Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  427  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
131692156--131692215
20
3.0
20
90
0
102
33
20
11
35
1.88
131692258--131692305
25
1.9
25
86
0
69
25
16
25
33
1.96
131693544--131693862
27
11.8
27
84
4
185
39
7
22
30
1.82
131693544--131693835
54
5.4
54
86
4
340
40
7
22
29
1.81
131693542--131693835
81
3.6
81
83
5
344
40
7
22
29
1.81
131693842--131693906
27
2.4
27
89
0
103
32
12
18
36
1.88
131693885--131694063
27
6.7
27
90
0
261
30
6
20
41
1.78
131693831--131694062
81
2.9
80
84
5
272
30
7
21
40
1.81
131693831--131694081
54
4.7
54
84
2
247
31
7
20
40
1.81
131693913--131694080
27
6.3
26
86
2
165
31
6
19
42
1.77
131695157--131695468
38
8.1
38
80
6
333
24
21
23
30
1.99
131695157--131695468
78
4.1
76
82
6
360
24
21
23
30
1.99
131695158--131695474
116
2.7
116
89
2
485
23
21
23
30
1.99
131695466--131695547
43
1.9
43
87
5
121
13
24
32
29
1.93
131695840--131695951
45
2.5
45
81
9
131
25
20
25
29
1.99
131705807--131705913
26
4.4
24
86
6
128
30
23
17
28
1.97
131705807--131705913
51
2.2
46
83
9
124
30
23
17
28
1.97
131705963--131706037
20
3.8
20
86
6
93
33
17
10
38
1.84
131708737--131708806
27
2.6
27
88
2
95
27
25
15
31
1.96
131709312--131709342
2
15.5
2
100
0
62
51
0
0
48
1.00
131712816--131712845
15
2.0
15
93
0
51
36
23
20
20
1.95
131715330--131715795
27
17.3
27
85
3
589
27
22
10
40
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
131715800--131715995
27
7.3
27
84
0
239
36
18
19
25
1.94
131716194--131716276
27
3.1
26
86
5
103
19
21
20
38
1.93
131716587--131716660
27
2.8
25
84
10
85
17
24
21
36
1.95
131716778--131716879
6
16.8
6
74
17
86
21
15
13
49
1.79
131716778--131716879
30
3.4
30
86
6
152
21
15
13
49
1.79
131721043--131721329
47
6.1
47
90
0
441
32
11
29
26
1.91
131721070--131721145
23
3.2
25
62
24
63
28
13
34
23
1.92
131721043--131721329
140
2.0
141
95
0
513
32
11
29
26
1.91
131721064--131721334
93
2.9
92
89
4
400
33
12
28
26
1.92
131721534--131721676
37
3.9
37
91
2
227
23
18
33
25
1.96
131721534--131721674
73
1.9
73
91
2
230
23
18
34
24
1.96
131723005--131723289
27
10.6
27
81
5
326
27
21
9
40
1.85
131723008--131723289
134
2.1
135
84
6
367
28
21
9
40
1.85
131723354--131723546
27
7.3
27
83
5
223
36
19
20
24
1.95
131723365--131723520
79
1.9
82
85
3
219
35
20
19
23
1.96
131723747--131723793
25
1.9
24
91
4
76
21
25
21
31
1.98
131723910--131723968
22
2.7
22
81
0
64
20
25
22
32
1.98
131724132--131724205
27
2.8
27
85
6
89
17
24
21
36
1.95
131724320--131724420
6
16.8
6
76
19
95
20
16
12
49
1.79
131724320--131724420
30
3.4
30
87
8
152
20
16
12
49
1.79
131724320--131724441
30
4.1
29
78
11
122
20
17
13
49
1.79
131724456--131724516
32
1.9
32
86
6
88
21
18
29
31
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
131730433--131730642
40
5.2
40
87
2
305
25
24
28
21
1.99
131736556--131736682
47
2.7
47
91
0
209
24
17
27
30
1.97
131746913--131746949
2
18.5
2
100
0
74
48
0
0
51
1.00
131752702--131752883
40
4.6
40
81
8
185
24
20
28
26
1.99
131752752--131752906
79
2.0
79
81
7
181
25
19
27
27
1.99
131758858--131758912
18
2.9
18
81
5
56
49
7
27
16
1.72
131760483--131760718
33
6.9
33
69
10
125
30
17
26
25
1.98
131763381--131763771
47
8.3
47
94
0
620
33
8
29
27
1.87
131763889--131763971
37
2.2
37
89
0
121
25
21
32
20
1.98
131765450--131765681
40
5.8
40
96
0
401
25
20
27
26
1.99
131768258--131768475
40
5.4
40
83
3
251
26
22
26
24
2.00
131768257--131768475
79
2.7
79
82
3
260
26
22
26
25
2.00
131768258--131768475
119
1.8
120
85
3
305
26
22
26
24
2.00
131772390--131772827
47
9.3
47
95
0
732
33
8
29
28
1.87
131772677--131772752
22
3.3
22
66
16
64
34
11
30
23
1.91
131772945--131773026
37
2.2
37
86
2
112
