91
6
953
31
19
15
32
1.94
206036477--206037063
147
4.1
140
91
5
953
31
19
15
32
1.94
206036477--206037062
217
2.7
216
96
2
1062
31
19
15
32
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
206039976--206040017
19
2.2
20
95
4
77
21
7
30
40
1.80
206043525--206043669
40
3.6
40
85
4
202
26
25
25
22
2.00
206044677--206044769
30
3.1
31
93
4
163
23
22
15
38
1.92
206044961--206045102
24
6.0
24
91
5
209
26
22
22
28
1.99
206044961--206045101
47
3.0
48
90
6
207
26
22
22
28
1.99
206044960--206045102
71
2.0
71
89
5
218
25
22
22
29
1.99
206045153--206045212
20
3.0
20
95
0
111
33
20
10
36
1.86
206045153--206045207
11
5.4
11
70
16
55
30
20
10
38
1.87
206045255--206045302
25
1.9
25
86
0
69
25
16
25
33
1.96
206052804--206052897
31
3.1
31
95
3
172
23
21
15
39
1.92
206053089--206053207
24
5.0
24
89
5
170
26
22
21
28
1.99
206053089--206053207
47
2.5
48
89
5
170
26
22
21
28
1.99
206053258--206053317
20
3.0
20
95
0
111
33
20
10
36
1.86
206053258--206053312
11
5.4
11
70
16
55
30
20
10
38
1.87
206053360--206053407
25
1.9
25
86
0
69
25
16
25
33
1.96
206062628--206062772
40
3.6
40
86
4
202
25
25
26
22
2.00
206079304--206079485
78
2.3
81
86
6
257
25
27
22
24
2.00
206079302--206079485
40
4.7
40
86
8
252
25
27
22
24
2.00
206082961--206082995
18
1.9
19
88
11
56
57
22
14
5
1.59
206083460--206083489
13
2.3
13
94
0
51
23
23
33
20
1.97
206087223--206087299
24
3.2
25
80
8
90
15
25
18
40
1.90
206089157--206089366
40
5.2
40
88
2
305
21
28
24
25
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
206097293--206097502
40
5.2
40
88
2
305
21
28
24
25
1.99
206100726--206100840
39
3.0
40
88
5
173
23
18
27
30
1.97
206103880--206104021
39
3.6
39
80
2
151
27
21
25
26
1.99
206103874--206104049
77
2.2
81
81
7
209
26
23
25
24
2.00
206111895--206112075
40
4.5
40
80
4
186
27
24
24
23
2.00
206111897--206112047
80
1.9
81
86
4
216
26
23
25
24
2.00
206111897--206112071
80
2.2
81
82
3
210
26
25
24
24
2.00
206111931--206112115
80
2.3
80
77
6
178
29
24
23
22
1.99
206119485--206119674
29
6.6
29
88
0
227
27
14
32
25
1.95
206120161--206120269
29
3.8
29
98
0
209
25
14
32
27
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770