24
20
32
21
1.98
131774249--131774273
10
2.5
10
100
0
50
20
8
20
52
1.71
131775389--131775460
27
2.7
27
97
0
135
44
26
6
22
1.78
131775444--131775666
27
8.3
27
82
0
239
37
19
17
26
1.93
131775389--131775594
54
3.8
54
82
3
157
40
21
13
23
1.89
131775415--131775666
81
3.1
80
83
4
276
38
19
16
25
1.92
131776385--131776444
27
2.3
27
85
2
77
20
23
20
36
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
131779682--131779859
40
4.5
40
80
4
175
23
25
22
28
1.99
131786965--131786999
16
2.1
18
89
10
56
28
17
0
54
1.43
131787853--131787926
29
2.6
29
95
0
139
27
31
14
27
1.95
131795680--131795782
29
3.6
29
89
0
143
24
33
16
26
1.96
131810340--131810551
40
5.3
39
79
7
203
25
21
26
26
1.99
131831010--131831073
31
2.1
30
85
2
83
25
23
14
37
1.92
131831282--131831379
25
3.9
25
85
5
119
30
20
23
25
1.98
131831436--131831482
20
2.3
20
92
7
78
34
19
10
36
1.86
131832147--131832271
27
4.7
26
89
4
135
28
4
22
44
1.73
131832175--131832313
54
2.6
54
79
7
140
29
9
21
39
1.85
131832148--131832304
27
5.8
27
82
3
122
28
8
21
41
1.83
131832293--131832352
27
2.3
27
82
2
68
40
6
20
33
1.78
131832308--131832501
27
7.2
27
81
2
194
41
7
21
29
1.80
131832202--131832351
80
1.9
81
80
4
178
32
10
21
36
1.87
131832307--131832497
80
2.4
80
87
0
265
42
7
20
29
1.80
131832346--131832497
81
1.9
80
91
1
250
42
8
19
30
1.81
131852348--131852494
39
3.8
37
81
10
138
27
23
26
23
2.00
131858423--131858552
40
3.2
40
82
4
165
23
28
24
23
2.00
131858423--131858586
40
4.1
40
78
4
145
21
28
25
25
1.99
131861728--131861829
29
3.5
29
94
0
168
27
14
30
27
1.95
131861724--131861858
58
2.3
58
83
3
166
26
14
31
26
1.95
131861920--131861952
2
16.5
2
100
0
66
48
0
0
51
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
131865904--131865937
18
2.0
16
88
11
50
70
5
2
20
1.21
131869813--131869918
29
3.7
29
84
1
133
27
33
13
26
1.93
131870578--131870607
15
2.0
15
100
0
60
53
13
20
13
1.72
131870737--131870839
52
2.0
51
84
5
136
46
9
23
20
1.80
131871380--131871415
16
2.2
17
90
5
56
16
5
25
52
1.65
131879687--131879737
25
2.0
25
92
0
84
41
11
15
31
1.83
131879833--131879868
16
2.2
16
95
0
63
55
19
5
19
1.62
131881313--131881523
44
4.7
43
76
9
158
31
16
25
27
1.97
131890568--131890737
41
4.2
40
74
18
161
27
27
22
22
1.99
131898578--131898747
41
4.2
40
74
18
161
27
27
22
22
1.99
131904132--131904330
39
5.1
39
85
5
231
25
32
20
22
1.98
131904170--131904319
78
1.9
79
93
1
257
24
32
20
24
1.98
131913405--131913591
40
4.7
40
91
2
279
23
21
29
25
1.99
131913401--131913611
80
2.7
79
87
1
307
23
21
28
26
1.99
131915033--131915091
27
2.2
26
84
3
73
22
23
18
35
1.96
131920973--131921047
24
3.1
24
98
0
141
18
16
28
37
1.92
131920973--131921068
48
2.0
48
85
4
131
21
16
26
35
1.95
131928747--131928821
24
3.1
24
98
0
141
18
16
28
37
1.92
131928747--131928842
48
2.0
48
85
4
131
21
16
26
35
1.95
131932860--131932911
27
2.0
26
84
3
68
17
23
21
38
1.93
131935481--131935509
14
2.0
15
93
6
51
27
0
20
51
1.47
131936651--131936790
55
2.5
56
88
1
219
26
13
26
33
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
131936652--131936815
56
2.9
55
79
7
181
26
14
28
31
1.94
131941707--131941767
30
2.0
30
83
0
77
31
22
8
37
1.84
131945971--131946020
20
2.5
20
76
3
64
14
4
14
68
1.36
131950380--131950449
27
2.5
28
86
2
97
32
25
14
27
1.94
131950457--131950563
42
2.5
42
95
0
187
22
34
14
28
1.94
131957607--131957676
27
2.5
28
86
2
97
32
25
14
27
1.94
131957684--131957790
42
2.5
42
96
0
196
22
33
14
28
1.94
131964786--131964853
27
2.6
27
83
4
86
30
25
14
29
1.95
131965008--131965047
16
2.4
17
87
4
55
40
25
0
35
1.56
131971932--131972098
40
4.2
40
82
2
185
25
27
21
25
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770